植物ゲノムに存在する非レトロウイルス様配列の挿入メカニズムと病理学的意義

• 研究課題/領域番号: 24580064
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 植物病理学
• 研究機関: 岡山大学
• 研究代表者: 近藤 秀樹 岡山大学, 資源植物科学研究所, 准教授 (40263628)
• 研究分担者: 鈴木 信弘 岡山大学, 資源生物科学研究所, 教授 (70206514)
• 研究協力者: 丸山 和之 岡山大学, 資源植物科学研究所, 技術職員 (20379811)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円); 2014年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2012年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
• キーワード: 非レトロRNAウイルス / ゲノム / 感染記録 / うどんこ病菌 / 化石配列 / ダラースポット病菌 / 系統進化 / モノネガウイルス / ウイルス化石 / ベニウイルス

研究成果の概要

近年，哺乳動物などの核ゲノムに非レトロRNAウイルス様配列(NRVS)が発見され，それらは古のウイルス感染記録と考えられている. 本研究では，植物，菌類，昆虫の核ゲノムで新規NRVSを探索し，配列解析を行った．その結果，プラス鎖RNAウイルスであるベニウイルスの感染記録を植物(ヒヨコマメ)と昆虫(サシガメ)の核ゲノムに見出した．加えて，菌類ではじめてとなるマイナス鎖RNAウイルスの感染記録をうどんこ病菌核ゲノムに発見した．これらの成果はRNAウイルスの起源や進化を考える上で興味深い情報を提供する．さらに，本研究ではこれらのNRSVの挿入メカニズムと生物学的な存在意義について議論を加えた．

