網羅的遺伝子解析による褐虫藻動態解明～「サンゴ－褐虫藻」共生系研究の新戦略提案～

• 研究課題/領域番号: 24651267
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 資源保全学
• 研究機関: 高知大学
• 研究代表者: 久保田 賢 高知大学, 教育研究部総合科学系, 准教授 (00314980)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円); 2014年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2013年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2012年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: 褐虫藻 / クレード / 網羅的解析 / 次世代シーケンサー / 造礁サンゴ

研究成果の概要

網羅的な塩基配列分析が可能な次世代シーケンサーを用いて，造礁サンゴに共生する褐虫藻の組成分析を試みた。従来型のRFLP分析により，Clade CおよびClade Fの褐虫藻が検出されたが，次世代シーケンサー解析では複数のClade Cの褐虫藻は検出されたが，Clade Fの褐虫藻はほとんど配列を見出すことができなかった，RFLP分析で検出された褐虫藻が次世代シーケンサー解析により優占種であることが示されたことから，次世代シーケンサー解析により褐虫藻組成はおおよそ把握できると思われた。しかし，Cladeの異なる褐虫藻の組成を含めて把握するためには，より詳細な条件検討が必要であると考えれた。

研究成果

• [雑誌論文] Molecular cytogenetic analysis of the scleractinian coral Acropora solitaryensis Veron & Wallace 1984. (2014)
  • 著者名/発表者名: Taguchi T1, Mezaki T, Iwase F, Sekida S, Kubota S, Fukami H, Okuda K, Shinbo T, Oshima S, Iiguni Y, Testa JR, Tominaga A.
  • 雑誌名: Zoolog Sci. 巻: 31 号: 2 ページ: 89-94
  • DOI: 10.2108/zsj.31.89
  • NAID: 40019989087
  • 査読あり
• [学会発表] 次世代シーケンサーを用いた造礁サンゴに共生する褐虫藻の網羅的解析の試み (2012)
  • 著者名/発表者名: 久保田 賢・目﨑 拓真
  • 学会等名: 日本サンゴ礁学会
  • 発表場所: 東京大学