ヒドロキシメチルシトシンの塩基単位での同定法の確立

研究課題

研究課題/領域番号	24651210
研究種目	挑戦的萌芽研究
配分区分	補助金
研究分野	ゲノム生物学
研究機関	東京医科歯科大学
研究代表者	幸田尚東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 准教授 (60211893)
研究期間 (年度)	2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス	完了 (2013年度)
配分額 *注記	4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円) 2013年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円) 2012年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード	エピゲノム / ヒドロキシメチルシトシン
研究概要	哺乳類ゲノムのエピジェネティックな調節においてDNAのメチル化は重要な役割を果たしている。最近、メチルシトシンがヒドロキシメチルシトシンへ酸化される反応が存在することが示され、脱メチル化の中間産物として注目されている。そこでヒドロキシメチルシトシンの１塩基単位での解析法が重要であるが、これまで提案されてきた手法は十分なものではなかった。そこでDNMT1酵素を用いた単純な原理を用いて、比較的微量のDNAから１塩基単位でメチルシトシンとヒドロキシメチルシトシンを区別して解析する手法を考案し、実際に96%という高精度でヒドロキシメチルシトシンを同定することが可能であることを示した。