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基部陸上植物の低い遺伝的冗長性を活用したシス-トランス転写制御システムの解明

研究課題

研究課題/領域番号 24658095
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 応用生物化学
研究機関京都大学

研究代表者

河内 孝之  京都大学, 生命科学研究科, 教授 (40202056)

連携研究者 石崎 公庸  京都大学神戸大学, 生命科学研究科理学研究科, 助教(24 年度)准教授(25 年度) (00452293)
西浜 竜一  京都大学, 生命科学研究科, 講師 (70283455)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2013年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
2012年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円)
キーワード転写因子 / ゼニゴケ / 陸上植物進化 / 植物発生 / 転写制御因子 / 苔類ゼニゴケ / 転写制御
研究概要

陸上植物進化の基部に位置するゼニゴケは、陸上植物としての基本的遺伝子セットを有している。進化的な位置づけと体制の単純さを反映し、制御系遺伝子の冗長性が低い。本研究ではゼニゴケ転写因子を網羅的に単離同定した。構造の特徴からグループ分けを行った。その結果、ゼニゴケには、シロイヌナズナの1/6にあたる約300の転写因子が存在すること、総数の少なさにも関わらずファミリーは同一の38種類であることが分かった。ゼニゴケは陸上植物の基本的な転写因子のセットを保有しながらも、遺伝的冗長性が極めて低いため、優れた実験系となりうることが示された。

報告書

(3件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (26件)

すべて 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (13件) (うち査読あり 13件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (11件) (うち招待講演 3件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Comparison of the MpEF1α and CaMV35 promoters for application in Marchantia polymorpha overexpression studies2014

    • 著者名/発表者名
      Althoff, F., Kopischke, S., Zobell, O., Ide, K., Ishizaki, K., Kohchi, T. and Zachgo, S.
    • 雑誌名

      Transgenic Research

      巻: 23 号: 2 ページ: 235-244

    • DOI

      10.1007/s11248-013-9746-z

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] COSTIMBOUS VASCPLAR RISG (COVI) is a trans-Golgi Network-Looulizde Membruoe Protein Pequirde for Golgi Morphology and Varuolur Protein Sorling2014

    • 著者名/発表者名
      Makoto Shirakawa, Haruko Heda. Yasuko Koumoto. Kentaro Fuji. Chiaki Nishiyama. Takayuki Kahchi, Ikuko Hara-Nishimura and Tomoo Shimado
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 55 号: 4 ページ: 764-772

    • DOI

      10.1093/pcp/pct195

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] CRISPR/Cas9 Mediated Targeted Mutagenesis in the Liverwort Marchantia polymorpha L.2014

    • 著者名/発表者名
      Shigeo S. Sugano, Makoto Shirakawa, Junpei Takagi, Yoriko Matsuda, Tomoo Shimada, Ikuko Hara-Nishimura, Takayuki Kohchi
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiology

      巻: 55(3) 号: 3 ページ: 475-81

    • DOI

      10.1093/pcp/pcu014

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Co-option of a photoperiodic growth-phase transition system during land plant evolution.2014

    • 著者名/発表者名
      Akane Kubota, Shogo Kita, Kimitsune Ishizaki, Ryuichi Nishihama, Katsuyuki T. Yamato, Takayuki Kohchi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 5 : 3668 号: 1 ページ: 3668-3668

    • DOI

      10.1038/ncomms4668

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Efficient <i>Agrobacterium</i>-Mediated Transformation of the Liverwort <i>Marchantia polymorpha</i> Using Regenerating Thalli2013

    • 著者名/発表者名
      Kubota, A., Ishizaki, K., Hosaka, M., Kohchi T.
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: 77 号: 1 ページ: 167-172

    • DOI

      10.1271/bbb.120700

    • NAID

      10031164707

    • ISSN
      0916-8451, 1347-6947
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cold-induced organelle relocation in the liverwort Marchantia polymorpha L.2013

    • 著者名/発表者名
      Ogasawara Y, Ishizaki K, Kohchi T & Kodama Y
    • 雑誌名

      Plant, Cell & Environment

      巻: 印刷中 号: 8 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1111/pce.12085

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Homologous recombination-mediated gene targeting in the liverwort Marchantia polymorpha L.2013

    • 著者名/発表者名
      K. Ishizaki
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 3 号: 1 ページ: 1532-1532

    • DOI

      10.1038/srep01532

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of four nuclear-encoded plastid RNA polymerase sigma factor genes in the liverwort Marchantia polymorpha: blue-light- and multiple stress-responsive SIG5 was acquired early in the emergence of terrestrial plants.2013

    • 著者名/発表者名
      Kanazawa T, Ishizaki K, Kohchi T, Hanaoka M, Tanaka K.
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol.

