オカダ酸の生合成研究

• 研究課題/領域番号: 24651239
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物分子科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 阿部 郁朗 東京大学, 薬学研究科(研究院), 教授 (40305496)
• 研究分担者: 淡川 孝義 東京大学, 大学院薬学系研究科, 助教 (80609834)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円); 2013年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2012年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: オカダ酸 / 生合成 / 遺伝子

研究概要

オカダ酸生産渦鞭毛藻Prorocentrum hoffmanianumより、オカダ酸の生合成に関わるポリケタイド合成酵素遺伝子の同定を目的とした。微生物由来PKSの保存アミノ酸を元に設計したプライマーを用い、藻体由来DNAより二種の、葉緑体由来DNAより一種の新規PKS遺伝子配列を取得した。また、高分解能LC-MSを用いて、藻体のタンパク質分析を行い、PKS酵素断片と思われるペプチド配列の取得に成功した。今後、得られたペプチド部分配列を用いて、DNAライブラリーをスクリーニングすることで、オカダ酸生合成遺伝子クラスターを同定する。渦鞭毛藻由来複雑骨格天然物の生合成機構の全容解明が期待される。

研究成果

• [雑誌論文] An environmental bacterial taxon with a large and distinct metabolic repertoire (2014)
  • 著者名/発表者名: Wilson, M. C., Mori, T., Ruckert, C., Uria, A. R., Helf, M. J., Takada, K., Gernert, C., Steffens, U. A. E., Heycke, N., Schmitt, S., Rinke, C., Helfrich, E. J. N., Brachmann, A. O., Gurgui, C., Wakimoto. T., Kracht, M., Crusemann, M., Hentschel, U., Abe, I., Matsunaga, S., Kalinowski, J., Takeyama, H., Piel, J.
  • 雑誌名: Nature 巻: 506 号: 7486 ページ: 58-62
  • DOI: 10.1038/nature12959
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 生合成工学による創薬 (2014)
  • 著者名/発表者名: 阿部郁朗
  • 雑誌名: ファルマシア 巻: Vol. 50 ページ: 509-511
  • NAID: 130005160519
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multiplexing of combinatorial chemistry in antimycin biosynthesis expands the molecular diversity and utility (2013)
  • 著者名/発表者名: Yan Y., Chen, J., Zhang, L., Zheng, Q., Han, Y., Zhang, H., Awakawa, T., Abe, I., Liu, W.
  • 雑誌名: Angew. Chem. Int. Ed. 巻: 52 号: 47 ページ: 12308-12312
  • DOI: 10.1002/anie.201305569
  • 査読あり
• [学会発表] LC-MSによる渦鞭毛藻由来ポリケタイド合成酵素の検出 (2013)
  • 著者名/発表者名: 淡川孝義、Ioana NTAI、佐竹真幸、Neil KELLEHER、橘和夫、阿部郁朗
  • 学会等名: 日本薬学会第133年会
  • 発表場所: 神奈川県横浜市
  • 年月日: 2013-03-29
• [学会発表] Expanding the catalytic repertoires of biosynthetic enzyme (2013)
  • 著者名/発表者名: Abe, I.
  • 学会等名: Enzyme Engineering XXII : Emerging topics in Enzyme Engineering
  • 発表場所: 富山県富山市
  • 招待講演
• [学会発表] A bacterial symbiont of Japanese marine sponge Discodermia calyx, produces biologically active metabolites (2013)
  • 著者名/発表者名: Wakimoto, T., Abe, I.
  • 学会等名: XIV International Symposium on Marine Natural Products and 8^<th> European Conference on Marine Natural Products
  • 発表場所: La Toja, Galicia, Spain
• [学会発表] Engineered biosynthesis of medicinal natural products (2013)
  • 著者名/発表者名: Abe, I.
  • 学会等名: International Conference on Medicinal Chemistry and Timmerman Award 2013
  • 発表場所: Jakarta, Indonesia
  • 招待講演
• [学会発表] Expanding the catalytic repertoires of biosynthetic enzymes (2013)
  • 著者名/発表者名: Abe, I.
  • 学会等名: Enzyme Engineering XXII: Emerging topics in Enzyme Engineering
  • 発表場所: 富山県富山市
  • 招待講演
• [学会発表] A bacterial symbiont of Japanese marine sponge Discodermia calyx, produces biologically active metabolites (2013)
  • 著者名/発表者名: Wamkimoto, T., Abe, I.
  • 学会等名: XIV International Symposium on Marine Natural Products and 8th European Conference on Marine Natural Products
  • 発表場所: La Toja, Galicia, Spain
• [学会発表] LC-MSによる渦鞭毛藻由来ポリケタイド合成酵素の検出
  • 著者名/発表者名: 淡川孝義、Ioana NTAI、佐竹真幸、Neil KELLEHER、橘和夫、阿部郁朗
  • 学会等名: 日本薬学会第１３３年会
  • 発表場所: 横浜
• [図書] Natural Products: Discourse, Diversity and Design (2014)
  • 著者名/発表者名: Abe, I.(分担執筆)
  • 出版者: Wiley
• [図書] Natural Products: Discourse, Diversity and Design（分担執筆） (2014)
  • 著者名/発表者名: Abe, I.
  • 総ページ数: 300
  • 出版者: Wiley
• [備考] 東京大学大学院薬学系研究科天然物化学教室
  • URL: http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~tennen/head.htm
• [備考] 東京大学大学院薬学系研究科天然物化学教室
  • URL: http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~tennen/head.htm
• [備考] 東京大学大学院薬学系研究科天然物化学教室
  • URL: http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~tennen/head.htm