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4Dイメージングによる生体環境の動的解析

研究課題

研究課題/領域番号 24651229
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 システムゲノム科学
研究機関大阪大学

研究代表者

松田 秀雄  大阪大学, 情報科学研究科, 教授 (50183950)

研究分担者 瀬尾 茂人  大阪大学, 大学院情報科学研究科, 助教 (30432462)
連携研究者 石井 優  大阪大学, 大学院医学系研究科, 教授 (10324758)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2012年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード細胞画像解析 / 細胞追跡 / 画像処理 / 生体イメージング / 数理モデル / バイオイメージインフォマティクス / 細胞遊走 / 蛍光イメージング / 細胞トラッキング / モデル化とシミュレーション
研究成果の概要

生きた状態での生体組織の内部での細胞遊走の経時的な動態を観察することで細胞周囲の環境を解析する方法論の開発を目的として、細胞移動の数理モデルに基づいて大域データ対応付けを行うことで多数の細胞の挙動を追跡する手法と、ランダムフォレストを半教師あり学習に応用することで個々の細胞の状態を判別する手法を開発した。それらの手法を実際の細胞画像に適用することで、従来の画像解析手法よりも高い精度を達成できることを示した。

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて 2015 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (12件)

  • [雑誌論文] グラフカットを用いた骨髄腔画像の領域分割2015

    • 著者名/発表者名
      宇佐見 潤, 繁田 浩功, 間下 以大, 黒田 嘉宏, 菊田 順一, 瀬尾 茂人, 石井 優, 松田 秀雄, 竹村 治雄
    • 雑誌名

      情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用

      巻: 8 ページ: 18-27

    • NAID

      110009886640

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 混合正規分布モデルを用いた経時観測蛍光画像からの細胞核の検出と追跡手法2013

    • 著者名/発表者名
      瀬尾茂人, 間下以大, 前田栄, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄
    • 雑誌名

      情報処理学会論文誌 数理モデル化と応用

      巻: 6(3) ページ: 140-150

    • NAID

      110009550153

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Improvement approach of cell tracking accuracy by using inter-frame information2014

    • 著者名/発表者名
      Kohei Kurashige, Shigeto Seno, Tomohiro Mashita, Junichi Kikuta, Yoichi Takenaka, Masaru Ishii, Hideo Matsuda
    • 学会等名
      Bioimage Informatics Conference
    • 発表場所
      フラームスブラバント州庁舎(ルーベン、ベルギー)
    • 年月日
      2014-10-08 – 2014-10-10
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] An automatic event detection method using semi-supervised learning for time-lapse imaging data2014

    • 著者名/発表者名
      Kojiro Fukuda, Shigeto Seno, Tomohiro Mashita, Yoichi Takenaka, Masaru Ishii, Hideo Matsuda
    • 学会等名
      Bioimage Informatics Conference
    • 発表場所
      フラームスブラバント州庁舎(ルーベン、ベルギー)
    • 年月日
      2014-10-08 – 2014-10-10
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 大域データ対応付けの反復実行による細胞追跡精度の改善手法2014

    • 著者名/発表者名
      藏重昂平, 福田浩二郎, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 松田秀雄
    • 学会等名
      情報処理学会 第39回バイオ情報学研究会
    • 発表場所
      大阪大学情報科学研究科(大阪府)
    • 年月日
      2014-09-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] タイムラプスイメージングによる細胞周期観測画像の時空間解析2014

    • 著者名/発表者名
      福田浩二郎, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 松田秀雄
    • 学会等名
      バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
    • 年月日
      2014-06-09
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Global Data Associationによる経時観察画像における破骨前駆細胞の自動追跡手法2013

    • 著者名/発表者名
      尾野貴広, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄
    • 学会等名
      画像の認識・理解シンポジウムMIRU2013
    • 発表場所
      国立情報学研究所, 東京
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 経時観測蛍光画像からのモーションヒストリーイメージを用いた細胞分裂の検出方法2013

    • 著者名/発表者名
      福田浩二郎, 瀬尾茂人, 間下以大, 前田栄, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄
    • 学会等名
      画像の認識・理解シンポジウムMIRU2013
    • 発表場所
      国立情報学研究所, 東京
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] A cell-tracking method for time-lapse multicolor fluorescent images2012

    • 著者名/発表者名
      Shigeto Seno
    • 学会等名
      Bioimage Informatics 2012
    • 発表場所
      Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics, Dresden, Germany
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] n automatic cell-tracking method and spatiotemporal analysis for time-lapse multicolor fluorescent images of cell cycle2012

    • 著者名/発表者名
      Shigeto Seno
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Automatic cell tracking for time-lapse fluorescent images of cell cycle

    • 著者名/発表者名
      Shigeto Seno
    • 学会等名
      International Symposium "Towards Comprehensive Understanding of Immune Dynamism"
    • 発表場所
      Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics, Dresden, Germany
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 多色蛍光タイムラプスイメージングによる細胞周期観測データのための細胞自動追跡手法

    • 著者名/発表者名
      瀬尾茂人
    • 学会等名
      バイオイメージ・インフォマティクス ワークショップ2012
    • 発表場所
      理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター、神戸(兵庫県)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 多色蛍光イメージングによる経時観測データのための細胞追跡手法

    • 著者名/発表者名
      瀬尾茂人
    • 学会等名
      ビジョン技術の実利用ワークショップ View2012
    • 発表場所
      パシフィコ横浜アネックス・ホール、横浜(神奈川県)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 混合正規分布モデルを用いた経時観測蛍光画像からの細胞核の検出と追跡手法

    • 著者名/発表者名
      瀬尾茂人
    • 学会等名
      情報処理学会 第92回数理モデル化と問題解決研究会
    • 発表場所
      武雄市文化会館(佐賀県)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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