中性子結晶解析法によるヒドロゲナーゼの反応機構およびプロトン経路の解明

• 研究課題/領域番号: 24657077
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 兵庫県立大学
• 研究代表者: 樋口 芳樹 兵庫県立大学, 生命理学研究科, 教授 (90183574)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円); 2013年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2012年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
• キーワード: ヒドロゲナーゼ / X線結晶解析 / 反応機構 / Ni酵素 / 燃料電池

研究概要

本研究では，[NiFe]-ヒドロゲナーゼのNi-Fe活性部位における水素活性化の反応機構を中性子結晶解析法により解明するために，良質の巨大単結晶の調製を目指した．
重水溶液中での[NiFe]-ヒドロゲナーゼの結晶化においては，沈殿剤として2-methyl-2,4-pentanediol(MPD)を用いるが，これが酸化されると4-hydroxy-4-methyl-2-pentanone(HMPO)が生成されヒドロゲナーゼの結晶性を著しく劣化させることをつきとめた．また，巨大単結晶にダメージを与えることなく，凍結させる条件を見出した．その結果，11mm3の大きさの良質の単結晶の調製に成功した．

研究成果

• [雑誌論文] New insights into the catalytic active-site structure of multicopper oxidases. (2014)
  • 著者名/発表者名: Komori H, Sugiyama R, Kataoka K, Miyazaki K, Higuchi Y, Sakurai T
  • 雑誌名: Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 巻: 70 号: 3 ページ: 772-779
  • DOI: 10.1107/s1399004713033051
  • NAID: 120005451980
  • 査読あり
• [雑誌論文] Studies on hydrogenase (2013)
  • 著者名/発表者名: T. Yagi, Y. Higuchi
  • 雑誌名: Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｊａｐａｎ Ａｃａｄｅｍｙ． Ｓｅｒ． Ｂ： Ｐｈｙｓｉｃａｌ ａｎｄ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ 巻: 89 号: 1 ページ: 16-33
  • DOI: 10.2183/pjab.89.16
  • NAID: 130003365103
  • ISSN: 0386-2208, 1349-2896
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural Aspects of [NiFe]-hydrogenases (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Shomura and Y. Higuchi
  • 雑誌名: Rev. Inorg. Chem. 巻: 33 号: 4 ページ: 173-192
  • DOI: 10.1515/revic-2013-0005
  • 査読あり
• [雑誌論文] Photosensitivity of the Ni-A State of [NiFe] Hydrogenase from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F with Visible Light (2013)
  • 著者名/発表者名: H. Osuka, Y. Shomura, H. Komori, N. Shibata, S. Nagao, Y. Higuchi, S. Hirota
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 430 号: 1 ページ: 284-288
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2012.10.136
  • NAID: 120005716864
  • 査読あり
• [雑誌論文] 膜結合型ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人,樋口芳樹
  • 雑誌名: 生物物理 巻: 53-2 ページ: 82-85
  • NAID: 10031151786
• [雑誌論文] Inhibitory activity of Filipendula ulmaria on recombinant histidine decarboxykase. (2013)
  • 著者名/発表者名: Nitta Yoko
  • 雑誌名: Food Chemistry 巻: 138 号: 2-3 ページ: 1551-1556
  • DOI: 10.1016/j.foodchem.2012.10.074
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cyrstal structure of the CueO mutants at Glu506, the key amino acid located in the proton transfer pathway for dioxygen reduction (2013)
  • 著者名/発表者名: H. Komori, T. Kajikawa, K. Kataoka, Y. Higuchi & T. Sakurai
  • 雑誌名: Biochem. Biophys. Res. Commun. 巻: 438 号: 4 ページ: 686-690
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2013.07.121
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and X-ray diffraction analysis of nylon hydrolase (NylC) from Arthrobacter sp (2013)
  • 著者名/発表者名: Nagai, K., Yasuhira, K., Tanaka, Y., Kato, D., Takeo, M., Higuchi, Y., Negoro, S., & Shibata N.
