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環境細菌の極貧有機炭素源環境下での生育を司る機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 24658068
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 応用微生物学
研究機関東北大学

研究代表者

永田 裕二  東北大学, 生命科学研究科, 准教授 (30237531)

研究分担者 津田 雅孝  東北大学, 大学院生命科学研究科, 教授 (90172022)
大坪 嘉行  東北大学, 大学院生命科学研究科, 助教 (40342761)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
2012年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード炭酸固定 / 独立栄養細菌 / 環境細菌 / 極貧有機炭素源環境 / 微生物機能開発
研究概要

典型的な好気性従属栄養環境細菌Sphingobium japonicum UT26株でadhX遺伝子が高発現すると大気中のCO2を取り込みながら炭素源非添加無機培地で生育可能となる現象を見出した。さらに、adhX高発現株のトランスポゾン変異株ライブラリーの解析により、ピルビン酸/リン酸ジカイネース、アセチルCoAシンテターゼ、イソクエン酸リアーゼをコードすると推定される遺伝子が本表現型に必須であることを明らかにし、UT26株の全ゲノム配列情報も利用して、PPCによるCO2固定を伴うグリオキシル酸回路が超低栄養条件下での同化過程として機能している可能性が高いという重要な知見を得た。

報告書

(3件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (85件)

すべて 2014 2013 2012

すべて 雑誌論文 (18件) (うち査読あり 18件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (63件) (うち招待講演 5件) 図書 (4件)

  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of Pseudomonas sp. Strain TKP, Isolated from a gamma-Hexachlorocyclohexane-Degrading Mixed Culture2014

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Y, Kishida K, Sato T, Tabata M, Kawasumi T, Ogura Y, Hayashi T, Tsuda M, Nagata Y
    • 雑誌名

      Genome announcements

      巻: 2 号: 1

    • DOI

      10.1128/genomea.01241-13

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of the thermophilic PCB degrader Geobacillus sp. JF8 (NBRC 109937)2014

    • 著者名/発表者名
      Shintani, M., Y. Ohtsubo, K. Fukuda, A. Hosoyama, S. Ohji, A. Yamazoe, N. Fujita, Y. Nagata, M. Tsuda, T. Hatta, and K. Kimbara
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 2 号: 1

    • DOI

      10.1128/genomea.01213-13

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa MTB-1 isolated from a microbial community enriched by the technical formulation of hexachlorocyclohexane.2014

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo, Y., T. Sato, K. Kishida, M. Tabata, Y. Ogura, T. Hayashi, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 2 号: 1

    • DOI

      10.1128/genomea.01130-13

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Design and experimental application of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes2013

    • 著者名/発表者名
      Mori H, Maruyama F, Kato H, Toyoda A, Dozono A, Ohtsubo Y, Nagata Y, Fujiyama A, Tsuda M Kurokawa K
    • 雑誌名

      DNA Res

      巻: 21 号: 2 ページ: 217-227

    • DOI

      10.1093/dnares/dst052

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of Ralstonia pickettii DTP0602, a 2,4,6-Trichlorophenol Degrader2013

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Y, Fujita N, Nagata Y, Tsuda M, Iwasaki T, Hatta T.
    • 雑誌名

      Genome Announcements

      巻: 1 号: 6

    • DOI

      10.1128/genomea.00903-13

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Inhibitory effect of Pseudomonas putida nitrogen-related phosphotransferase system on conjugative transfer of IncP-9 plasmid from Escherichia coli2013

    • 著者名/発表者名
      Inoue K, Miyazaki R, Ohtsubo Y, Nagata Y, Tsuda M
    • 雑誌名

      FEMS microbiology letters

      巻: 345 号: 2 ページ: 102-109

    • DOI

      10.1111/1574-6968.12188

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete Genome Sequence of the γ-Hexachlorocyclohexane-Degrading Bacterium Sphingomonas sp. Strain MM-1.2013

    • 著者名/発表者名
      Tabata M, Ohtsubo Y, Ohhata S, Tsuda M, Nagata Y.
    • 雑誌名

      Genome Announc

      巻: 1 号: 3

    • DOI

      10.1128/genomea.00247-13

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure and site-directed mutagenesis analyses of haloalkane dehalogenase LinB from Sphingobium sp. MI1205.2013

