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MSサイレントな翻訳後修飾の解析基盤構築

研究課題

研究課題/領域番号 24590044
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 物理系薬学
研究機関東北大学

研究代表者

後藤 貴章  東北大学, 薬学研究科(研究院), 講師 (40344684)

研究分担者 大江 知行  東北大学, 大学院薬学研究科, 教授 (10203712)
李 宣和  東北大学, 大学院薬学研究科, 助教 (60519776)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2014年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2013年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2012年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
キーワード分析科学 / 生体分子 / タンパク質 / 質量分析 / 翻訳後修飾 / プロテオーム
研究成果の概要

質量分析法では識別できない翻訳語修飾としてタンパク質中のアミノ酸異性化の解析手法を検討した。従来のプロテオミクス手法に加え、新たに各種修飾体を含む対象タンパク質の包括的抽出法、正負両イオンの相補的解析による全配列相当ペプチド群の検出手法を確立し、液体クロマトグラフィー/高分解能質量分析法と組み合わせることにより、異性化を含めた非酵素的翻訳後修飾の網羅的解析に応用可能な手法を構築した。

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて 2014 2013 2012

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (14件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Mass spectrometric characterizations of protein carbonylation: Comparison between three different conditions, oxidation by CuII/ascorbic acid, adduction of methyl glyoxal, and adduction of 4-hydroxy-2(E)-nonenal2014

    • 著者名/発表者名
      Kazuki Maeda, Hiroyuki Funatsu, Yuki Miyazawa, Yasushi Misawa, Takaaki Goto, Seon Hwa Lee and Tomoyuki Oe
    • 雑誌名

      International Journal of Mass Spectrometry

      巻: 373 ページ: 72-80

    • DOI

      10.1016/j.ijms.2014.09.012

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Predicted multiple selected reaction monitoring to screen activated drug-mediated modifications on human serum albumin.2014

    • 著者名/発表者名
      Fumio Osaki, Takaaki Goto, Seon Hwa Lee and Tomoyuki Oe
    • 雑誌名

      Analytical Biochemistry

      巻: 449 ページ: 59-67

    • DOI

      10.1016/j.ab.2013.12.016

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete amino acid sequencing and immunoaffinity clean-up can facilitate screening of various chemical modifications on human serum albumin.2013

    • 著者名/発表者名
      Takaaki Goto, Kazuyuki Murata, Seon Hwa Lee and Tomoyuki Oe
    • 雑誌名

      Analytical and Bioanalytical Chemistry

      巻: 405 号: 23 ページ: 7383-7395

    • DOI

      10.1007/s00216-013-7146-0

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Aldehyde stress-mediated novel modification of proteins: epimerization of the N-terminal amino acid.2013

    • 著者名/発表者名
      Ryo Kajita, Takaaki Goto, Seon Hwa Lee and Tomoyuki Oe
    • 雑誌名

      Chemical Research in Toxicology

      巻: 26 号: 12 ページ: 1926-1936

    • DOI

      10.1021/tx400354d

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Can Edman degradation be used for quantification? Isotope-dilution liquid chromatography-electrospray ionization tandem mass spectrometry and the long-term stability of 20 phenylthiohydantoin-amino acids2013

    • 著者名/発表者名
      Satoh, R., Goto, T., Lee, S.H., Oe, T.
    • 雑誌名

      Anal. Bioanal. Chem

      巻: (in press) 号: 25 ページ: 8001-8010

    • DOI

      10.1007/s00216-013-6901-6

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 血清アルブミン上の網羅的化学修飾解析を指向したLC/MSによる手法の開発2014

    • 著者名/発表者名
      工藤裕太、李宣和、後藤貴章、大江知行
    • 学会等名
      第53回日本薬学会東北支部大会
    • 発表場所
      いわき
    • 年月日
      2014-10-05
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 血清アルブミンの化学修飾オミクス研究:新規バイオマーカー開発に向けて2014

