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メチル化模様を保持したDNA増幅技術の開発に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 24651214
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 ゲノム生物学
研究機関大阪大学

研究代表者

田嶋 正二  大阪大学, たんぱく質研究所, 教授 (50132931)

研究分担者 木村 博信  大阪大学, 蛋白質研究所, 助教 (60378891)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2013年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2012年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード生物工学 / DNAメチル化 / DNAメチル化酵素
研究概要

ヘミメチルDNAを好んでメチル化する維持DNAメチル化酵素のDnmt1を利用して、メチル化状態を保ったままゲノムを増幅する技術と、それをもとにして、ヒドロキシル化修飾を受けたメチルシトシンを一塩基レベルで解析する技術を開発することをめざした。その結果、シトシンのメチル化修飾とヒドロキシメチル化修飾を配列上で区別して解析する手法を開発することに成功した。

報告書

(3件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (28件)

すべて 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (20件) (うち招待講演 1件) 図書 (4件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] The DNA methyltransferase Dnmt1 directly interacts with the SET and RING finger-associated (SRA) domain of the multifunctional protein Uhrf1 to facilitate accession of the catalytic center to hemi-methylated DNA2014

    • 著者名/発表者名
      Berkyurek AC, Suetake I, Arita K, Takeshita K, Nakagawa A, Shirakawa M, Tajima S
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 289(1) 号: 1 ページ: 379-86

    • DOI

      10.1074/jbc.m113.523209

    • NAID

      120006770872

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Cell cycle-dependent turnover of 5-hydroxymethyl cytosine in mouse embryonic stem cells.2013

    • 著者名/発表者名
      Otani J, Kimura H, Sharif J, Endo TA, Mishima Y, Kawakami T, Koseki H, Shirakawa M, Suetake I, Tajima S
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 8 号: 12 ページ: e82961-e82961

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0082961

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 組換えDNMT1を利用したヒドロキシメチル化シトシンの1塩基レベルの新規解析方法の開発2014

    • 著者名/発表者名
      末武勲, 他
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京大学伊藤国際会館
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Dnmt1(RFTS)とUhrf1(SRA)の相互作用によりDNAは触媒中心に近づけるようになる2014

    • 著者名/発表者名
      アーメット・キャン・ベルキュレック, 他
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京大学伊藤国際会館
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] プロモーター領域でのヒドロキシメチルシトシンのメチルシトシンに対する相対位置は遺伝子発現と相関する2014

    • 著者名/発表者名
      木村博信, 他
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京大学伊藤国際会館
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 遺伝性知覚神経疾患の原因となるDnmt1のRFTS内の変異がDNA維持メチルに及ぼす影響2014

    • 著者名/発表者名
      ロナルドG.ガルビレス, 他
    • 学会等名
      第8回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      東京大学伊藤国際会館
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Relative positions of 5-hydroxymethylcytosine and 5-methylcytosine at promoter correlates with the level of gene expression2013

    • 著者名/発表者名
      Hironobu Kimura, et al.
    • 学会等名
      International Symposium on Transcription and metabolism
    • 発表場所
      Awaji Yumebutai International Conference Center, Hyogo, Japan
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Dnmt1のRFTSと触媒領域間の水素結合のDNAメチル化に果たす役割2013

    • 著者名/発表者名
      ロナルドG.ガルビレス, 他
    • 学会等名
      第7回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      奈良県新公会堂
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] DNA鎖長とNp95のSRA領域はDnmt1のRFTSを触媒ポケットから除去するステップに寄与する2013

    • 著者名/発表者名
      アーメット・キャン・ベルキュレック, 他
    • 学会等名
      第7回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      奈良県新公会堂
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] マウスES細胞におけるヒドロキシメチルシトシンの産生と消去2013

    • 著者名/発表者名
      木村博信, 他
    • 学会等名
      第7回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      奈良県新公会堂
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] ヘミメチル化DNAによるヌクレオソーム再構成とDnmt1によるメチル化2013

    • 著者名/発表者名
      岡翔太, 他
    • 学会等名
      第7回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      奈良県新公会堂
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] マウスES細胞におけるヒドロキシメチルシトシンの産生と消去2013

