• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

らい菌の比較ゲノム解析

研究課題

研究課題/領域番号 24590544
研究種目

基盤研究(C)

配分区分基金
応募区分一般
研究分野 細菌学(含真菌学)
研究機関国立感染症研究所

研究代表者

甲斐 雅規  国立感染症研究所, その他部局等, 室長 (10291147)

連携研究者 黒田 誠  国立感染症研究所, 病原体ゲノム解析研究センター, センター長 (80317411)
関塚 剛史  国立感染症研究所, 病原体ゲノム解析研究センター, 主任研究官 (40462775)
研究協力者 中田 登  
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2014年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2013年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2012年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワードハンセン病 / らい菌 / ゲノム / 少菌型 / 多菌型 / SNPs / genotyping
研究成果の概要

ハンセン病はらい菌による感染症で、多菌型と少菌型の2病型がある。研究目的は、病型を分ける菌側要因の探索であり、次の研究及び成果を得た。(1)日本の本州で分離された多菌型患者由来らい菌のゲノムシーケンスを決定しデータバンク登録されているインド及びブラジル由来のらい菌と比較解析を行い、日本由来株に特徴的な情報を得た。(2)日本株に特徴的だったSNPsを多数の保存らい菌分離株について調べた結果、日本の本州および韓国で分離されたらい菌には同様のSNPsパターンがあることを発見した。(3)少菌型患者由来菌は極端に少なく、次世代シーケンサーにて一定の結果を得たが、期間内に探索を終了するに至らなかった。

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2015 2014 2013 2012

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 謝辞記載あり 1件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (7件)

  • [雑誌論文] Hp-rPCR法を用いたらい菌薬剤耐性変異の検出2014

    • 著者名/発表者名
      甲斐雅規
    • 雑誌名

      日本ハンセン病学会雑誌

      巻: 83 ページ: 6-13

    • NAID

      130005169033

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Genome-wide re-sequencing of multidrug-resistant Mycobacterium leprae Airaku-32014

    • 著者名/発表者名
      Singh P, Benjak A, Carat S, Kai M, Busso P, Avanzi C, Paniz-Mondolfi A, Peter C, Harshman K, Rougemont J, Matsuoka M, Cole ST
    • 雑誌名

      Clin Microbiol Infect

      巻: 20 号: 10 ページ: 0619-0622

    • DOI

      10.1111/1469-0691.12609

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete genome sequence and comparative genomic analysis of Mycobacterium massiliense JCM 15300 in the Mycobacterium abscessus group reveal a conserved genomic island MmGI-1 related to putative lipid metabolism2014

    • 著者名/発表者名
      Sekizuka T, Kai M, Nakanaga K, Nakata N, Kazumi Y, Maeda S, Makino M, Hoshino Y, Kuroda M
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 9 号: 12 ページ: e114848-e114848

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0114848

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Chaacteristic mutations found in the ML0411 gene of Mycobacterium leprae isolated in Northeast Asian countries2013

    • 著者名/発表者名
      M. Kai, N. Nakata, M. Matsuoka, T. Sekizuka, M. Kuroda, M. Makino
    • 雑誌名

      Infection, Genetics and Evolution

      巻: 19 ページ: 200-204

    • DOI

      10.1016/j.meegid.2013.07.014

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Analysis of M. leprae strains from Japan: new trends in phylogeography2015

    • 著者名/発表者名
      Avanzi C, Benjak A, Singh P, Busso P, Matsuoka M, Kai M, Cole S
    • 学会等名
      25th European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases
    • 発表場所
      Copenhagen, Denmark
    • 年月日
      2015-04-25 – 2015-04-28
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 日本で分離されたらい菌Kyoto-2の特徴的なゲノタイプ2015

    • 著者名/発表者名
      甲斐雅規、中田 登、関塚剛史、黒田 誠、牧野正彦
    • 学会等名
      第88回日本細菌学会総会
    • 発表場所
      長良川国際会議場
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] らい菌Kyoto-2株の増殖能への関与が疑われる遺伝子の解析2014

    • 著者名/発表者名
      甲斐雅規、中田 登、松岡正典、牧野正彦
    • 学会等名
      第87回日本ハンセン病学会総会・学術大会
    • 発表場所
      所沢市民文化センター
    • 年月日
      2014-09-29 – 2014-09-30
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Comparison of genome sequences between Mycobacterium leprae prepared before and after passaging in nude mice footpad2014

    • 著者名/発表者名
      M. Kai, T. Sekizuka, A. A. Maghanoy, M. F. Balagon, P. Saunderson, M. Makino, M. Kuroda
    • 学会等名
      XVIII International Symposium on Gnotobiology
    • 発表場所
      St-Petersburg, Russian Federation
    • 年月日
      2014-09-21 – 2014-09-24
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Characteristic SNPs in Mycobacterium leprae isolated in Japan2013

    • 著者名/発表者名
      M. Kai, N. Nakata, G.T. Chae, P. Saunderson, A.A. Maghanoy. M.F. Balagon, M. Matsuoka, T. Sekizuka, M. Kuroda, M. Makino
    • 学会等名
      18th International Leprosy Congress
    • 発表場所
      Brussels, Belgium
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] Characteristic SNPs in Mycobacterium leprae isolated in Japan2013

    • 著者名/発表者名
      甲斐雅規
    • 学会等名
      第18回国際ハンセン病学会
    • 発表場所
      Management Center Europe (Belgium)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] らい菌Kyoto-2株の全ゲノムシーケンスにより同定されたSNPsの解析2012

    • 著者名/発表者名
      甲斐雅規
    • 学会等名
      日本ハンセン病学会
    • 発表場所
      北海道大学学術交流会館(北海道)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi