ＧＥＴ複合体による膜挿入機構の構造基盤

• 研究課題/領域番号: 24570126
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 山形 敦史 東京大学, 放射光連携研究機構, 助教 (20463903)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 5,460千円 (直接経費: 4,200千円、間接経費: 1,260千円); 2014年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2013年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: 結晶構造解析 / テイルアンカー型タンパク質 / 膜タンパク質 / 構造生物学 / X線結晶解析 / TA タンパク質 / X線結晶構造解析

研究成果の概要

C末端に一回膜貫通ヘリックスを持つテイルアンカー型タンパク質 (TA) は標的因子 Get3 によって小胞体膜に挿入される。Get3 は TA タンパク質を捕まえた後、膜タンパク質 Get1, Get2 と相互作用して小胞体膜に局在する。本申請では、Get3 と Get1 の膜外ドメインとの複合体の結晶構造解析を行った。また、Get3-TA の結晶構造解析を目指して、Get3-TA 複合体の調整を行った。このとき変異体 Get3 を用いることにより Get3 ２量体に TA が１分子が結合した複合体を調整できた。さらに、Get1, Get2 についても、昆虫細胞発現系を用いての精製に成功した。

研究成果

• [雑誌論文] Structures of CYLD USP with Met1- or Lys63-linked diubiquitin reveal mechanisms for dual specificity (2015)
  • 著者名/発表者名: Sato, Y., Goto, E., Shibata, Y., Kubota, Y., Yamagata, A., Goto-Ito, S., Kubota, K., Inoue, J., Takekawa, M., Tokunaga, F. and Fukai, S.
  • 雑誌名: Nat. Struct. Mol. Biol. 巻: 22 号: 3 ページ: 222-229
  • DOI: 10.1038/nsmb.2970
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Switching and emergence of CTL epitopes in HIV-1 infection (2014)
  • 著者名/発表者名: Han, C., Kawana-Tachikawa, A., Shimizu, A., Zhu D., Nakamura, H., Adachi, E., Kikuchi, T., Koga, M., Koibuchi, T., Gao, G.F., Sato, Y., Yamagata, A., Martin, E., Fukai, S., Brumme, Z.L.,Iwamoto, A.
  • 雑誌名: Retrovirolgy 巻: 11 号: 1 ページ: 38-38
  • DOI: 10.1186/1742-4690-11-38
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Switching and emergence of CTL epitopes in HIV-1 infection (2014)
  • 著者名/発表者名: Han C, Kawana-Tachikawa A, Shimizu A, Zhu D, Nakamura H, Adachi E, Kikuchi T, Koga M, Koibuchi T, Gao GF, Sato Y, Yamagata A, Martin E, Fukai S, Brumme ZL, Iwamoto A
  • 雑誌名: Retrovirology 巻: ?
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structure of TCR and antigen complexes at an immunodominant CTL epitope in HIV-1 infection (2013)
  • 著者名/発表者名: Shimizu, A., Kawana-Tachikawa. A., Yamagata, A., Han, C., Zhu, D., Sato, Y., Nakamura, H., Koibuchi, T., Carlson, J., Martin, E., Brumme, C.J., Shi, Y., Gao, G.F., Brumme, Z.L., Fukai, S., Iwamoto, A.
  • 雑誌名: Scientific Reports 巻: 3 号: 1 ページ: 3097-3097
  • DOI: 10.1038/srep03097
  • 査読あり
• [雑誌論文] Get1 stabilizes an open dimer conformation of get3 ATPase by binding two distinct interfaces. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kubota K, Yamagata A, Sato Y, Goto-Ito S, Fukai S.
  • 雑誌名: J Mol Biol. 巻: 422(3) 号: 3 ページ: 366-75
  • DOI: 10.1016/j.jmb.2012.05.045
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular basis of Lys-63-linked polyubiquitination inhibition by the interaction between human deubiquitinating enzyme OTUB1 and ubiquitin-conjugating enzyme UBC13. (2012)
  • 著者名/発表者名: Sato Y, Yamagata A, Goto-Ito S, Kubota K, Miyamoto R, Nakada S, Fukai S.
  • 雑誌名: J Biol Chem. 巻: 287(31) 号: 31 ページ: 25860-8
  • DOI: 10.1074/jbc.m112.364752
  • 査読あり
• [学会発表] Bat3 の新規ドメインの構造解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 山形敦史、佐藤裕介、伊藤（後藤）桜子、深井周也
  • 学会等名: 日本結晶学会年会
  • 発表場所: 東京大学弥生講堂（東京都・文京区）
  • 年月日: 2014-11-01 – 2014-11-03
• [学会発表] Structural basis for the post translational membrane insertion by Get3 (2013)
  • 著者名/発表者名: 山形 敦史
  • 学会等名: International conference on structural genomics
  • 発表場所: 札幌
• [学会発表] Structural Basis for the posttranslational membrane insertion by Get3 (2012)
  • 著者名/発表者名: 山形 敦史
  • 学会等名: 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
• [備考] 東京大学放射光連携研究機構生命科学部門
  • URL: http://www.iam.u-tokyo.ac.jp/srro/SRROLifeSciDivJp2/Welcome.html
• [備考] 東京大学放射光連携研究機構生命科学部門
  • URL: http://www.iam.u-tokyo.ac.jp/srro/SRROLifeSciDivJp2/Welcome.html
• [備考] 東京大学放射光連携研究機構生命科学部門
  • URL: http://www.iam.u-tokyo.ac.jp/srro/SRROLifeSciDivJp2/Welcome.html