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疾患感受性領域の検出に特化した核内染色体空間配置決定法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 24651221
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 ゲノム医科学
研究機関新潟大学

研究代表者

長谷川 舞衣  新潟大学, 脳研究所, 研究員 (50596153)

連携研究者 桑野 良三  新潟大学, 脳研究所, 教授 (20111734)
中谷 明弘  新潟大学, 超域学術院, 准教授 (60301149)
宮下 哲典  新潟大学, 脳研究所, 助教 (60323995)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2012年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード核内高次構造 / クロマチン構造 / 発現制御 / ポストGWAS
研究概要

ゲノムワイド関連解析(GWAS)で見いだされる疾患感受性の一塩基多型(SNP)のうち、非コード領域に位置するものについては、疾患への関与機序が不明なものが多い。本研究では、これらのSNP 周辺の配列が、ゲノム配列上離れて位置する遺伝子の調節配列である可能性に着目し、ポストGWAS解析に特化した核内ゲノムDNA の高次構造解析法の開発を行った。ゲノムワイドな高次構造解析法であるtethered conformation capture (TCC)とビオチン化RNA プローブを用いた疾患感受性SNP 周辺配列のプルダウンを併用することで、空間的に近接する部位の効率的な検出が可能であることを示した。

報告書

(3件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2013 その他

すべて 学会発表 (6件) 備考 (2件)

  • [学会発表] 細胞特異的なゲノム高次構造解析法の検討2013

    • 著者名/発表者名
      長谷川舞衣,原範和,菊地正隆,宮下哲典,中谷明弘,池内健,桑野良三
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2013-12-05
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] AD/GD CNVdb : アルツハイマー病のコピー数変異データベース2013

    • 著者名/発表者名
      中谷明弘,宮下哲典,菊地正隆,長谷川舞衣,原範和,西田奈央,徳永勝士,井原康夫,池内健,桑野良三
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2013-12-03
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 細胞特異的な転写制御にかかわるゲノム高次構造の解析法の検討2013

    • 著者名/発表者名
      長谷川舞衣,原範和,菊地正隆,中谷明弘,宮下哲典,池内健,桑野良三
    • 学会等名
      第43回新潟神経学夏期セミナー
    • 発表場所
      新潟大学脳研究所統合脳機能研究センターセミナーホール(新潟県新潟市)
    • 年月日
      2013-07-26
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 細胞特異的な転写制御にかかわるゲノム高次構造の解析法の検討2013

    • 著者名/発表者名
      長谷川舞衣, 原範和, 菊地正隆, 中谷明弘, 宮下哲典, 池内健, 桑野良三
    • 学会等名
      第43回新潟神経学夏期セミナー
    • 発表場所
      新潟大学(新潟県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] AD/GD CNVdb: アルツハイマー病のコピー数変異データベース2013

    • 著者名/発表者名
      中谷明弘, 宮下哲典, 菊地正隆, 長谷川舞衣, 原範和, 西田奈央, 徳永勝士, 井原康夫, 池内健, 桑野良三
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 細胞特異的なゲノム高次構造解析法の検討2013

    • 著者名/発表者名
      長谷川舞衣, 原範和, 菊地正隆, 宮下哲典, 中谷明弘, 池内健, 桑野良三
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [備考] 研究室

    • URL

      http://www.bri.niigata-u.ac.jp/~idenshi/

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考] 所属機関(新潟大学脳研究所)

    • URL

      http://www.bri.niigata-u.ac.jp

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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