  • 雑誌名: KI72 Acta Cryst. 巻: F69 号: 10 ページ: 1151-1154
  • DOI: 10.1107/s1744309113024263
  • 査読あり
• [雑誌論文] Formation of Oligomeric Cytochrome c during Folding by lntermolecular Hydrophobic Interaction between N-and C-Terminal α-Helices (2013)
  • 著者名/発表者名: Partha Pratim Parui, Megha Subhash Deshpande, Satoshi Nagao, Hironari Kamikubo. Hirofumi Komori. Yoshiki Higuchi, Miklo Kataoka . Shun Hirota
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 52巻 号: 48 ページ: 8732-8744
  • DOI: 10.1021/bi400986g
  • 査読あり
• [雑誌論文] 立体構造を基盤としたナイロン加水分解酵素の開発と耐熱化機構 (2013)
  • 著者名/発表者名: 根来誠司，永井圭介，大島祥平，飯田一希，加藤太一郎，武尾正弘，持地広造，柴田直樹，樋口芳樹
  • 雑誌名: 酵素工学ニュース 巻: 69 ページ: 12-18
• [雑誌論文] Purification, Structural Basis for the Reaction Mechanism of S-carbamoylation of HypE by HypF in the Maturation of [NiFe]-hydrogenases (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Shomura, Y. Higuchi
  • 雑誌名: J. Biol. Chem 巻: 287 号: 34 ページ: 28409-18419
  • DOI: 10.1074/jbc.m112.387134
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal Structure Analysis of the Translation Factor RF3 (release factor 3) (2012)
  • 著者名/発表者名: K. Kihira, Y. Shimizu, Y. Shomura, N. Shibata, M. Kitamura, A. Nakagawa, T. Ueda, K. Ochi, Y.Higuchi
  • 雑誌名: FEBS Letters 巻: 586 号: 20 ページ: 3705-3709
  • DOI: 10.1016/j.febslet.2012.08.029
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of O_2-tolerant [NiFe] hydrogenase reveals the mechanism of O_2-tolerance attributable to a redox-dependent conformational change of [4Fe-3S] cluster (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Shomura and Y. Higuchi
  • 雑誌名: SPring-8 Research Frontier 巻: 2011 ページ: 5-6
  • URL: http://www.spring8.or.jp/ja/news_publications/publications/research_frontiers/html/rf11
• [雑誌論文] [4Fe-3S]クラスターによる[NiFe]ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の構造基盤 (2012)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹,庄村康人
  • 雑誌名: SPring-8利用者情報誌 巻: Vol.17 No.2 ページ: 105-110
  • URL: http://user.spring8.or.jp/sp8info/
• [雑誌論文] 酸素耐性ヒドロゲナーゼの構造化学的研究-酵素分子に見出された活性保護機構- (2012)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人,樋口芳樹
  • 雑誌名: 燃料電池 巻: VOL.11 No.4 ページ: 67-72
  • NAID: 40019321797
• [雑誌論文] ヒドロゲナーゼの新規酸素耐性機構-膜結合型[NiFe]ヒドロゲナーゼ (2012)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人,樋口芳樹
  • 雑誌名: 化学 巻: Vol. 67 ページ: 70-71
• [雑誌論文] Purification, crystallization, and preliminary X-ray analysis of human histidine decarboxylase (2012)
  • 著者名/発表者名: Komori Hirofumi
  • 雑誌名: Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 巻: 68 号: 6 ページ: 675-677
  • DOI: 10.1107/s1744309112015692
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural and Oxygen Binding Properties of Dimeric Horse Myoglobin (2012)
  • 著者名/発表者名: S. Nagao, H. Osuka, T. Yamada, T. Uni, Y. Shomura, K. Imai, Y. Higuchi, S. Hirota