研究成果

• [雑誌論文] Transcriptional mapping of the messenger and leader RNAs of orchid fleck virus, a bisegmented negative-strand RNA virus. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kondo, H., Maruyama, K., Chiba, S., Andika, I. B., Tamada, T. and Suzuki, N.
  • 雑誌名: Virology 巻: 452-453 ページ: 166-174
  • DOI: 10.1016/j.virol.2014.01.007
  • 査読あり
• [雑誌論文] Discovery of negative-strand RNA virus infection in fungi. (2014)
  • 著者名/発表者名: Kondo, H., Chiba, S. and Suzuki, N.
  • 雑誌名: Proc. Symp. 9th Int. Working Group on Plant Viruses with Fungal Vectors 巻: 1 ページ: 55-57
• [雑誌論文] Characterazation of burdock mottle virus, a novel member of the genus Benyvirus, and the presence of benyvirus-related sequences in the plant and insect genomes. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kondo, H. , Hirano, S., Chiba, S., Andika, I.B., Hirai, M., Maeda, T. and Tamada, T.
  • 雑誌名: Virus Research 巻: 177 号: 1 ページ: 75-86
  • DOI: 10.1016/j.virusres.2013.07.015
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evidence for the infection of fungi by of negative-strand RNA viruses (Essential Collection, Editors’ Selection 2013). (2013)
  • 著者名/発表者名: Kondo, H., Chiba, S., Toyoda, K. and Suzuki, N.
  • 雑誌名: Virology 巻: 435 号: 2 ページ: 201-209
  • DOI: 10.1016/j.virol.2012.10.002
  • 査読あり
• [雑誌論文] 分節型ゲノムを持つラブドウイルス (2013)
  • 著者名/発表者名: 近藤秀樹
  • 雑誌名: ウイルス 巻: 63 ページ: 143-154
  • NAID: 130004713420
• [雑誌論文] Nyamiviridae: Proposal for a new family in the order Mononegavirales (2013)
  • 著者名/発表者名: Kuhn, J.H., Bekal, S., Caì, Y., Clawson, A.N., Domier, L.L., Herrel, M., Jahrling, P.B., Kondo, H., Lambert, K.N., Mihindukulasuriya, K.A., Nowotny, N., Radoshitzky, S.R., Schneider, U., Staeheli, P., Suzuki, N., Tesh, R.B., Wang, D, Wang, L-F., and Dietzgen, R.G.
  • 雑誌名: Archives of Virology 巻: 158 号: 10 ページ: 2209-2226
  • DOI: 10.1007/s00705-013-1674-y
  • 査読あり
• [雑誌論文] Orchid fleck virus structural protein, N and P, form intranuclear viroplasm-like structures in the absence of viral infection (2013)
  • 著者名/発表者名: Kondo, H., Chiba, S., Andika, I.B., Maruyama, K., Tamada T. and Suzuki, N.
  • 雑誌名: Journal of Virology 巻: 87 号: 13 ページ: 7423-7434
  • DOI: 10.1128/jvi.00270-13
  • 査読あり
• [雑誌論文] Viruses of the white root rot fungus, Rosellinia necatrix. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kondo, H., Kanematsu, S. and Suzuki, N.
  • 雑誌名: Advances in Virus Research 巻: 86 ページ: 177-214
  • DOI: 10.1016/b978-0-12-394315-6.00007-6
  • ISBN: 9780123943156
  • 査読あり
• [雑誌論文] Create 1 new species in the genus Benyvirus and assign the genus to the new family Benyviridae. (2013)
  • 著者名/発表者名: Gilmer, D., Ratti, C., Tamada, T., Andika, I.B. and Kondo, H.
  • 雑誌名: ICTV Taxonomy Proposal (TaxoProp) 巻: Plant ページ: 9-9
• [雑誌論文] Effects of defective-interfering RNA on symptom induction and replication of a novel partitivirus from a phytopathogenic fungus Rosellinia necatrix. (2013)
  • 著者名/発表者名: Chiba, S., Lin, Y-H., *Kondo, H., Kanematsu, S., and Suzuki, N.
  • 雑誌名: Journal of Virology 巻: 87 号: 4 ページ: 2330-2341
  • DOI: 10.1128/jvi.02835-12
  • 査読あり
• [雑誌論文] The cysteine-rich proteins of beet necrotic yellow vein virus and tobacco rattle virus contribute to efficient suppression of silencing in roots (2012)
  • 著者名/発表者名: Andika, I.B., *Kondo, H., Nishiguchi, M. and Tamada, T.
  • 雑誌名: Journal of General Virology 巻: 93 号: 8 ページ: 1841-1850
  • DOI: 10.1099/vir.0.043513-0
  • 査読あり
• [学会発表] Deep sequencing解析により明らかになったBotrytis tulipae の９種ウイルスによる混合感染 (2015)
  • 著者名/発表者名: 近藤秀樹・久野 昌・林 諭昕・千葉壮太郎・鈴木信弘
  • 学会等名: 平成27年度日本植物病理学会大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-03-28 – 2015-03-31
• [学会発表] 近藤 秀樹・千葉 壮太郎・鈴木 信弘. 菌類に感染するマイナス鎖RNAウイルス (2014)
  • 著者名/発表者名: 近藤 秀樹・千葉 壮太郎・鈴木 信弘
  • 学会等名: 29回中国四国ウイルス研究会
  • 発表場所: 山口
  • 年月日: 2014-06-28 – 2014-06-29
• [学会発表] 2分節マイナス鎖RNAウイルスであるランえそ斑紋ウイルス(OFV)のmRNAおよびleader RNAの特性 (2014)
  • 著者名/発表者名: 近藤秀樹・丸山和之・千葉壮太郎・鈴木信弘
  • 学会等名: 平成26年度日本植物病理学会大会
  • 発表場所: 札幌
  • 年月日: 2014-06-02 – 2014-06-04
• [学会発表] 植物ゲノム上のRNA感染記録から紐解くウイルス-宿主相互作用 (2013)
  • 著者名/発表者名: 近藤秀樹
  • 学会等名: 第30回資源植物科学シンポジウム及び第6回植物ストレス科学研究シンポジウム
  • 発表場所: 倉敷市芸文館
  • 招待講演
• [学会発表] Discovery of negative-strand RNA virus infection in fungi (2013)
  • 著者名/発表者名: Kondo, H., Chiba, S. and Suzuki, N.
  • 学会等名: 9th Int. Working Group on Plant Viruses with Fungal Vectors
  • 発表場所: Obihiro
• [学会発表] 植物および昆虫の核ゲノム上に見いだされたベニウイルス様配列 (2013)
  • 著者名/発表者名: 近藤秀樹・千葉壮太郎・鈴木信弘
  • 学会等名: 平成25年度日本植物病理学会関西部会
  • 発表場所: 岡山大学
• [学会発表] 新規ベニウイルス・burdock mottle virus(BdMoV)の配列解析とベニウイルス類似配列の植物・昆虫ゲノム上での発見 (2013)
  • 著者名/発表者名: 近藤秀樹・千葉壮太郞・Ida Bagus Andika・鈴木信弘・玉田哲男
  • 学会等名: 第61回日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 神戸国際会議場
• [学会発表] マイナス鎖RNAウイルスの菌類への感染の可能性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 近藤秀樹・千葉壮太郎・豊田和弘・鈴木信弘
  • 学会等名: 平成25年度日本植物病理学会大会
  • 発表場所: 岐阜大学
• [学会発表] マイナス鎖RNAウイルスの菌類への感染の可能性 (2012)
  • 著者名/発表者名: 近藤秀樹・千葉壮太郎・鈴木信弘
  • 学会等名: 第60回日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 大阪国際会議場
• [学会発表] Evolutionary history of the family Partitiviridae: insight from the viewpoint of paleovirology. (2012)
  • 著者名/発表者名: Chiba, S., Kondo, H., Kanematsu, S., Suzuki, N.
  • 学会等名: The American Society for Virology, 31st Annual Meeting (ASV)
  • 発表場所: Wisconsin, USA
• [図書] Detection and analysis for non-retroviral RNA virus-like elements in plant, fungal and insect genomes. in Plant Virology Protocols (Methods in Molecular Biology 1236, Springer Protocol): New approaches to detect viruses and host responses. eds, Uyeda, I and Masuta C. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kondo, H., Chiba, S. and Suzuki, N.
  • 出版者: Humana Press Inc.
• [備考] 岡山大学資源植物科学研究所 植物・微生物相互作用グループ
  • URL: http://www.rib.okayama-u.ac.jp/pmi/index-j.html
• [備考] 岡山大学資源植物科学研究所 植物・微生物相互作用グループ
  • URL: http://www.rib.okayama-u.ac.jp/pmi/index-j.html