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低分子によるRNAループ間相互作用と二次構造制御

研究課題

研究課題/領域番号 24655154
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 生体関連化学
研究機関大阪大学

研究代表者

中谷 和彦  大阪大学, 産業科学研究所, 教授 (70237303)

研究期間 (年度) 2012
研究課題ステータス 完了 (2012年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2012年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
キーワード生体認識 / 機能化学 / RNA / 小分子 / ループ / ヘアピン
研究概要

RNA のヘアピンループ構造に結合する分子を創製し、この分子の結合により二つのヘアピンループ間の相互作用を誘起させ、RNA の二次構造調節に挑戦した。ナフチリジンテトラマーの誘導体(NCT6)を用いることにより、ループ配列に(CGG)3 を持つ二つのヘアピンループ間に相互作用を誘起する事に成功した。また、二つのへアピンループを分子内に持つ RNA では、FRET により二次構造変化が誘起されている事を確認した。

報告書

(2件)
  • 2012 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (6件) (うち招待講演 2件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] A dimeric form of N-Methoxycarbonyl-2-amino-1,8-naphthyridine bound to the A-A mismatch in the CAG/CAG base triad in dsRNA2013

    • 著者名/発表者名
      Nakatani, K.; Toda, M.; He, H. Bioorg
    • 雑誌名

      Med. Chem. Lett.

      巻: 23 ページ: 558-561

    • URL

      http://dx.doi.org/10.1016/j.bmcl.2012.11.014

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Selective recognition of G-G mismatch using the double functional probe with electrochemical active ferrocenyl2013

    • 著者名/発表者名
      He, H.; Xia, J.; Chang, G.; Peng, X.; Lou, Z.; Nakatani, K.; Zhou, X.; Wang, S.
    • 雑誌名

      Biosensors and Bioelectronics

      巻: 42 ページ: 36-40

    • URL

      http://dx.doi.org/10.1016/j.bios.2012.10.042

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Xanthone derivatives as potential inhibitors of miRNA processing by human Dicer: Targeting secondary structures of pre-miRNA by small molecules2013

    • 著者名/発表者名
      Murata, A.; Fukuzumi, T.; Umemoto, S.; Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      巻: 23 ページ: 252-255

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Naphthyridine tetramer with a preorganized structure for 1:1 binding to a CGG/CGG sequence2012

    • 著者名/発表者名
      Dohno, C.; Kohyama, I.; Hong, C; Nakatani, K.
    • 雑誌名

      Nucleic.Acids Res.

      巻: 40 号: 6 ページ: 2771-2781

    • DOI

      10.1093/nar/gkr1148

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書 2012 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Small Organic Molecules regulating RNA Structure and Function2013

    • 著者名/発表者名
      K. Nakatani
    • 学会等名
      International Symposium on Challenges in Chemical Biology (ISCCB2013)
    • 発表場所
      Indian Institute of Chemical Biology, Kolkata, India
    • 年月日
      2013-01-29
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Small Organic Molecules regulating RNA Structure and Function2013

    • 著者名/発表者名
      K. Nakatani
    • 学会等名
      International Symposium on Challenges in Chemical Biology (ISCCB2013)
    • 発表場所
      Kolkata, India
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Small Organic Molecules Regulating RNA Structure and Function2012

    • 著者名/発表者名
      K. Nakatani
    • 学会等名
      The First International Symposium on Biofunctional Chemistry (ISBC2012)
    • 発表場所
      東京工業大学大岡山
    • 年月日
      2012-11-29
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] High-throughput Screening of Chemical Libraries for the Discovery of RNA-binding Compounds, RNA 20122012

    • 著者名/発表者名
      村田亜沙子、福澄岳雄、原田恭枝、梅本詩織、中谷和彦
    • 学会等名
      the 17th Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      ミシガン州立大学, Ann Arbor
    • 年月日
      2012-05-29
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Synthesis of Small Molecule Library for pre-miRNA Secondary Structures, RNA 20122012

    • 著者名/発表者名
      福澄岳雄、村田亜沙子、原田恭枝、中谷和彦
    • 学会等名
      the 17th Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      ミシガン州立大学, Ann Arbor
    • 年月日
      2012-05-29
    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書
  • [学会発表] Small Organic Molecules Regulating RNA Structure and Function2012

    • 著者名/発表者名
      K. Nakatani
    • 学会等名
      The First International Symposium on Biofunctional Chemistry (ISBC2012)
    • 発表場所
      大岡山、東京工業大学
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 招待講演
  • [備考] ホームページ

    • URL

      http://www.sanken.osaka-u.ac.jp/labs/rbc/

    • 関連する報告書
      2012 研究成果報告書

URL: 

公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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