    • 著者名/発表者名
      Masahiko Okai, Jun Ohtsuka, Fabiana L. Imai, Tomoko Mase, Ryota Moriuchi, Masataka Tsuda, Koji Nagata, Yuji Nagata, Masaru Tanokura
    • 雑誌名

      J. Bacteriol.

      巻: 195 号: 11 ページ: 2642-2651

    • DOI

      10.1128/jb.02020-12

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 機能相補による芳香族化合物複合汚染土壌からの新規分解酵素遺伝子の検索2013

    • 著者名/発表者名
      永山浩史、菅原智詞、遠藤諒、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • 雑誌名

      Journal of Environmental Biotechnology

      巻: 13(1) ページ: 51-56

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The effect of a unique halide-stabilizing residue on the catalytic properties of haloalkane dehalogenase DatA from Agrobacterium tumefacience C582013

    • 著者名/発表者名
      Hassan, K. A. Gora, J. Brezvsky, R. Chaloupkova, H. Moskalikova, A. Fortova, Y. Nagata, J. Damborsky, Z. Prokop
    • 雑誌名

      FEBS J.

      巻: 280 号: 13 ページ: 3149-3159

    • DOI

      10.1111/febs.12238

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Coinetgrate-resolution of toluene-catabolic transposon Tn46512013

    • 著者名/発表者名
      Yano, H., H. Genka, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, E.M. Top, M. Tsuda
    • 雑誌名

      Plasmid

      巻: 69 号: 1 ページ: 24-35

    • DOI

      10.1016/j.plasmid.2012.07.004

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complete genome sequence of Acidovorax sp. KKS102, a polychlorinated biphenyl-degrading strain2012

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo, Y., F. Maruyama, H. Mitsui, Y. Nagata, M. Tsuda
    • 雑誌名

      J Bacteriol

      巻: 194 号: 24 ページ: 6970-6971

    • DOI

      10.1128/jb.01848-12

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ParI, an orphan ParA family protein from Pseudomonas putida KT2440-specific genomic island, interferes with the partition system of IncP-7 plasmids2012

    • 著者名/発表者名
      Miyakoshi, M., M. Shintani, K. Inoue, T. Terabayashi, F. Sai, M. Ohkuma, H. Nojiri, Y. Nagata, M. Tsuda
    • 雑誌名

      Environ Microbiol

      巻: 14 号: 11 ページ: 2946-2959

    • DOI

      10.1111/j.1462-2920.2012.02861.x

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the haloalkane dehalogenase DatA from Agrobacterium tumefaciens C582012

    • 著者名/発表者名
      Mase, T., H. Yabuki, M. Okai, J. Ohtsuka, F. L. Imai, Y. Nagata, and M. Tanokura
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section F

      巻: F68 号: 6 ページ: 652-654

    • DOI

      10.1107/s1744309112013942

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conjugal transfer of polychlorinated biphenyl/biphenyl degradation genes in Acidovorax sp. strain KKS102, which are located on an integrative and conjugative element2012

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Y., Y. Ishibashi, H. Naganawa, S. Hirokawa, S. Atobe, Y. Nagata, M. Tsuda
    • 雑誌名

      J Bacteriol

      巻: 194 号: 16 ページ: 4237-4248

    • DOI

      10.1128/jb.00352-12

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Suppression of pleiotrophic phenotypes of Burkholderia multivorans fur mutant by oxyR mutation2012

    • 著者名/発表者名
      Kimura, A., S. Yuhara, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • 雑誌名

      Microbiology

      巻: 158 号: 5 ページ: 1284-1293

    • DOI

      10.1099/mic.0.057372-0

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Povotal role of anthranilate dioxygenase genes in the adaptation of Burkholderia multivorans ATCC17616 in soil2012

    • 著者名/発表者名
      Nishiyama, E., Y. Ohtsubo, Y. Yamamoto, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • 雑誌名

      FEMS Microbiology Letters

      巻: 330 号: 1 ページ: 46-55

    • DOI

      10.1111/j.1574-6968.2012.02532.x

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cloning ofγ-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase gene with its flanking regions from soil byactivity-based screening techniques2012

    • 著者名/発表者名
      Ito, M., A. Ono, Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • 雑誌名

      European J. Soil Biology

      巻: 52 ページ: 16-19

    • DOI

      10.1016/j.ejsobi.2012.05.001

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤分解能を有するスフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機寒天培地での生育を司る機構に関する研究2014

