| 研究課題/領域番号 |
24580291
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| 研究種目 |
基盤研究(C)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 応募区分 | 一般 |
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| 研究分野 |
水産学一般
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| 研究機関 | 独立行政法人水産総合研究センター |
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研究代表者 |
松山 知正 独立行政法人水産総合研究センター, 増養殖研究所, 研究員 (20372021)
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| 研究分担者 |
中易 千早 水産総合研究センター, 本部, コーディネーター (00311225)
安池 元重 水産総合研究センター, 中央水産研究所, 研究員 (20604820)
藤原 篤志 水産総合研究センター, 中央水産研究所, グループ長 (30443352)
高野 倫一 水産総合研究センター, 増養殖研究所, 研究員 (40533998)
中村 洋路 水産総合研究センター, 中央水産研究所, 研究員 (90463182)
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| 研究期間 (年度) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2014年度)
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| 配分額 *注記 |
5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2014年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2013年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2012年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
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| キーワード | 赤変病 / メタゲノム / アコヤガイ / アコヤガイ赤変病 |
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| 研究成果の概要 |
ショットガンメタゲノム解析と、マイクロアレイによるスクリーニングを組み合わせ、アコヤガイ赤変病の原因微生物の特定を試みた。
病貝および健常貝の血リンパ液の超遠心沈渣より抽出したDNAを解読し、病貝の配列から健常貝と共通する配列を差し引き、76,542配列を得た。相同性検索を行ったところ、大部分は真正細菌に相同性を示し、ウイルスに相同な配列は稀であった。得られた配列を元にDNAマイクロアレイを作成し、病貝２個体と健常貝２個体をスクリーニングしたところ、病貝に共通して検出され健常貝では検出されない配列は1890配列まで絞りこまれた。これらの細菌群に病原体由来の配列が含まれると考えている。
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