  • 雑誌名: Dalton Transactions 巻: 41 号: 37 ページ: 11378-11385
  • DOI: 10.1039/c2dt30893b
  • NAID: 120005716865
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural study reveals Ser354 determines substrate specificity on human histidine decarboxylase (2012)
  • 著者名/発表者名: Komori Hirofumi
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: 287 号: 34 ページ: 29175-29183
  • DOI: 10.1074/jbc.m112.381897
  • 査読あり
• [雑誌論文] Domain Swapping of the Heme and N-Terminal α-Helix in Hydrogenobacter thermophilus Cytochrome c552 Dimer (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Hayashi, S. Nagao, H. Osuka, H. Komori, Y. Higuchi, S. Hirota
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 51 号: 43 ページ: 8608-8616
  • DOI: 10.1021/bi3011303
  • 査読あり
• [雑誌論文] 酸素耐性ヒドロゲナーゼの構造化学的研究－酵素分子に見出された活性保護機構－ (2012)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人，樋口芳樹
  • 雑誌名: 酸素耐性ヒドロゲナーゼの構造化学的研究－酵素分子に見出された活性保護機構－ 巻: 11 ページ: 67-72
  • NAID: 40019321797
• [雑誌論文] ［4Fe-3S］クラスターによる［NiFe］ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の構造基盤 (2012)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人，樋口芳樹
  • 雑誌名: SPring-8利用者情報誌 巻: 17 ページ: 105-110
• [雑誌論文] Crystal structure of O2-tolerant [NiFe] hydrogenase reveals the mechanism of O2-tolerance attributable to a redox-dependent conformational change of [4Fe-3S] cluster (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Shomura and Y. Higuchi
  • 雑誌名: SPring-8 Research Frontier 2011 巻: 2011 ページ: 5-6
• [雑誌論文] シトクロムc ポリマー：水溶性球状タンパク質に見出された多量化機構 (2012)
  • 著者名/発表者名: 廣田俊，樋口芳樹
  • 雑誌名: 日本結晶学会誌 巻: 54 ページ: 270-275
  • NAID: 10031129961
• [学会発表] Purification and Crystallization of NAD+-reducing [NiFe]-hydrogenase (2014)
  • 著者名/発表者名: H. Nakagawa, M. Taketa, M. Habukawa, K. Kihira, N. Shibata, H. Nishihara, K.-S. Yoon, S. Ogo, Ma. Ishii, Y. Igarashi, Y. Shomura and Y. Higuchi
  • 学会等名: 第1回ピコバイロジー研究所国際シンポジウム
  • 発表場所: 兵庫
• [学会発表] Crystallization of [NiFe]-hydrogenase maturation protein complex HypA-HypB (2014)
  • 著者名/発表者名: Y. Okawa, Y. Higuchi, and Y. Shomura
  • 学会等名: 第1回ピコバイロジー研究所国際シンポジウム
  • 発表場所: 兵庫
• [学会発表] Crystallization of single crystals of Multi-Copper Oxidases for neutron diffraction experiment (2014)
  • 著者名/発表者名: M. Akter, H. Komori, N. Shibata, T. Sakurai, K. Kataoka, Y. Higuchi
  • 学会等名: 第1回ピコバイロジー研究所国際シンポジウム
  • 発表場所: 理研XFEL大会議室（兵庫）
• [学会発表] Crystallization of [NiFe]-hydrogenase maturation protein complex HypA-HypB (2014)
  • 著者名/発表者名: Y. Okawa, Y. Higuchi, and Y. Shomura
  • 学会等名: 第1回ピコバイロジー研究所国際シンポジウム
  • 発表場所: 理研XFEL大会議室（兵庫）
• [学会発表] Purification and Crystallization of NAD+-reducing [NiFe]-hydrogenase (2014)
  • 著者名/発表者名: H. Nakagawa, M. Taketa, M. Habukawa, K. Kihira, N. Shibata, H. Nishihara, K.-S. Yoon, S. Ogo, Ma. Ishii, Y. Igarashi, Y. Shomura and Y. Higuchi
