真核微生物のかたちとゲノムを繋ぐ新規生物プロファイリング法の開発

• 研究課題/領域番号: 24657060
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 横山 亜紀子 筑波大学, 生命環境系, 研究員 (30466601)
• 連携研究者: 中山 剛 筑波大学, 生命環境系, 講師 (40302369)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2013-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2012年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
• キーワード: 藻類 / プロティスト

研究概要

真核微生物には環境配列のみで知られる多数の未知生物が存在し，中には既存系統群のいずれにも当てはまらない全くの未知生物も報告されている。その一方で，既に分類学的には記載されてはいるものの，塩基配列情報が取得されていないために未知生物と判断されている場合も少なからず存在する。本研究では実体未知生物，あるいは難培養や高速遊泳が原因で遺伝情報が欠失している真核微生物での網羅的かつ効率的な生物プロファイリングを目指し研究を実施した。

研究成果

• [雑誌論文] Global searches for microalgae and aquatic plants that can eliminate radioactive cesium, iodine and strontium from the radio-polluted aquatic environment: a bioremediation strategy (2014)
  • 著者名/発表者名: Fukuda S., Iwamoto K., Atsumi M., Yokoyama A., Nakayama T., Ishida K., Inoue I. and Shiraiwa Y.
  • 雑誌名: Journal of Plant Research 巻: 127 号: 1 ページ: 79-89
  • DOI: 10.1007/s10265-013-0596-9
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] 132,173-Cyclopheophorbide b enol as a catabolite of chlorophyll b in phycophagy by protists (2013)
  • 著者名/発表者名: Yuichiro Kashiyama, Akiko Yokoyama, Takashi Shiratori, Isao Inouye, Yusuke Kinoshita, Tadashi Mizoguchi and Hitoshi Tamiaki
  • 雑誌名: FEBS Lett. 巻: 587 号: 16 ページ: 2578-2583
  • DOI: 10.1016/j.febslet.2013.06.036
  • 査読あり
• [雑誌論文] 藻類食プロティストが関与するクロロフィルの「解毒」代謝 (2013)
  • 著者名/発表者名: 横山亜紀子・柏山祐一郎
  • 雑誌名: 藻類 巻: 61(1) ページ: 6-10
  • NAID: 10031156578
• [雑誌論文] 藻類食プロティストが関与するクロロフィルの「解毒」代謝 (2013)
  • 著者名/発表者名: 横山亜紀子，柏山裕一郎.
  • 雑誌名: 藻類 巻: 61 ページ: 6-10
  • NAID: 10031156578
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ubiquity and quantitative significance of detoxification catabolism of chlorophyll associated with protistan herbivory (2012)
  • 著者名/発表者名: Y Kashiyam, A Yokoyama, Y Kinoshita, S Shoji, H Miyashita, T Shiratori, H Suga, K Ishikawa, A Ishikawa, I Inouye, K Ishida, D Fujinuma, K Aoki, M Kobayashi, S Nomoto, T Mizoguchi, H Tamiaki
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 巻: 109 号: 43 ページ: 17328-17335
  • DOI: 10.1073/pnas.1207347109
  • 査読あり
• [学会発表] 藻類・プロティストの代謝分解と共生進化との関連 (2014)
  • 著者名/発表者名: 柏山祐一郎,横山亜紀子,白鳥峻志,中澤昌美,鈴木利幸,土屋正史,鏡味麻衣子,柴田あいか,早川昌志,川原純,梅谷貴大,民秋均
  • 学会等名: 日本藻類学会第38回大会
  • 発表場所: 東邦大学(船橋)
  • 年月日: 2014-03-16
• [学会発表] 真核生物のかたちとゲノムをつなぐ〜高速度撮影による形態観察の有用性と問題点〜 (2014)
  • 著者名/発表者名: 横山亜紀子
  • 学会等名: 第1回コンタ研究会
  • 発表場所: 筑波大学下田臨海実験センター(下田)
  • 年月日: 2014-01-30
• [学会発表] 光合成内部共生進化に関わったユーグレノイドのクロロフィル解毒代謝 (2013)
  • 著者名/発表者名: 柏山祐一郎,横山亜紀子,民秋均
  • 学会等名: 第2回マトリョーシカ型生物学研究会
  • 発表場所: ホテル京都ガーデンパレス(京都)
  • 年月日: 2013-07-25
• [学会発表] 光合成内部共生進化に関わったユーグレノイドのクロロフィル解毒代謝 (2013)
  • 著者名/発表者名: 柏山祐一郎,横山亜紀子,民秋均
  • 学会等名: 日本地球惑星連合2013年大会
  • 発表場所: 幕張メッセ(千葉)
