大腸菌１６ＳｒＲＮＡメチル化酵素「ＲｓｍＧ」の反応促進因子の解明

• 研究課題/領域番号: 24580131
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 応用微生物学
• 研究機関: 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構
• 研究代表者: 岡本 晋 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 食品総合研究所食品バイオテクノロジー研究領域, 上席研究員 (80353986)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 5,590千円 (直接経費: 4,300千円、間接経費: 1,290千円); 2014年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円); 2013年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: RNA / 塩基修飾 / メチル化酵素 / 塩基就職 / 微生物

研究成果の概要

全ての真正細菌において見られる16S rRNAの7-メチルグアノシン修飾は、メチル化酵素RsmGによって触媒される。大腸菌においてはRsmGによるメチル化が未知の因子(タンパク質)により著しく促進をされることを見いだしている。本研究では、大腸菌のメチル化促進因子を遺伝生化学的手法により同定することを目指した。
メチル化促進因子の精製を試みたが、精製過程における失活が著しく、電気泳動上で特定のバンドとして確認できるレベルの精製を達成することが困難であった。一方、遺伝学的手法により、RsmGと相互作用する因子の探索を行い、候補として機能不明の遺伝子であるtasを同定した。

研究成果

• [雑誌論文] Extensive amplification of GI-VII-6, a multidrug resistance genomic island of Salmonella enterica serovar Typhimurium, increases resistance to extended-spectrum cephalosporins. (2015)
  • 著者名/発表者名: Lee K, Kusumoto M, Sekizuka T, Kuroda M, Uchida I, Iwata T, Okamoto S, Yabe K, Inaoka T, Akiba M
  • 雑誌名: Front Microbiol 巻: 6 ページ: 78-78
  • DOI: 10.3389/fmicb.2015.00078
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Biosynthetic conclusions from the functional dissection of oxygenases fro biosynthesis of actinorhodin and related Streptomyces antibiotics (2013)
  • 著者名/発表者名: Takaaki Taguchi, Masaki Yabe, Hitomi Odaki, Miki Shinozaki, Mikko Metsa-Ketela, Takao Arai, Susumu Okamoto, Koji Ichinose
  • 雑誌名: Chemistry & Biology 巻: 20 号: 4 ページ: 510-520
  • DOI: 10.1016/j.chembiol.2013.03.007
  • 査読あり
• [学会発表] E. coli acid resistance: Regulation by a tRNA modification (2013)
  • 著者名/発表者名: 岡本 晋
  • 学会等名: 天然資源の開発利用に関する日米会議 (UJNR) 食品・農業部会
  • 発表場所: つくば国際会議場（茨城県）
  • 招待講演