  • 学会等名: 第1回ピコバイロジー研究所国際シンポジウム
  • 発表場所: 理研XFEL大会議室（兵庫）
• [学会発表] Crystallization of extracellular domains of protocadherin, a neural cell adhesion protein (2014)
  • 著者名/発表者名: S. Yoshida, T. Hirabayashi, T. Yagi, Y. Shomura and Y. Higuchi
  • 学会等名: 第1回ピコバイロジー研究所国際シンポジウム
  • 発表場所: 理研XFEL大会議室（兵庫）
• [学会発表] [NiFe]ヒドロゲナーゼのX線結晶構造解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人
  • 学会等名: 第27回日本放射光学会年会放射光科学合同シンポジウム
  • 発表場所: 広島国際会議場（広島）
  • 招待講演
• [学会発表] 結晶構造解析による水素分解酵素の反応機構解明に向けた試み (2014)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人，西川幸志， 井上誠也，玉田太郎，樋口 芳樹
  • 学会等名: 蛋白質研究所セミナー
  • 発表場所: 大阪大学蛋白質研究所（大阪）
  • 招待講演
• [学会発表] X-ray Structural Study of O_2-tolerant [NiFe] hydrogenase (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Higuchi, K.-S. Yoon, H. Nishihara and Y. Shomura
  • 学会等名: International Conference on Bio/Mimetic Solar Energy Conversion (iSEC) 2013
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2013-11-23
• [学会発表] 水素分解酵素の成熟化機構の解明 (2013)
  • 著者名/発表者名: 大川雄嗣,樋口芳樹,庄村康人
  • 学会等名: 兵庫県立大学シンポジウム
  • 年月日: 2013-09-24
• [学会発表] 水素-化学エネルギー変換・ヒドロゲナーゼの構造化学 (2013)
  • 著者名/発表者名: 神戸中川英恵,竹田翠,庄村康人,樋口芳樹
  • 学会等名: 兵庫県立大学シンポジウム
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2013-09-24
• [学会発表] Reaction Mechanism of S-Carbamoylation of HypE by HypF in the Maturation of [NiFe]-hydrogenase (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Higuchi and Y. Shomura
  • 学会等名: 10th International Hydrogenase Conference・Szeged
  • 発表場所: ハンガリー
  • 年月日: 2013-07-09
• [学会発表] H. thermoluteolus TH-1由来NAD^+還元ヒドロゲナーゼの分光学研究 (2013)
  • 著者名/発表者名: 太虎林,竹田翠,庄村康人,西川幸志,鈴木雅之,樋口芳樹,廣田俊
  • 学会等名: 日本化学会第94春季年会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2013-03-29
• [学会発表] NAD^+還元型ヒドロゲナーゼの結晶学的研究 (2013)
  • 著者名/発表者名: 中川英恵,竹田翠,土生川真央,木平清人,柴田直樹,樋口芳樹
  • 学会等名: 平成25年度日本結晶学会年会
  • 発表場所: 熊本
• [学会発表] [NiFe]-ヒドロゲナーゼ成熟化タンパク質HypAの結晶化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 大川雄嗣,樋口芳樹,庄村康人
  • 学会等名: 平成25年度日本結晶学会
  • 発表場所: 熊本
• [学会発表] Domain Swapping of the Heme and N-Terminal α-Helix in Hydrogenobacter thermophilus Cytochrome-c552 Dimer (2013)
  • 著者名/発表者名: Y. Hayashi, S. Nagao, H. Osuka, H. Komori, Y. Higuchi, and S. Hirota
  • 学会等名: The 27th Annual Symposium of The Protein Society
  • 発表場所: Boston (USA)
• [学会発表] Structure of the native Axin-DIX domain crystallized without mercury compound. (2013)
  • 著者名/発表者名: N. Shibata, T. Katsutani, S. Terawaki, H. Yamamoto, A. Kikuchi and Y.Higuchi
  • 学会等名: 7th International Conference on Structural Genomics 2013
  • 発表場所: 京王プラザホテル札幌（北海道）
• [学会発表] シトクロムc3ネットワークの電気特性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 山口晴正，角田早，蔡徳七，平野義明，鈴木雅之，樋口芳樹，松本卓也
  • 学会等名: 第7回分子科学討論会
  • 発表場所: 京都テルサ（京都）
• [学会発表] AFMによるシトクロムc3分子の電気伝導測定 (2013)
  • 著者名/発表者名: 角田早，山口晴正，蔡徳七，平野義明，鈴木雅之，樋口芳樹，松本卓也