  • 年月日: 2013-05-19
• [学会発表] 沿岸域におけるクロロフィル誘導体と真核微生物相の時空間変動解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 横山亜紀子,柏山祐一郎,守屋繁春,民秋均,井上勲
  • 学会等名: 日本地球惑星連合2013年大会
  • 発表場所: 幕張メッセ(千葉)
  • 年月日: 2013-05-19
• [学会発表] プロティスト捕食活動の指標としてのシクロエノールの可能性を探る (2013)
  • 著者名/発表者名: 横山亜紀子,柏山祐一郎,守屋繁春,民秋均,井上勲
  • 学会等名: 日本藻類学会第37回大会
  • 発表場所: 山梨大学(甲府)
  • 年月日: 2013-03-28
• [学会発表] 色素体獲得を可能にしたユーグレノイドによるクロロフィルの解毒代謝分解 (2013)
  • 著者名/発表者名: 柏山祐一郎,横山亜紀子,白鳥峻志,川口明音,中沢昌美,井上勲,民秋均
  • 学会等名: 日本藻類学会第37回大会
  • 発表場所: 山梨大学(甲府)
  • 年月日: 2013-03-28
• [学会発表] Chlorophyll catabolism in aquatic ecosystems : Physiology, ecology, and evolution (2013)
  • 著者名/発表者名: Kashiyama Y., Yokoyama A. and Tamiaki H.
  • 学会等名: CER International workshop on Biogeochemical cycling and Microbial Ecology for Young Scientists
  • 発表場所: 京都大学生態学研究センター(大津)
  • 年月日: 2013-03-19
• [学会発表] Detoxification catabolism of chlorophyll associated with protistan herbivory in aquatic ecosystems (2012)
  • 著者名/発表者名: Kashiyama Y., Yokoyama A. and Tamiaki H.
  • 発表場所: 立命館大学(草津)
  • 年月日: 2012-12-01
• [学会発表] Seasonal succession of eukaryotic community detected by environmental sequences in Tokyo Bay, Japan (2012)
  • 著者名/発表者名: Yokoyama A., Kikuchi J., Tsuboi Y., Moriya S., Inagaki Y., Hashimoto T. and Inouye I.
  • 学会等名: Protist 2012
  • 発表場所: Oslo,Norway
  • 年月日: 2012-08-02
• [学会発表] Morphology and phylogeny of a new imbricatean flagellate (phylum Cercozoa) (2012)
  • 著者名/発表者名: Shiratori T., Yokoyama A. and Ishida K.
  • 学会等名: Protist 2012
  • 発表場所: Oslo,Norway
  • 年月日: 2012-08-02
• [学会発表] Ecological significance of chlorophyll metabolism of herbivorous protists in aquatic ecosystems (2012)
  • 著者名/発表者名: Kashiyama Y., Yokoyama A., Miyashita H., Ishikawa K., Ishikawa A., Inouye I. and Tamiaki H.
  • 学会等名: Protist 2012
  • 発表場所: Oslo,Norway
  • 年月日: 2012-08-01
• [学会発表] Evolutionary significance of chlorophyll metabolisms of herbivorous protists in aquatic ecosystems (2012)
  • 著者名/発表者名: Kashiyama Y., Yokoyama A., Shiratori T., Inouye I., Ishida K. and Tamiaki H.
  • 学会等名: Protist 2012
  • 発表場所: Oslo,Norway
  • 年月日: 2012-07-30
• [学会発表] 微細藻類捕食プロティストによるクロロフィルの解毒代謝 (2012)
  • 著者名/発表者名: 柏山祐一郎,横山亜紀子,木下雄介,庄司淳,宮下英明,白鳥峻志,菅寿美,石川可奈子,石川輝,井上勲,石田健一郎,藤沼大幹,青木啓介7・小林正美,野本信也,溝口正,民秋均
  • 学会等名: 日本藻類学会第36回大会
  • 発表場所: 北海道大学(札幌)
  • 年月日: 2012-07-15
• [学会発表] 塩基配列情報で探る東京湾沿岸の真核微生物相とその季節変動 (2012)
  • 著者名/発表者名: 横山亜紀子,守屋繁春,稲垣祐司,橋本哲男,井上勲
  • 学会等名: 日本藻類学会第36回大会
  • 発表場所: 北海道大学(札幌)
  • 年月日: 2012-07-14
• [学会発表] Occurrence and distributiono of Chlorophyll catabolites in aquatic environments (2012)
  • 著者名/発表者名: Kashiyama, Y., Yokoyama, A., Kinoshita, Y., Miyashita, H., Ishikawa, K., Ishikawa, A, Mizoguchi, T., Tamiaki, H.
  • 学会等名: 2012 ASLO. Aquatic Sciences meeting, Voyages of Discovery
  • 発表場所: 滋賀県立びわ湖ホール(大津)
  • 年月日: 2012-07-12