    • 著者名/発表者名
      永田裕二,平野丈,宇井博紀,大坪嘉行,津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京(口頭発表)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Finishしたゲノム配列のチェックツール: FinishChecker2014

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Mycobacterium属細菌のフェナントレン分解能に対する非分解菌の効果2014

    • 著者名/発表者名
      小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ナフタレン分解プラスミドNAH7のoriTの同定と宿主域の解析2014

    • 著者名/発表者名
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 土壌微生物の移植メタゲノム2014

    • 著者名/発表者名
      加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 永山浩史, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
    • 学会等名
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Burkholderia multivoransのFurを介した転写制御機構の解明2014

    • 著者名/発表者名
      佐藤拓哉, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] gamma-HCH分解能を有するsphingomonad細菌株における可動性遺伝因子を介したゲノム動態の解析2014

    • 著者名/発表者名
      大畑智史, 田端理朗, 荷川取佑記, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] フェナントレン分解コンソーシアムにおける非分解優占種細菌の役割2014

    • 著者名/発表者名
      小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] IncP-9群NAH7のoriTの同定と接合伝達宿主域に関する研究2014

    • 著者名/発表者名
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Acidvorax sp KKS102のカタボライト調節機構に関わる二成分制御系遺伝子bphPQの解析2014

    • 著者名/発表者名
      佐藤旦, 小沼かおり, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur依存的な鉄恒常性維持に関与するhemP遺伝子の解析2014

    • 著者名/発表者名
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] FinishChecker: 完全決定したつもりのゲノム配列のチェック機能2014

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解能を有するスフィンゴモナッド細菌群の挿入配列に関する研究2014

    • 著者名/発表者名
      荷川取佑記, 大畑智史, 田端理朗, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 芳香族化合物汚染化土壌メタゲノムから培養非依存的手法により取得したフェノール分解関与遺伝子群の機能解析2014

    • 著者名/発表者名
      永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤分解能を有するスフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機寒天培地での生育を司る機構に関する研究2014

    • 著者名/発表者名
      永田裕二, 平野丈, 宇井博紀, 大坪嘉行, 津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 累積置換変異導入によるハロアルカンデハロゲナーゼLinBのbeta-HCH分解活性の機能進化に関する研究2013

    • 著者名/発表者名
      永田裕二,森内良太,田中裕興,大坪嘉行,津田雅孝
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • 発表場所
      北九州(口頭発表)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 人為起源物質分解細菌の出現と進化2013

    • 著者名/発表者名
      永田裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会第20回記念フロンティアシンポジウム
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013

    • 著者名/発表者名
      永田裕二、田端理朗、大畑智史、大坪嘉行、津田雅孝
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      東北大学(仙台)(口頭発表)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 人為起源物質分解能を有するsphingomonad細菌群のゲノムと可動性遺伝因子2013

    • 著者名/発表者名
      永田裕二、大畑智史、田端理朗、大坪嘉行、津田雅孝
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会
    • 発表場所
      長浜バイオ大学(長浜)(口頭発表)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 累積置換変異導入によるハロアルカンデハロゲナーゼLinBのbeta-HCH分解活性の機能進化に関する研究2013

    • 著者名/発表者名
      永田裕二, 森内良太, 田中裕興, 大坪嘉行, 津田雅孝
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • 発表場所
      北九州
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 機能発現に基づくメタゲノムライブラリーからの新規芳香族化合物分解酵素遺伝子の取得と解析2013

    • 著者名/発表者名
      永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • 発表場所
      北九州
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定及び接合伝達関連遺伝子traFの解析2013

    • 著者名/発表者名
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • 発表場所
      北九州
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013

    • 著者名/発表者名
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • 発表場所
      北九州
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定とtraF欠失による宿主域変化2013

    • 著者名/発表者名
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      第7回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会
    • 発表場所
      静岡県駿東郡
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Burkholderia multivorans ATCC17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013

    • 著者名/発表者名
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • 学会等名
      第7回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会
    • 発表場所
      静岡県駿東郡
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 土壌微生物の他土壌への移植メタゲノミクス2013

    • 著者名/発表者名
      加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
    • 学会等名
      第29回日本微生物生態学会年次大会
    • 発表場所
      鹿児島
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Isolation of phenol-catabolic genes by cultivation-independent functional screening from metagenome of soil artificially polluted by aromatic hydrocarbons2013