    • 著者名/発表者名
      後藤貴章
    • 学会等名
      平成26年度日本薬学会東北支部 第3回 物理・分析系若手研究者セミナー
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2014-09-20
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Simultaneous mass spectrometric analysis of various chemical modifications on human serum albumin: strategies for clean-up, sequence coverage, and identification2014

    • 著者名/発表者名
      Takaaki Goto, Yuta Kudo, Kazuyuki Murata, Seon Hwa Lee and Tomoyuki Oe
    • 学会等名
      62nd ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics
    • 発表場所
      Baltimore, USA
    • 年月日
      2014-06-15 – 2014-06-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 血清アルブミン上の網羅的化学修飾解析を目的とした高分解能LC/MSによる修飾ペプチド検出法の検討2014

    • 著者名/発表者名
      後藤貴章、工藤裕太、李宣和、大江知行
    • 学会等名
      第74回分析化学討論会
    • 発表場所
      郡山
    • 年月日
      2014-05-24 – 2014-05-25
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] シッフ塩基形成を介した血清アルブミンN末端アミノ酸の光学反転2013

    • 著者名/発表者名
      梶田遼、後藤貴章、李宣和、大江知行
    • 学会等名
      平成25年度日本分析化学会東北支部若手交流会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 標品不要のタンパク質・ペプチド絶対定量法の開発: エドマン分解反応物の同位体希釈LC-ESI/MS/MS法2013

    • 著者名/発表者名
      佐藤涼、後藤貴章、李宣和、大江知行
    • 学会等名
      平成25年度日本分析化学会東北支部若手交流会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] アルデヒドによるN末端アミノ酸の異性化における反応性の検討2013

    • 著者名/発表者名
      東由佳、後藤貴章、李宣和、大江知行
    • 学会等名
      第52回日本薬学会東北支部大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Predicted Selected Reaction Monitoring を用いたヘモグロビン上の化学修飾スクリーニング法の開発2013

    • 著者名/発表者名
      小島弘貴、李宣和、後藤貴章、大江知行
    • 学会等名
      第52回日本薬学会東北支部大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] アルデヒドによるタンパク質N末端アミノ酸異性化の研究2013

    • 著者名/発表者名
      梶田遼、李宣和、後藤貴章、大江知行
    • 学会等名
      新アミノ酸分析研究会 第3回学術講演会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Mechanistic Study on Non-enzymatic Isomerization of N-terminal Amino Acids by Endogenous Aldehydes2012

    • 著者名/発表者名
      Ryo Kajita, Takaaki Goto, Seon Hwa Lee and Tomoyuki Oe
    • 学会等名
      19th International Mass Spectrometry Conferrence
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Isotope dilution LC-ESI/MS/MS method for the determination of phenylthiohydantoin (PTH)-amino acids derived from Edman degradation products of proteins2012

    • 著者名/発表者名
      Ryo Satoh, Takaaki Goto, Seon Hwa Lee and Tomoyuki Oe
    • 学会等名
      19th International Mass Spectrometry Conferrence
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Chemical modificomics ~Alternative analytical platform for efficient biomarker discovery~2012

    • 著者名/発表者名
      Tomoyuki Oe, Takaaki Goto, Shota Kojima, Shohei Shitamichi, Kazuyuki Murata, Kohei Miyamoto and Seon Hwa Lee
    • 学会等名
      19th International Mass Spectrometry Conferrence
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] N末端アミノ酸のpyridoxal 5'-phosphateに対する反応性と非酵素的異性化2012

    • 著者名/発表者名
      梶田遼、東由佳、後藤貴章、李宣和、大江知行
    • 学会等名
      第25回バイオメディカル分析科学シンポジウム
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] タンパク質のエドマン分解反応物: PTH-アミノ酸を用いた同位体希釈LC/MS法の構築2012

    • 著者名/発表者名
      佐藤涼、後藤貴章、李宣和、大江知行
    • 学会等名
      新アミノ酸分析研究会 第二回学術講演会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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