レトロトランスポゾン挿入配列によるｍＲＮＡの局在・代謝制御機構の解析

• 研究課題/領域番号: 24657123
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 分子生物学
• 研究機関: 独立行政法人理化学研究所
• 研究代表者: 中川 真一 独立行政法人理化学研究所, 中川RNA生物学研究室, 准主任研究員 (50324679)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円); 2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2013年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2012年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
• キーワード: ノンコーディングRNA / レトロトランスポゾン / 4.5SH / 核 / SINE B2 / NF110 / CRISPR-Cas9

研究成果の概要

mRNAの非翻訳領域のレトロトランスポゾン挿入配列の機能を調べるために、レトロトランスポゾンSINE B1と高い相同性を持つ核内ノンコーディングRNA、4.5SHに注目した解析を行った。SINE B1がアンチセンス方向に挿入された転写産物は4.5SHと核内で二本鎖RNA構造を形成し、核内に繋留されていた。4.5SHをノックダウンすると、アンチセンス挿入SINE B1を持つ転写産物の核内繋留が解除された。また、4.5SHを介した核内繋留には二本鎖RNA結合蛋白質であるNF110が必要であった。これらの結果から、分子間二本鎖RNA構造形成による新規遺伝子発現制御機構を明らかとなった。

研究成果

• [雑誌論文] Analysis of the subcellular distribution of RNA by fluorescence in situ hybridization. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa S.
  • 雑誌名: Methods Mol Biol. 巻: 1206 ページ: 107-122
  • DOI: 10.1007/978-1-4939-1369-5_10
  • ISBN: 9781493913688, 9781493913695
  • 査読あり
• [雑誌論文] レトロトランスポゾン配列を介して形成される二本鎖 RNA による遺伝子発現制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 石田賢太郎、中川真一
  • 雑誌名: 細胞工学 巻: 34 ページ: 38-42
• [雑誌論文] Formation of nuclear bodies by the lncRNA Gomafu-associating proteins Celf3 and SF1 (2014)
  • 著者名/発表者名: Ishizuka, A., Hasegawa, Y., Ishida, K., Yanaka, K. & Nakagawa, S
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 19 号: 9 ページ: 704-721
  • DOI: 10.1111/gtc.12169
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Nuclear lncRNAs as epigenetic regulators-beyond skepticism. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakagawa, S., Kageyama, Y.
  • 雑誌名: Biochim. Biophys. Acta. 巻: 1839 号: 3 ページ: 215-222
  • DOI: 10.1016/j.bbagrm.2013.10.009
  • 査読あり
• [学会発表] A novel mechanism of batch gene regulation by nuclear noncoding RNA 4.5SH (2014)
  • 著者名/発表者名: Shinichi Nakagawa
  • 学会等名: Keystone Symposia
  • 発表場所: Santa Fe USA
• [学会発表] 4.5SH RNAによる核内繋留を介した遺伝子発現制御におけるdsRNA 結合タンパク質Ilf3 の役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 石田賢太郎、中川真一
  • 学会等名: 日本RNA学会
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] 核内ノンコーディング RNA Gomafu は新規核内構造体であるCelf3/SF1体と相互作用する (2012)
  • 著者名/発表者名: 石塚明、長谷川優子、中川真一
  • 学会等名: 日本分子生物学会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] Functional analyses of abundant nuclear long noncoding RNAｓ
  • 著者名/発表者名: 中川 真一
  • 学会等名: Ribo Club 14th Annual Meeting
  • 発表場所: Quebec Canada
  • 招待講演
• [学会発表] レトロトランスポゾンSINE B1と相同配列を持つ核内ノンコーディングRNAによるグローバルな遺伝子発現制御
  • 著者名/発表者名: 中川 真一
  • 学会等名: 日本遺伝学会第85回大会
  • 発表場所: 慶応日吉キャンパス(東京）
  • 招待講演
• [図書] mRNA非翻訳領域のレトロトランスポゾン挿入配列による転写後遺伝子発現制御 (2013)
  • 著者名/発表者名: 中川 真一
  • 出版者: 実験医学