    • 著者名/発表者名
      木村博信、大谷淳二、川上 徹、白川昌宏、末武勲、田嶋正二
    • 学会等名
      第7回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      奈良県新公会堂
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Dnmt1のRFTSと触媒領域間の水素結合のDNAメチル化に果たす役割2013

    • 著者名/発表者名
      ロナルド G. ガルビレス、長谷川貴志、木村博信、ジャファル シャリフ、古関明彦、末武勲、田嶋正二
    • 学会等名
      第7回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      奈良県新公会堂
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] DNA鎖長とNp95のSRA領域はDnmt1のRFTSを触媒ポケットから除去するステップに寄与する2013

    • 著者名/発表者名
      アーメット・キャン・ベルキュレック、有田恭平、竹下浩平、中川敦史、白川昌宏、末武勲、田嶋正二
    • 学会等名
      第7回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      奈良県新公会堂
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ヘミメチル化DNAによるヌクレオソーム再構成とDnmt1によるメチル化2013

    • 著者名/発表者名
      岡翔太、ラウラ・ブルックナー、三島優一、末武勲、田嶋正二
    • 学会等名
      第7回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      奈良県新公会堂
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Relative positions of 5-hydroxymethylcytosine and 5-methylcytosine at promoter correlates with the level of gene expression2013

    • 著者名/発表者名
      Hironobu Kimura, Norie Tooi, Toru Kawakami, Tatsuhiro Thomoto, Kazuhiro Aiba, Isao Suetake, Norio Nakatsuji, Shoji Tajima
    • 学会等名
      International Symposium on Transcription and Metabolism
    • 発表場所
      Awaji Yumebutai International Conference Center, Hyogo, Japan
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Multi-step process of maintenance methylation2012

    • 著者名/発表者名
      Shoji Tajima
    • 学会等名
      FASEB Science Research Conference on Biological Methylation : From DNA and Histones to Disease
    • 発表場所
      The Westin Conference Center, Snowmass Village, Colorado, USA
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Dnmt1によるDNA維持メチル化活性は領域の大きな再配置を伴う反応である2012

    • 著者名/発表者名
      末武勲, 他
    • 学会等名
      第6回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      学術総合センター(東京)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Dnmt1によるDNA維持メチル化のin vivoにおける責任領域2012

    • 著者名/発表者名
      長谷川貴志, 他
    • 学会等名
      第6回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      学術総合センター(東京)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Dnmt1によるDNA維持メチル化活性は領域の大きな再配置を伴う反応である2012

    • 著者名/発表者名
      末武勲、中村達郎、Ahmet Can Berkyurek、竹下浩平、中川敦史、田嶋正二
    • 学会等名
      第6回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      学術総合センター(東京千代田区一ツ橋)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Dnmt1によるDNA維持メチル化のin vivoにおける責任領域2012

    • 著者名/発表者名
      長谷川貴志、木村博信、末武勲、武藤正弘、Jafar Sharif、古関明彦、田嶋正二
    • 学会等名
      第6回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      学術総合センター(東京千代田区一ツ橋)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Multi-step process of maintenance methylation2012

    • 著者名/発表者名
      Shoji Tajima
    • 学会等名
      FASEB Science Research Conference on Biological Methylation: From DNA and Histones to Disease
    • 発表場所
      The Westin Conference Center, Snowmass Village, Colorado, USA
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [図書] エピジェネティクス-その分子機構から高次生命機能まで-2013

    • 著者名/発表者名
      田嶋正二
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] エピジェネティクスキーワード事典-分子機構から疾患・解析技術まで-(牛島俊和、眞貝洋一編集)2013

    • 著者名/発表者名
      木村博信, 他(牛島俊和、眞貝洋一編集)
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] エピジェネティクスキーワード事典-分子機構から疾患・解析技術まで-(牛島俊和、眞貝洋一編集)2013

    • 著者名/発表者名
      木村博信、田嶋正二
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] エピジェネティクス-その分子機構から高次生命機能まで-(田嶋正二編集)2013

    • 著者名/発表者名
      田嶋正二
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考] 発表論文①のURL

    • URL

      http://www.protein.osaka-u.ac.jp/jpn/achievement/papers/the-dna-methyltransferase-dnmt.php

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考] 発表論文②のURL

    • URL

      http://www.protein.osaka-u.ac.jp/jpn/achievement/papers/cell-cycle-dependent-turnover-1.php

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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