      巻: 54 号: 10 ページ: 1736-1748

    • DOI

      10.1093/pcp/pct119

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Essential role of the E3 ubiquitin ligase NOPPERABO1 for schizogerlous intercellular space formation in the liverwort Merchntia polrmorpha.2013

    • 著者名/発表者名
      Kimitsune Ishizakia, Miya Mizutania(第一共著者), Masaki Shimamura, Akihide Masuda, Ryuichi Nishihamaa and Takayuki Kohchi
    • 雑誌名

      Plant Cell

      巻: 25 号: 10 ページ: 4075-4084

    • DOI

      10.1105/tpc.113.117051

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Subfunctionalization of sigma factors during the evolution of land plants based on mutant analysis of liverwort (Marchantia polymorpha L.) MpSIG1.2013

    • 著者名/発表者名
      Ueda, M., Takami, T., Peng, L., Ishizaki, K., Kohchi, T., Shikanai, T. and Nishimura, Y.
    • 雑誌名

      Genome Biology and Evolution

      巻: 5 号: 10 ページ: 1836-1848

    • DOI

      10.1093/gbe/evt137

    • NAID

      120005373074

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Visualization of auxin-mediated transcriptional activation using a common auxin-responsive reporter system in the liverwort Marchantia polymorpha2012

    • 著者名/発表者名
      Ishizaki K., Nonomura M., Kato H., Yamato K.T., Kohchi T.
    • 雑誌名

      Journal of Plant Research

      巻: 125 号: 5 ページ: 826-834

    • DOI

      10.1007/s10265-012-0477-7

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of the plasma membrane H+-ATPase in the liverwort Marchantia polymorpha.2012

    • 著者名/発表者名
      Okumura M, Inoue S, Takahashi K, Ishizaki K, Kohchi T, Kinoshita T.
    • 雑誌名

      Plant Physiology

      巻: 159 号: 2 ページ: 826-834

    • DOI

      10.1104/pp.112.195537

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Composition and physiological function of the chloroplast NADH dehydrogenase-like complex in Marchantia polymorpha2012

    • 著者名/発表者名
      Ueda M., Kuniyoshi T., Yamamoto Y., Sugimoto K., Ishizaki K., Kohchi T., Nishimura Y. and Shikanai T
    • 雑誌名

      Plant J.

      巻: 72 号: 4 ページ: 683-693

    • DOI

      10.1111/j.1365-313x.2012.05115.x

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 苔類ゼニゴケにおける転写因子レパートリー2014

    • 著者名/発表者名
      白川一、井上佳祐、石崎公庸、西浜竜一、河内孝之
    • 学会等名
      55回 日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 苔類ゼニゴケにおける転写因子レパートリー2014

    • 著者名/発表者名
      白川一、井上佳祐、石崎公庸、西浜竜一、河内孝之
    • 学会等名
      第55回 日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学(富山市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ゼニゴケから探るオーキシン応答の基本メカニズムとその進化2013

    • 著者名/発表者名
      石崎公庸、加藤大貴、河内孝之
    • 学会等名
      第54回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 苔類ゼニゴケにおける光依存的な細胞分裂活性制御機構2013

    • 著者名/発表者名
      西浜竜一、石崎公庸、河内孝之
    • 学会等名
      第77回日本植物学会大会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 苔類ゼニゴケにおけるAUX/IAA-ARF相互作用を介したオーキシン転写制御機構の解析2013

    • 著者名/発表者名
      加藤大貴、神埜勝、白川一、石崎公庸、西浜竜一、河内孝之
    • 学会等名
      第77回日本植物学会大会
    • 発表場所
      北海道大学(札幌市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 苔類ゼニゴケにおける転写因子PIFを介した赤色光シグナル伝達機構2013

    • 著者名/発表者名
      井上佳祐、石崎公庸、西浜竜一、河内孝之
    • 学会等名
      第77回日本植物学会大会
    • 発表場所
      北海道大学(札幌市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ゼニゴケのオーキシン信号伝達因子MpARF1による無性芽発生制御2013

    • 著者名/発表者名
      神埜勝、加藤大貴、武田真由子、石崎公庸、西浜竜一、河内孝之
    • 学会等名
      第77回日本植物学会大会
    • 発表場所
      北海道大学(札幌市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ゼニゴケ研究地平への投射 : オーキシン信号伝達を例に

    • 著者名/発表者名
      河内孝之、加藤大貴、西浜竜一、大和勝幸、石崎公庸
    • 学会等名
      55回 日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学S11-5
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] ゼニゴケ気室形成制御遺伝子NOPPERABO1の単離と解析

    • 著者名/発表者名
      水谷未耶,石崎公庸,増田晃秀,桐田啓如,西浜竜一,河内孝之
    • 学会等名
      日本植物学会第76回大会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(姫路市)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] ゼニゴケ形態形成におけるMpIAAを介したオーキシン転写制御の多面的役割

    • 著者名/発表者名
      加藤大貴、石崎公庸、河内孝之
    • 学会等名
      日本植物学会第76回大会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(姫路市)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] ゼニゴケのALTERED MERISTEM PROGRAM 1 (AMP1) 変異体はオーキシン低感受性を示す

    • 著者名/発表者名
      桐田啓如、武田真由子、石崎公庸、河内孝之
    • 学会等名
      日本植物学会第76回大会
    • 発表場所
      兵庫県立大学(姫路市)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [図書] Plastid transformation of sporelings and suspension-cultured cells from the liverwort Marchantia polymorpha L., Method Mol.Biol.2014

    • 著者名/発表者名
      Chiyoda, S., Yamato, K. T., Kohchi,T.
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.lif.kyoto-u.ac.jp/labs/plantmb

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書

URL: 

公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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