  • 学会等名: 第7回分子科学討論会
  • 発表場所: 京都テルサ（京都）
• [学会発表] 糖質加水分解酵素ファミリー45に属する担子菌由来エンドグルカナーゼの構造・機 能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 中村彰彦，石田卓也，伊中浩治，樋口芳樹，伏信進矢，五十嵐圭日子，鮫島正浩
  • 学会等名: 日本応用糖質科学会平成25年度大会（第62回）
  • 発表場所: 鹿児島大学（鹿児島）
• [学会発表] Preparation of single crystals of multi-copper oxidases suitable for neutron diffraction (2013)
  • 著者名/発表者名: M. Akter，小森博文，柴田直樹，庄村康人，櫻井 武，片岡邦重，樋口芳樹
  • 学会等名: 平成25年度日本結晶学会年会
  • 発表場所: 熊本大学（熊本）
• [学会発表] [NiFe]-ヒドロゲナーゼ成熟化タンパク質HypAの結晶化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 大川雄嗣，樋口芳樹，庄村康人
  • 学会等名: 平成25年度日本結晶学会年会
  • 発表場所: 熊本大学（熊本）
• [学会発表] 細胞接着分子プロトカドヘリン細胞外領域の結晶化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 吉田早希，平林敬浩，八木健，庄村康人，樋口芳樹
  • 学会等名: 平成25年度日本結晶学会年会
  • 発表場所: 熊本大学（熊本）
• [学会発表] NAD+還元型ヒドロゲナーゼの結晶学的研究 (2013)
  • 著者名/発表者名: 中川英恵，竹田翠，土生川真央，木平清人，柴田直樹
  • 学会等名: 平成25年度日本結晶学会年会
  • 発表場所: 熊本大学（熊本）
• [学会発表] 水銀化合物非存在下での野生型 Axin DIX-ドメイン (2013)
  • 著者名/発表者名: 勝谷拓也，柴田直樹，寺脇慎一，山本英樹，菊池章，樋口芳樹
  • 学会等名: 平成25年度日本結晶学会
  • 発表場所: 熊本大学（熊本）
• [学会発表] Catalytic cycle of cytochrome-c3 hydrogenase, a [NiFe]-hydrogenase (2012)
  • 著者名/発表者名: 八木達彦,樋口芳樹
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-14
• [学会発表] Structural Study of O_2-Tolerant [NiFe] Hydrogenase (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Higuchi
  • 学会等名: The 2nd International Conference on MEXT Project of Integrated Research on Chemical Synthesis
  • 発表場所: 愛知
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] [NiFe]ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の解明-放射光X線利用による精密構造化学- (2012)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹
  • 学会等名: 日本農芸化学会関西支部第477回講演会
  • 発表場所: 兵庫
  • 年月日: 2012-12-01
• [学会発表] [NiFe]ヒドロゲナーゼ成熟化因子HypE,HypFのX線結晶構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人,尹基石,西原宏史,樋口芳樹
  • 学会等名: 第49回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 愛知
  • 年月日: 2012-09-24
• [学会発表] 酸素耐性[NiFe]ヒドロゲナーゼの結晶構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人,尹基石,西原宏史,樋口芳樹
  • 学会等名: 酸素耐性[NiFe]ヒドロゲナーゼの結晶構造解析
  • 発表場所: 愛知
  • 年月日: 2012-06-22
• [学会発表] Computer-simulations Based Design of Nylonoligomer Hydrolase (2012)
  • 著者名/発表者名: Y.Shigeta, K. Kamiya, T. Baba, T. Matsui, M. Boero , N. Shibata,Y. Higuchi and S. Negoro
  • 学会等名: 3rd Symposium on Enzymes & Biocatalysis
  • 発表場所: Xian (China)
  • 招待講演
• [学会発表] Polymerization and Peroxidase Activity Enhancement of Cytochrome c by Successive Domain Swapping at the C-Terminal Helix (2012)
  • 著者名/発表者名: S. Hirota, Y. Hattori, Z. Wang, S. Nagao, M. Taketa, H. Komori, H. Kamikubo, T. Matsuo, I. Takahashi, S. Negi, Y. Sugiura, M. Kataoka, Y. Higuchi
  • 学会等名: IEEE International Conference on Computational Photography
  • 発表場所: Seattle (USA)
• [学会発表] 好熱菌由来シトクロムc-552 2量体の構造と熱安定性 (2012)
  • 著者名/発表者名: 林有吾，長尾聡，大須賀久織，小森博文，樋口芳樹，廣田俊