• [学会発表] 沿岸域におけるクロロフィル誘導体と真核微生物相の時空間変動解析
  • 著者名/発表者名: 横山 亜紀子, 柏山 祐一郎, 守屋 繁春, 民秋 均, 井上 勲
  • 学会等名: 日本地球惑星連合2013年大会
  • 発表場所: 幕張メッセ（千葉）
• [学会発表] プロティストによる捕食生物中のクロロフィル解毒代謝機構と光合成細胞内共生
  • 著者名/発表者名: 柏山 祐一郎，横山亜紀子，民秋均
  • 学会等名: 日本地球惑星連合2013年大会
  • 発表場所: 幕張メッセ（千葉）
• [学会発表] 光合成内部共生進化に関わったユーグレノイドのクロロフィル解毒代謝
  • 著者名/発表者名: 柏山 祐一郎，横山亜紀子，民秋均
  • 学会等名: 第2 回マトリョーシカ型生物学研究会・公開国際シンポジウム
  • 発表場所: 京都ガーデンパレス（京都）
• [学会発表] 真核生物のかたちとゲノムをつなぐ～高速度撮影による形態観察の有用性と問題点 ～
  • 著者名/発表者名: 横山亜紀子
  • 学会等名: 第1回コンタ研究会
  • 発表場所: 筑波大学下田臨海実験センター（下田）
• [学会発表] 藻類・プロティストのクロロフィル代謝分解と共生進化との関連
  • 著者名/発表者名: 柏山祐一郎，横山亜紀子，白鳥峻志，中澤昌美，鈴木利幸，土屋正史，鏡味麻衣子，柴田あいか，早川昌志，川原純，梅谷貴大，民秋均
  • 学会等名: 日本藻類学会第38回大会
  • 発表場所: 東邦大学（船橋）
• [学会発表] Occurrence and distributiono of Chlorophyll catabolites in aquatic environments.
  • 著者名/発表者名: Kashiyama Y, Yokoyama A, Kinoshita Y, Miyashita H, Ishikawa K, Ishikawa A, Mizoguchi T & Tamiaki H.
  • 学会等名: 2012 ASLO. Aquatic Sciences meeting.
  • 発表場所: 大津（滋賀）
• [学会発表] 微細藻類捕食プロティストによるクロロフィルの 解毒代謝
  • 著者名/発表者名: 柏山 祐一郎，横山 亜紀子 他15名
  • 学会等名: 日本藻類学会第 36 回大会
  • 発表場所: 北海道大学（札幌）
• [学会発表] 塩基配列情報で探る東京湾沿岸の真核微生物相とその季節変動
  • 著者名/発表者名: 横山 亜紀子，守屋 繁春，稲垣 祐司，橋本 哲男 ，井上 勲
  • 学会等名: 日本藻類学会第 36 回大会
  • 発表場所: 北海道大学（札幌）
• [学会発表] Morphology and phylogeny of a new imbricatean flagellate (phylum Cercozoa).
  • 著者名/発表者名: Shiratori T, Yokoyama A and Ishida K.
  • 学会等名: Protist 2012
  • 発表場所: Oslo, Norway
• [学会発表] Evolutionary significance of chlorophyll metabolisms of herbivorous protists in aquatic ecosystems.
  • 著者名/発表者名: Kashiyama Y, Yokoyama A, Shiratori T, Inouye I, Ishida K and Tamiaki H.
  • 学会等名: Protist 2012
  • 発表場所: Oslo, Norway
• [学会発表] Ecological significance of chlorophyll metabolism of herbivorous protists in aquatic ecosystems.
  • 著者名/発表者名: Kashiyama Y, Yokoyama A, Miyashita H, Ishikawa K, Ishikawa A, Inouye I and Tamiaki H
  • 学会等名: Protist 2012
  • 発表場所: Oslo, Norway
• [学会発表] Seasonal succession of eukaryotic community detected by environmental sequences in Tokyo Bay, Japan.
  • 著者名/発表者名: Yokoyama A, Kikuchi J, Tsuboi Y, Moriya S, Inagaki Y, Hashimoto T, Inouye I.
  • 学会等名: Protist 2012
  • 発表場所: Oslo, Norway
• [学会発表] Detoxification catabolism of chlorophyll associated with protistan herbivory in aquatic ecosystems
  • 著者名/発表者名: Kashiyama Y, Yokoyama A and Tamiaki H.
  • 学会等名: 2nd International Symposium on Biosynthesis of Tetrapyrroles
  • 発表場所: 立命館大学(草津）
• [学会発表] プロティスト捕食活動の指標としてのシクロエ ノールの可能性を探る
  • 著者名/発表者名: 横山 亜紀子, 柏山 祐一郎, 守屋 繁春, 民秋 均, 井上 勲
  • 学会等名: 日本藻類学会第 37 回大会
  • 発表場所: 山梨大学（甲府）
• [学会発表] 色素体獲得を可能にしたユーグレノイドによるク ロロフィルの解毒代謝分解
  • 著者名/発表者名: 柏山 祐一郎, 横山 亜紀子, 白鳥 峻志, 川口 明 音, 中沢 昌美, 井上 勲 , 民秋 均
  • 学会等名: 日本藻類学会第 37 回大会
  • 発表場所: 山梨大学（甲府）
• [備考] ＝藻類・プロティストの多様性の実態を包括的に捉える＝
  • URL: http://www.life.tsukuba.ac.jp/topixarchive/topix_20121220_a.pdf