疾患モデルの責任遺伝子の迅速同定を可能にする ラットゲノム解析ツールの体系的構築

• 研究課題/領域番号: 24650238
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 実験動物学
• 研究機関: 徳島大学
• 研究代表者: 井本 逸勢 (橘 逸勢 / 井本 逸勢(橘逸勢)) 徳島大学, 大学院・へルスバイオサイエンス研究部, 教授 (30258610)
• 連携研究者: 田嶋 敦 徳島大学, 大学院・へルスバイオサイエンス研究部, 准教授 (10396864)
• 研究期間 (年度): 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2012年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
• キーワード: リサーチバイオリソース / ラット疾患モデル動物 / エクソーム / 次世代シーケンサー / 責任遺伝子変異 / ゲノム情報 / 連鎖解析 / ラット / 疾患モデル動物

研究概要

有用な疾患モデル動物であるラットの形質責任遺伝子を効率よく同定し表現型形成の分子基盤を解明するシステムを作製するため、自作のラットエクソーム解析系をより多くのエクソンを簡便に解析可能な系に改訂した。さらに多系統のラット遺伝子多型情報を収集し、新規の次世代シーケンサー解析パイプラインを構築した。これらを連鎖解析と組み合わせて体系的ラットゲノム解析システムを整備し、実際の変異モデルラットで表現型責任変異遺伝子候補選択までを検証できた。

研究成果

• [雑誌論文] Esophageal Squamous Cell Carcinoma Developed 11 Years After Allogeneic Bone Marrow Transplantation for Acute Lymphatic Leukemia. (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyawaki Y, Inazawa J, et al.
  • 雑誌名: Jpn J Clin Oncol. 巻: 43 号: 1 ページ: 69-73
  • DOI: 10.1093/jjco/hys184
  • 査読あり
• [雑誌論文] DNA methylation signatures of peripheral leukocytes in schizophrenia (2013)
  • 著者名/発表者名: Kinoshita M, Numata S, Tajima A, Shimodera S, Ono S, Imamura A, Iga JI, Watanabe S, Kikuchi K, Kubo H, Nakataki M, Sumitani S, Imoto I, Okazaki Y, Ohmori T
  • 雑誌名: Neuromolecular Med 巻: 15(1) 号: 1 ページ: 95-101
  • DOI: 10.1007/s12017-012-8198-6
  • 査読あり
• [雑誌論文] SIX1 promotes epithelial-mesenchymal transition in colorectal cancer through ZEB1 activation (2012)
  • 著者名/発表者名: Ono H, Imoto I, Kozaki K, Tsuda H, Matsui T, Kurasawa Y, Muramatsu T, Sugihara K, Inazawa J
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 31 号: 47 ページ: 4923-4934
  • DOI: 10.1038/onc.2011.646
  • 査読あり
• [雑誌論文] Integrative array-based approach identifies MZB1 as a frequently methylated putative tumor suppressor in hepatocellular carcinoma (2012)
  • 著者名/発表者名: Matsumura S, Imoto I, Kozaki K, Matsui T, Muramatsu T, Furuta M, Tanaka S, Sakamoto M, Arii S, Inazawa J
  • 雑誌名: Clin Cancer Res 巻: 18 号: 13 ページ: 3541-51
  • DOI: 10.1158/1078-0432.ccr-11-1007
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic copy-number alterations of MYC and FHIT genes are associated with survival in esophageal squamous-cell carcinoma. (2012)
  • 著者名/発表者名: Miyawaki Y, Inazawa J, et al.
  • 雑誌名: Cancer Sci. 巻: 103 号: 8 ページ: 1558-1566
  • DOI: 10.1111/j.1349-7006.2012.02329.x
  • 査読あり
• [雑誌論文] The incidence of hypoplasia of the corpus callosum in patients with dup (X)(q28) involving MECP2 is associated with the location of distal breakpoints. (2012)
  • 著者名/発表者名: Honda S, et al.
  • 雑誌名: Am J Med Genet 巻: 158A 号: 6 ページ: 1292-1303
  • DOI: 10.1002/ajmg.a.35321
  • 査読あり
• [雑誌論文] Meta-analysis of association studies between DISC1 missense variants and schizophrenia in Japanese population. (2012)
  • 著者名/発表者名: Kinoshita M, et al
  • 雑誌名: Schizophr Res, 巻: 141(2-3): 号: 2-3 ページ: 271-273
  • DOI: 10.1016/j.schres.2012.07.020
  • 査読あり
• [雑誌論文] Stabilization of phenotypic plasticity through mesenchymal-specific DNA hypermethylation in cancer cells (2011)
  • 著者名/発表者名: Kurasawa Y
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 12.31(15) 号: 15 ページ: 1963-74
  • DOI: 10.1038/onc.2011.373
  • 査読あり
• [学会発表] Genetic variations in primary breast cancer and its metastatic tumor. (2012)
  • 著者名/発表者名: Hosoda F, et al.
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: ロイトン札幌(札幌市)
  • 年月日: 2012-09-21
• [学会発表] A tumor-suppressive microRNA cluster targets multiple cell cycle regulators in hepatocellular carcinoma. (2012)
  • 著者名/発表者名: Furuta M,et al.
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: さっぽろ芸文館(札幌市)
  • 年月日: 2012-09-20
• [学会発表] Genomic copy-number alterations of MYC and FHIT genes are associated with survival in esophageal squamous-cell carcinoma (2012)
  • 著者名/発表者名: Miyawaki Y, et al
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 札幌市教育文化会館(札幌市)
  • 年月日: 2012-09-20
• [学会発表] Copy number alterations in urothelial carcinomas: Their clinicopathological correlation with DNA methylation. (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishiyama N, et al
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: ロイトン札幌(札幌市)
  • 年月日: 2012-09-20
• [学会発表] A tumor-suppressive microRNA cluster targets multiple cell cycle regulators in hepatocellular carcinoma. (2012)
  • 著者名/発表者名: Furuta M, et al.
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: さっぽろ芸文館（北海道）
• [学会発表] Genomic copy-number alterations of MYC and FHIT genes are associated with survival in esophageal squamous-cell carcinoma. (2012)
  • 著者名/発表者名: Miyawaki Y, et al.
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 札幌教育文化会館（北海道）
• [学会発表] Copy number alterations in urothelial carcinomas: Their clinicopathological correlation with DNA methylation. (2012)
  • 著者名/発表者名: Nishiyama N, et al.
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: ロイトン札幌（北海道）
• [学会発表] Genetic variations in primary breast cancer and its metastatic tumor. (2012)
  • 著者名/発表者名: Hosoda F, et al.
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: ロイトン札幌（北海道）
• [備考] 徳島大学・大学院へルスバイオサイエンス研究部・人類遺伝学
  • URL: http://www.tokushima-u.ac.jp/med/culture/jinruiiden/
• [備考] 徳島大学医学部人類遺伝学分野
  • URL: http://www.tokushima-u.ac.jp/med/culture/jinruiiden/