終止コドン非依存的翻訳終結の分子機構

• 研究課題/領域番号: 24570008
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 遺伝・ゲノム動態
• 研究機関: 岡山大学
• 研究代表者: 阿保 達彦 岡山大学, 自然科学研究科, 准教授 (90303601)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円); 2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2012年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
• キーワード: ArfA / リボソーム / 翻訳 / 大腸菌 / バクテリア / RF2 / mRNA / リボソームレスキュー / ArfB / 翻訳終結

研究成果の概要

大腸菌リボソーム解放因子ArfAによるリボソームの解放に，クラスI終結因子RF2が必須であることを明らかにした。また，ArfAの一時構造上，特徴的にリシン残基が多く見られる領域の正荷電がArfAのリボソームとの結合，リボソームの解放に重要であることを示した。さらに，ラジカルプロービング法によりArfAとリボソームとの結合様式を明らかにし，ArfAによるリボソーム解放の分子機構の解明の端緒とした。

研究成果

• [雑誌論文] ArfA recognizes the lack of mRNA in the mRNA channel after RF2 binding for ribosome rescue. (2014)
  • 著者名/発表者名: Daisuke Kurita, Yuhei Chadani, Tatsuhiko Abo, Hyouta Himeno
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 42 号: 21 ページ: 13339-13352
  • DOI: 10.1093/nar/gku1069
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Ribosome rescue systems in bacteria. Biochimie (2014)
  • 著者名/発表者名: Himeno, H., Nameki, N., Kurita, D., Muto, A. & Abo T.
  • 雑誌名: Biochimie 巻: pii: S0300-9084(14) ページ: 00355-1
  • DOI: 10.1016/j.biochi.2014.11.014
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The fail-safe system to rescue the stalled ribosomes in Escherichia coli. (2014)
  • 著者名/発表者名: Tatsuhiko Abo, Yuhei Chadani
  • 雑誌名: Front. Microbiol 巻: 5 ページ: 1-7
  • DOI: 10.3389/fmicb.2014.00156
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] ArfA recruits release factor 2 to rescue stalled ribosomes by peptidyl-tRNA hydrolysis in Escherichia coli. (2012)
  • 著者名/発表者名: Chadani y Ito K, Kutsukake K, Abo T.
  • 雑誌名: Molecular Microbiology 巻: 86 号: 1 ページ: 37-50
  • DOI: 10.1111/j.1365-2958.2012.08190.x
  • 査読あり
• [学会発表] 大腸菌ArfAタンパク質アミノ酸置換変異体とリボソームとの相互作用 (2015)
  • 著者名/発表者名: 阿保達彦
  • 学会等名: 第３回リボソームミーティング
  • 発表場所: 宮崎市
  • 年月日: 2015-03-17 – 2015-03-18
• [学会発表] 大腸菌リボソーム解放因子ArfAアミノ酸置換変異体の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 森木省伍，花房賢，天野剛志，廣明秀一，阿保達彦
  • 学会等名: 日本遺伝学会第86回大会
  • 発表場所: 長浜市
  • 年月日: 2014-09-17 – 2014-09-19
• [学会発表] 大腸菌ArfAタンパク質のリボソーム結合能 (2014)
  • 著者名/発表者名: 阿保 達彦、茶谷 悠平、柴谷知宏、大川成美
  • 学会等名: 第16回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 名古屋市
  • 年月日: 2014-07-23 – 2014-07-24
• [学会発表] 変異導入による大腸菌ArfAタンパク質の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 阿保達彦，岸本真幸，茶谷悠平，Pajak Aleksandra
  • 学会等名: 第15回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 愛媛県松山市
• [学会発表] 大腸菌ArfAによるリボソームレスキュー (2013)
  • 著者名/発表者名: 阿保達彦，茶谷悠平，沓掛和弘
  • 学会等名: 日本遺伝学会第85回大会
  • 発表場所: 神奈川県横浜市
• [学会発表] RF2 is required for ArfA-dependent ribosome rescue in E. coli (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuhei Chadani, Koreaki Ito, Kazuhiro Kutsukake and Tatsuhiko Abo
  • 学会等名: 2nd Molecular Microbiology Meeting Würzburg
  • 発表場所: Würzburg, Germany
  • 招待講演
• [学会発表] 大腸菌で見出された新規リボソーム解放機構とその生理学的意義 (2012)
  • 著者名/発表者名: 茶谷悠平，伊藤維昭，沓掛和弘，阿保達彦
  • 学会等名: 第9回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: 長浜市
• [学会発表] Nascentome：合成途上鎖の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊藤維昭，茶谷悠平，中森健太，千葉志信，秋山芳展，阿保達彦
  • 学会等名: 第9回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: 長浜市
• [学会発表] 大腸菌合成致死スクリーニングによるリボソーム解放因子ArfAの単離 (2012)
  • 著者名/発表者名: 阿保達彦，沓掛和弘，茶谷悠平，小野勝彦
  • 学会等名: 第9回21世紀大腸菌研究会
  • 発表場所: 長浜市
• [学会発表] アラニンスキャニングによる大腸菌ArfAの機能構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 岸本真幸，茶谷悠平，森川淳基，阿保達彦
  • 学会等名: 日本遺伝学会第８４回大会
  • 発表場所: 福岡市
• [学会発表] ArfA-mediated ribosome rescue in Escherichia coli (2012)
  • 著者名/発表者名: Yuhei Chadani, Katsuhiko Ono, Emi Matsumoto, Masayuki Kishimoto, Kosuke Nishioka, Kazuya Nishigaki, Yuma Oka, Junki Morikawa and *Tatsuhiko Abo
  • 学会等名: Symposium on Interdisciplinary Researches in Okayama
  • 発表場所: Okayama