  • 学会等名: 第39回分子科学討論会
  • 発表場所: 東北大学（宮城）
• [学会発表] ドメインスワッピングによるミオグロビン二量体の形成 (2012)
  • 著者名/発表者名: 長尾 聡，宇仁武史，山田卓矢，大須賀久織，庄村康人，今井清博，樋口芳樹，廣田 俊
  • 学会等名: 第39回分子科学討論会
  • 発表場所: 東北大学（宮城）
• [学会発表] 微小重力環境下でのナイロン分解酵素の高品質結晶生成の実例と今後の取り組みについて (2012)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹，柴田直樹，根来誠司
  • 学会等名: 第12回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場（愛知）
  • 招待講演
• [学会発表] 酸素耐性［ NiFe］ヒドロゲナーゼの結晶構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 庄村 康人，尹 基石，西原 宏史，樋口 芳樹
  • 学会等名: 第12回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場（愛知）
  • 招待講演
• [学会発表] Polymerization and Peroxidase Activity Enhancement of Cytochrome c by Successive Domain Swapping at the C-Terminal Helix (2012)
  • 著者名/発表者名: S. Hirota, Y. Hattori, Z. Wang, S. Nagao, M. Taketa, H. Komori, H. Kamikubo, T. Matsuo, I. Takahashi, S. Negi, Y. Sugiura, M. Kataoka, Y. Higuchi
  • 学会等名: International Conference on Porphyrins and Phthalocyanins
  • 発表場所: Pusan (Korea)
  • 招待講演
• [学会発表] ヒト由来ヒスチジンデカルボキシラーゼの基質特異性と触媒機構の研究 (2012)
  • 著者名/発表者名: 新田陽子，小森博文，樋口芳樹，植野洋志
  • 学会等名: 日本生物高分子学会2012年度年会
  • 発表場所: カレッジプラザ（秋田）
• [学会発表] [NiFe]ヒドロゲナーゼ成熟化因子HypE，HypFのX線結晶構造解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 庄村 康人，尹 基石，西原 宏史，樋口 芳樹
  • 学会等名: 第49回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 名古屋大学（愛知）
• [学会発表] An attempt to solve the ultra-high resolution crystal structures of nylon-oligomer hydrol ases using the crystals grown in space (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Higuchi, N. Shibata, K. Nagai, Y. Kawashima and S. Negoro
  • 学会等名: 14th International Conference on the Crystallization of Biological Macromolecules
  • 発表場所: Huntsville (USA)
• [学会発表] X 線照射によるマルチ銅活性中心の構造変化 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小森博文，片岡邦重，櫻井武，宮崎健太郎，樋口芳樹
  • 学会等名: 平成24年度日本結晶学会年会
  • 発表場所: 東北大学（宮城）
• [学会発表] Wnt シグナル伝達経路で機能するDIX ドメインを介した相互作用の構造生物学 (2012)
  • 著者名/発表者名: 勝谷拓也，寺脇慎一，柴田直樹，山本英樹，Marc Fiedler ，Mariann Bienz，菊池 章，樋口芳樹
  • 学会等名: 平成24年度日本結晶学会年会
  • 発表場所: 東北大学（宮城）
• [学会発表] [NiFe]ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の解明 －放射光X線利用による精密構造化学－ (2012)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹
  • 学会等名: 日本農芸化学会関西支部 第477回講演会
  • 発表場所: 神戸大学（兵庫）
  • 招待講演
• [学会発表] Structural Study of O2-Tolerant [NiFe] Hydrogenase (2012)
  • 著者名/発表者名: Y. Higuchi
  • 学会等名: The 2nd International Conference on MEXT Project of Integrated Research on Chemical Synthesis
  • 発表場所: 名古屋大学（愛知）
  • 招待講演
• [学会発表] Catalytic cycle of cytochrome-c3 hydrogenase, a [NiFe]-hydrogenase (2012)
  • 著者名/発表者名: 八木達彦，樋口芳樹
  • 学会等名: 第85回日本生化学会大会
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡）
• [学会発表] Reaction Mechanism of S-Carbamoylation of HypE by HypF in the Maturation of [NiFe]-hydrogenas
  • 著者名/発表者名: Y. Higuchi and Y. Shomura