    • 著者名/発表者名
      Hirofumi Nagayama, Tomonori Sugawara, Ryo Endo, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Hiroshi Mori, Ken, Kurokawa, and Masataka Tsuda
    • 学会等名
      2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
    • 発表場所
      Braunschweig, German
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Design and experimental validation of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes2013

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Mori, Fumito Maruyama, Hiromi Kato, Atsushi Toyoda, Ayumi Dozono, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Asao Fujiyama, Masataka Tsuda, and Ken Kurokawa
    • 学会等名
      2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
    • 発表場所
      Braunschweig, German
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] リダクターゼ機能相補による新規芳香族化合物分解酵素遺伝子の芳香族化合物複合汚染土壌メタゲノムからの探索2013

    • 著者名/発表者名
      永山浩史ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC17616株におけるFurの機能及び発現制御機構の解析2013

    • 著者名/発表者名
      佐藤拓哉ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] gamma-HCH分解能を示すSphingobium属細菌のTKS株とMI1205株の全ゲノム配列決定とgamma-HCH分解関与遺伝子群周辺領域の解析2013

    • 著者名/発表者名
      大畑智史ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 人為起源物質分解能を有するsphingomonad細菌群のゲノムと可動性遺伝因子2013

    • 著者名/発表者名
      永田裕二ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Finishing関連の3つのツール: GenoFinisher、AceFileViewer、ShortReadManager2013

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] IncP-9群プラスミドNAH7の接合伝達開始配列の解析2013

    • 著者名/発表者名
      岸田康平ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 次世代シーケンサーによる土壌細菌の環境適応遺伝子の新規探索手法 の開発2013

    • 著者名/発表者名
      石橋蓉子ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 撹乱に対する土壌微生物のレジリエンス2013

    • 著者名/発表者名
      加藤広海ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 細菌群集動態のモデリング2013

    • 著者名/発表者名
      伊藤貴広ら
    • 学会等名
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      長浜
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 芳香族化合物複合汚染土壌における新規芳香族化合物分解酵素遺伝子の機能相補に基づく探索2013

    • 著者名/発表者名
      永山浩史ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013

    • 著者名/発表者名
      永田裕二ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] ハロアルカンデハロゲナーゼ DatAの立体構造解析2013

    • 著者名/発表者名
      管 立軍ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 多様な細菌のゲノム上に存在するハロアルカンデハロゲナーゼの機能解析2013

    • 著者名/発表者名
      田中裕興ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] IncP-9群 NAH7接合伝達系のoriTを中心とした解析2013

    • 著者名/発表者名
      岸田康平ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] フィニッシング支援ツールGenoFinisherとAceFileViewer2013

    • 著者名/発表者名
      大坪嘉行ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] γ-HCH分解細菌Sphingomonas sp. MM-1株が有する多重プラスミドに関する研究2013

    • 著者名/発表者名
      田端理朗ら
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年大会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 人為起源物質分解細菌の出現と進化2013

    • 著者名/発表者名
      永田裕二
    • 学会等名
      日本農芸化学会 第20回記念フロンティアシンポジウム
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2012

    • 著者名/発表者名
      永田裕二,田端理朗,大畑智史,大坪嘉行,津田雅孝
    • 学会等名
      第64回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      神戸(口頭発表)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Nagata, M. Tabata, S. Ohhata, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
    • 学会等名
      15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS 2012)
    • 発表場所
      Daegu, Korea(口頭発表)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 細菌の有機塩素系殺虫剤分解資化能力を支えるABCトランスポーター2012

    • 著者名/発表者名
      永田裕二、遠藤諒、大坪嘉行、津田雅孝
    • 学会等名
      第7回トランスポーター研究会年会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Metagenomic Analysis of Microbial Community in Soil Contaminated with Aromatic Pollutants2012

    • 著者名/発表者名
      M. Tsudaら
    • 学会等名
      Japan-Finland Biotechnology Symposium 2012
    • 発表場所
      Sendai, Japan
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 環境汚染物質gamma-hexachlorocyclohexaneの分解能を有するSphingobium sp. TKS株のゲノム構造の解明2012

    • 著者名/発表者名
      大畑智史ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2012年度大会
    • 発表場所
      宇治
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 培養非依存的手法を用いた芳香族化合物複合汚染土壌からの新規分解酵素遺伝子の探索2012

