• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

癌上皮間葉転換における癌アトラクターの解明

研究課題

研究課題/領域番号 24650154
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 生体生命情報学
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

田中 博  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (60155158)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2014年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2013年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2012年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワード上皮間葉転換 / 遺伝子ネットワーク / がん転移 / 臨界状態 / 幹細胞状態 / 遺伝子発現プロファイル / Waddington地形 / ARACNe / 生体生命情報学 / システム生物学 / 癌アトラクター
研究成果の概要

がん転移の機序である上皮間葉転換(EMT)の理解を目指して、細胞のすべての発現パターンを包摂した「細胞状態空間」上で上皮細胞と間葉細胞の各細胞状態の安定性を表す準ポテンシャル分布を計算し、がんのEMT過程の軌跡を求めた。
その結果、EMTは上皮細胞のpotential basinから直接に間葉細胞 basinに移動するのではなく、一旦、安定な中間状態(臨界的状態あるいは幹細胞状態と思われる)を経て間葉細胞に移行することが分かった(EMTの3段階論)。また、EMT過程の遺伝子発現プロファイルから推定した遺伝子ネットワークの構造変化から、遺伝子ネットワーク上でも3段階に変化することを確認した。

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて 2014 2013 2012

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (2件) (うち招待講演 1件)

  • [雑誌論文] PARVB overexpression increases cell migration capability and defines high risk for endophytic growth and metastasis in tongue squamous cell carcinome2014

    • 著者名/発表者名
      Eslami A., Miyagushi K.,Mogushi K., Watanabe H., Okada N., Shibuya H., Mizushima H., Miura M., Tanaka H.
    • 雑誌名

      British Journal of Cancer

      巻: 1 号: 2 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1038/bjc.2014.590

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 細胞の分化・誘導に関わる発現ポテンシャル解析2013

    • 著者名/発表者名
      荻島創一, 田中博
    • 学会等名
      次世代シーケンス現場の会第3回大会
    • 発表場所
      神戸国際会議場
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] "Expression trajectories" of reprogramming and differentiation on expression potential field.2012

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Miyamoto, Soichi Ogishima, Jun Nakaya, Hiroshi Tanaka
    • 学会等名
      生命医薬情報学連合大会
    • 発表場所
      タワーホール船堀
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi