研究課題/領域番号 |
24592641
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研究種目 |
基盤研究(C)
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配分区分 | 基金 |
応募区分 | 一般 |
研究分野 |
眼科学
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研究機関 | 埼玉医科大学 |
研究代表者 |
森 圭介 埼玉医科大学, 医学部, 教授 (90251090)
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研究期間 (年度) |
2012-04-01 – 2014-03-31
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研究課題ステータス |
中途終了 (2012年度)
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配分額 *注記 |
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2014年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2013年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
2012年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
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キーワード | 加齢黄斑変性 / 個別化医療 / 生活環境因子 / 遺伝子多型 / 一塩基多型 / 発症リスク |
研究概要 |
平成25年度に実施した研究成果は大きく分けて、1) サンプル収集、2) 臨床データ収集と解析、3) 遺伝子解析の三つに分けられる。 1)、2) サンプル収集と臨床データ 埼玉医科大学倫理委員会の承認の下、文書にて同意を得られたAMD罹患者および非罹患者より採血を行い、ゲノムDNA精製を行った。これに加え、生活環境因子(年齢、性別、身長・体重 (BMI)、喫煙歴(pack/year)、心疾患、糖尿病、高血圧等)の聴取も行った。サンプル数は累計1400を超え、目標まであと100サンプルまでになっている。 3)遺伝子解析 ゲノムデータベース情報(Database of Genomic Variants、dbGaPデータベースの米国Age-Related Eye Disease StudyなどのAMDのGWAS情報)および申請者グループが独自に行ってきたGWASデータ(「加齢黄斑変性症の発症リスクの予測方法」特願2007-194922)を活用し、AMD関連SNPのうち特に疾患感受性の高い遺伝子を選出した。これに加え、ソウル大学医学部のソ・ジョンソン教授グループによる東アジア人遺伝子コピー数多型データ [Park et al., Nat Genet, 2010] などのCopy number variation (CNV)データベースをもとに、AMD関連SNP近傍の候補CNV領域を選定し、AMD罹患性との相関性の高い遺伝子をリストアップした。これらの遺伝子について、現時点までに得られているサンプルについてリストアップしたSNPおよびCNVの解析を継続している。
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