    • 著者名/発表者名
      永山浩史ら
    • 学会等名
      環境バイオテクノロジー学会2012年度大会
    • 発表場所
      宇治
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 細菌由来のβ-ヘキサクロロシクロヘキサン (β-HCH) 分解酵素linB_MIを導入したカボチャ毛状根のβ-HCH分解能の解析2012

    • 著者名/発表者名
      七里吉彦ら
    • 学会等名
      第30回 日本植物細胞分子生物学会 (生駒) 大会・シンポジウム
    • 発表場所
      奈良県生駒市
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Response of soil microbial community against pulse perturbation by aromatic pollutants2012

    • 著者名/発表者名
      H. Kato et al.
    • 学会等名
      14th International Symposium on Microbial Ecology
    • 発表場所
      Copenhagen, Denmark
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Multiple plasmids of γ-hexachlorocylohexane-degrading bacterium Sphingomonas sp. MM-12012

    • 著者名/発表者名
      M. Tabata et al.
    • 学会等名
      International Plasmid Biology Conference 2012
    • 発表場所
      Santander, Spain
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Relationship between intergeneric conjugative transfer of plasmid NAH7 and nitrogen-related phosphotransferase system2012

    • 著者名/発表者名
      K. Inoue et al.
    • 学会等名
      International Plasmid Biology Conference 2012
    • 発表場所
      Santander, Spain
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Nagata et al.
    • 学会等名
      15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS 2012)
    • 発表場所
      Daegu, Korea
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Isolation of aromatic ring-hydroxylating oxygenase genes by cultivation-independent functional screening of metagenome from soil artificially contaminated with aromatic hydrocarbons2012

    • 著者名/発表者名
      H. Nagayama et al.
    • 学会等名
      15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS 2012)
    • 発表場所
      Daegu, Korea
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2012

    • 著者名/発表者名
      永田裕二ら
    • 学会等名
      第64回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 細菌ゲノムに存在する多様なハロアルカンデハロゲナーゼ遺伝子の機能解析2012

    • 著者名/発表者名
      田中裕興ら
    • 学会等名
      第64回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌が突然変異により炭素源非添加無機寒天培地上で生育可能となる機構の解析2012

    • 著者名/発表者名
      平野丈ら
    • 学会等名
      第64回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] ハロアルカンデハロゲナーセLinBのbeta-HCH分解活性に関する機能進化2012

    • 著者名/発表者名
      田中裕興ら
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会・第35回日本分子生物学会年会合同大会
    • 発表場所
      福岡
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Genetic analysis of multiple plasmids in γ-hexachlorocylohexane-degrading bacterium Sphingomonas sp. MM-12012

    • 著者名/発表者名
      M. Tabata et al.
    • 学会等名
      International Forum for Ecosystem Adaptability Science IV: Interface Between Policy and Science
    • 発表場所
      Sendai, Japan
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Analysis of nitrogen-related phosphotransferase system in recipient cells involved in regulation of conjugative transfer2012

    • 著者名/発表者名
      K. Inoue et al.
    • 学会等名
      International Forum for Ecosystem Adaptability Science IV: Interface Between Policy and Science
    • 発表場所
      Sendai, Japan
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [図書] Appearance and evolution ofγ-hexachlorocyclohexane-degrading bacteria. (In : Nojiri H, Tsuda M, Fukuda M, Kamagata Y (eds)) Biodegradative Bacteria.2014

    • 著者名/発表者名
      Nagata Y, Tabata M, Ohhata S, Tsuda M
    • 出版者
      Springer Verlag, Tokyo( doi:10.1007/978-4-431-54520-0_2)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems. (In : Nojiri H, Tsuda M, Fukuda M, Kamagata Y (eds) )Biodegradative Bacteria.2014

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Y, Nishiyama E, Ishibashi Y, Nagata Y, Tsuda M
    • 出版者
      Springer Verlag, Tokyo(doi:10.1007/978-4-431-54520-0_14)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [図書] Appearance and evolution of γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacteria. In Biodegradative Bacteria2014

    • 著者名/発表者名
      Nagata Y, Tabata M, Ohhata S, Tsuda M
    • 総ページ数
      358
    • 出版者
      Springer Verlag, Tokyo
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems. In Biodegradative Bacteria2014

    • 著者名/発表者名
      Ohtsubo Y, Nishiyama E, Ishibashi Y, Nagata Y Tsuda M
    • 総ページ数
      358
    • 出版者
      Springer Verlag, Tokyo
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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