| 研究課題/領域番号 |
24657011
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| 研究種目 |
挑戦的萌芽研究
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究分野 |
生態・環境
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| 研究機関 | 東北大学 |
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研究代表者 |
河田 雅圭 東北大学, 生命科学研究科, 教授 (90204734)
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| 連携研究者 |
牧野 能士 東北大学, 大学院生命科学研究科, 助教 (20443442)
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| 研究期間 (年度) |
2012-04-01 – 2014-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2013年度)
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| 配分額 *注記 |
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2013年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2012年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
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| キーワード | 分子生態 / 疾病生態学 / 保全生態学 / 抗菌ペプチド / 遺伝子コピー数変異 / 遺伝子コピー数 / ヤマアカガエル |
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| 研究概要 |
ヤマアカガエルの抗菌ペプチドのコピー数変異のゲノムでの重複の状態を調べるため、フォスミドライブラリーを作成し、抗菌ペプチドを含むクローンの配列を十世代シークエンサーでの決定を試みた。次世代シークエンサーで解読したリードを複数のアセンブラでアセンブルした結果、約40kbpの配列のうち33kbはtemporinを含まない非コード領域で、残りの配列の中に、temporin-1Ojと1Ocを含む少なくとも3コピーの配列があることが明らかになった。今回得られたコンティグの情報では、temporin-1O遺伝子の詳細のゲノム上の位置を断定することはできなかった。
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