  • 学会等名: 10th International Hydrogenase Conference
  • 発表場所: Szeged (Hungry)
  • 招待講演
• [学会発表] αフルオロメチルヒスチジンによるヒスタミン合成酵素の阻害機構の解明
  • 著者名/発表者名: 小森博文，新田陽子，植野洋志，樋口芳樹
  • 学会等名: 第86回日本生化学大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川）
• [学会発表] AFM によるシトクロムc3分子の電気伝導測定
  • 著者名/発表者名: 角田早，山口晴正，蔡徳七，平野義明，鈴木雅之，樋口芳樹，松本卓也
  • 学会等名: 第 74 回応用物理学会
  • 発表場所: 同志社大学（京都）
• [学会発表] シトクロムc3ネットワークの電気特性
  • 著者名/発表者名: 山口晴正，角田早，蔡徳七，平野義明，鈴木雅之，樋口芳樹，松本卓也
  • 学会等名: 第 74 回応用物理学会
  • 発表場所: 同志社大学（京都）
• [学会発表] 水素-化学エネルギー変換・ヒドロゲナーゼの構造化学
  • 著者名/発表者名: 中川英恵、竹田翠、庄村康人、樋口芳樹
  • 学会等名: 兵庫県立大学シンポジウム
  • 発表場所: 神戸市産業振興センター（兵庫）
• [学会発表] 水素分解酵素の成熟化機構の解明
  • 著者名/発表者名: 大川雄嗣、樋口芳樹、庄村康人
  • 学会等名: 兵庫県立大学シンポジウム
  • 発表場所: 神戸市産業振興センター（兵庫）
• [学会発表] 超好熱菌由来シトクロムcの多量化と二量体構造
  • 著者名/発表者名: 山中優，長尾聡，羽田正雄，小森博文，樋口芳樹，廣田俊
  • 学会等名: 第7回バイオ関連シンポジウム（日本化学会）
  • 発表場所: 名古屋大学豊田講堂（愛知）
• [学会発表] ヒスタミン合成酵素の構造解析
  • 著者名/発表者名: 小森博文，新田陽子，植野洋志，樋口芳樹
  • 学会等名: 平成25年度日本結晶学会
  • 発表場所: 熊本大学（熊本）
• [学会発表] Formation of Domain-Swapped Oligomeric Cytochrome c from Its Molten Globule State
  • 著者名/発表者名: M. S. Deshpande, P. P. Parui, M. Yamanaka, S. Nagao, H. Kamikubo, M. Kataoka, H. Komori, Y. Higuchi and S. Hirota
  • 学会等名: 第51回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 国立京都国際会館（京都）
• [学会発表] X-ray Structural Study of O2-tolerant [NiFe] hydrogenase
  • 著者名/発表者名: Y. Higuchi, K.-S. Yoon, H. Nishihara and Y. Shomura
  • 学会等名: International Conference on Bio/Mimetic Solar Energy Conversion (iSEC)
  • 発表場所: 大阪市立大学（大阪）
  • 招待講演
• [学会発表] Polymerization and Oligomerization of Cytochrome c and Myoglobin by Domain Swapping
  • 著者名/発表者名: S. Hirota, S. Nagao, Y. Hayashi, Z. Wang, A. D. Nugraheni and Y. Higuchi
  • 学会等名: 12th International Symposium on Applied Bioinorganic Chemistry
  • 発表場所: Guangzhou (China)
  • 招待講演
• [学会発表] 逆行性輸送因子による積荷認識の構造的基盤
  • 著者名/発表者名: 寺脇慎一，大塚寛貴，樋口芳樹，若松馨
  • 学会等名: 第29回PFシンポジウム
  • 発表場所: つくば国際会議場エポカル（茨城）
• [学会発表] H. thermoluteolus TH-1由来NAD+還元ヒドロゲナーゼの分光学研究
  • 著者名/発表者名: 太虎林，竹田翠，庄村康人，西川幸志，鈴木雅之，樋口芳樹，廣田俊
  • 学会等名: 日本化学会第94春季年会
  • 発表場所: 名古屋大学東山キャンパス（愛知）
• [学会発表] 超好熱菌由来シトクロムcのドメインスワッピング
  • 著者名/発表者名: 山中優，長尾聡，小森博文，樋口芳樹，廣田俊
  • 学会等名: 日本化学会第94春季年会
  • 発表場所: 名古屋大学東山キャンパス（愛知）
• [学会発表] 大腸菌膜との相互作用によるシトクロムcの多量化
  • 著者名/発表者名: 林有吾，長尾聡，山中優，小森博文，樋口芳樹，廣田俊
  • 学会等名: 日本化学会第94春季年会
  • 発表場所: 名古屋大学東山キャンパス（愛知）
• [図書] CSJカレントレビュー15,次世代のバイオ水素エネルギー開発 (2014)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人,樋口芳樹
  • 総ページ数: 174
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 光合成のエネルギー利用と環境応用(三宅淳,佐々健監修) (2014)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹,ヒドロゲナーゼ
  • 出版者: CMC出版
• [図書] CSJカレントレビュー15，次世代のバイオ水素エネルギー開発 (2014)
  • 著者名/発表者名: 庄村康人，樋口芳樹
  • 総ページ数: 174
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 光合成のエネルギー利用と環境応用 (2014)
  • 著者名/発表者名: 樋口芳樹
  • 総ページ数: 308
  • 出版者: CMC出版