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コアプロモーター認識因子の選択によるmRNA運命決定機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 24657119
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 分子生物学
研究機関横浜市立大学

研究代表者

古久保 哲朗  横浜市立大学, 生命医科学研究科, 教授 (10271587)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2014年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2013年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2012年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
キーワードtranscription / TFIID / SAGA / mRNA / cyclin / gene regulation / cell morphogenesis / GTF / 転写調節 / 転写因子 / TBP / 局所翻訳制御 / 出芽酵母 / TAF
研究成果の概要

基本転写因子TFIIDはTBPと14種類のTAFから構成される巨大な複合体であり、SAGAとともにコアプロモーター上で働き、TBP-DNA相互作用を制御することによって転写の活性化を行う。最近我々は、同一のプロモーターからTFIIDまたはSAGAによって転写されるCLN2 mRNAが機能の異なる二種類のCln2pに翻訳される可能性を示した。本研究では、さらに解析を進め、①TFIID内部のTBP制御領域TANDが、CLN2 mRNAの作り分けに関与すること、②CLN2 mRNA[SAGA]がRAMシグナル経路とSsd1pによる局所翻訳制御を受けることを強く示唆する結果を得たので、以下に報告する。

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2015 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 4件、 謝辞記載あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] The physical size of transcription factors is key to transcriptional regulation in chromatin domains.2015

    • 著者名/発表者名
      Kazuhiro Maeshima, Kazunari Kaizu, Sachiko Tamura, Tadasu Nozaki, Tetsuro Kokubo, Koichi Takahashi.
    • 雑誌名

      J. Phys.: Condens. Matter

      巻: 27 号: 6 ページ: 064116-064116

    • DOI

      10.1088/0953-8984/27/6/064116

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Both HMG boxes in Hmo1 are essential for DNA binding in vitro and in vivo.2015

    • 著者名/発表者名
      A. Higashino, Y. Shiwa, H. Yoshikawa, T. Kokubo, K. Kasahara
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      巻: 79(3) 号: 3 ページ: 384-393

    • DOI

      10.1080/09168451.2014.978258

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] High-resolution structure of TBP with TAF1 reveals anchoring patterns in transcriptional regulation2013

    • 著者名/発表者名
      Anandapadamanaban M, Andresen C, Helander S, Ohyama Y, Siponen MI, Lundström P, Kokubo T, Ikura M, Moche M, Sunnerhagen M
    • 雑誌名

      Nat Struct Mol Biol

      巻: 20(8) 号: 8 ページ: 1008-14

    • DOI

      10.1038/nsmb.2611

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transcription in Eukaryote (review)2013

    • 著者名/発表者名
      T. Kokubo
    • 雑誌名

      Encyclopedia of Systems Biology

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Transcription Initiation in Eukaryote (review)2013

    • 著者名/発表者名
      T. Kokubo
    • 雑誌名

      Encyclopedia of Systems Biology

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Mechanisms of Transcriptional Activation and Repression (review)2013

    • 著者名/発表者名
      T. Kokubo
    • 雑誌名

      Encyclopedia of Systems Biology

      巻: in press

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Identification and recombinant analysis of botrocetin-2, a snake venom cofactor for von Willebrand factor-induced platelet agglutination2012

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto-Suzuki Y, Sakurai Y, Fujimura Y, Matsumoto M, Hamako J, Kokubo T, Kitagawa H, Kawsar SMA, Fujii Y, Ozeki Y, Matsushita F, Matsui T
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 51 号: 26 ページ: 5329-5338

    • DOI

      10.1021/bi300442c

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 出芽酵母においてgal2 変異とミトコンドリア機能阻害が誘起するガラクトース培地特異的な生育阻害効果2014

    • 著者名/発表者名
      岩見亮, 大山良文, 高井直樹, 古久保哲朗
    • 学会等名
      日本分子生物学会第37回年会
    • 発表場所
      横浜(パシフィコ横浜)
    • 年月日
      2014-11-26
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ハイスループット型レポーターシステムを用いた出芽酵母由来の新規コアプロモーターエレメントの同定及びその機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      渡邉清, 矢部誠, 古久保哲朗
    • 学会等名
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      横浜(横浜産貿ホール )
    • 年月日
      2014-06-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] 出芽酵母におけるTFIIDを介したGAL遺伝子群の脱抑制機構

    • 著者名/発表者名
      矢部 誠,大山 良文,高井 直樹,古久保 哲朗
    • 学会等名
      日本分子生物学会第36回年会
    • 発表場所
      神戸(ポートピアホテル)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] リボソーム構成因子の発現調節に関わる酵母Hmo1タンパク質のDNA 結合機構

    • 著者名/発表者名
      東野 綺子,雲財 悟,中山 理紗,土屋 奈穂,吉川 博文,古久保 哲朗,笠原 浩司
    • 学会等名
      日本分子生物学会第36回年会
    • 発表場所
      神戸(ポートピアホテル)
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] 母性mRNAの3’非翻訳領域を標的としたアンチセンスモルフォリノオリゴによるpoly(A)鎖短小化機構の解析

    • 著者名/発表者名
      茂呂華奈子
    • 学会等名
      日本分子生物学会第35回年会
    • 発表場所
      福岡
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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