| 研究課題/領域番号 |
24658130
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| 研究種目 |
挑戦的萌芽研究
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究分野 |
森林科学
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| 研究機関 | 北海道大学 |
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研究代表者 |
齋藤 秀之 北海道大学, (連合)農学研究科(研究院), 講師 (70312395)
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| 研究分担者 |
瀬々 潤 東京工業大学, 情報理工学研究科, 准教授 (40361539)
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| 研究期間 (年度) |
2012-04-01 – 2014-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2013年度)
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| 配分額 *注記 |
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2013年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2012年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
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| キーワード | 機能ゲノム学 / DNAマイクロアレイ / トランスクリプトーム / ドラフトゲノム / ブナ / ゲノム網羅的解析 / 遺伝子発現 / RNA-seq |
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| 研究概要 |
非モデル植物であるブナ目樹木の機能ゲノミクス研究の基盤整備のため、DNAマイクロアレイ法の汎用性の検討と、ブナ（Fagus crenata）のドラフトゲノム構築を行った。ブナのDNAマイクロアレイ法は、ブナの地理的な遺伝変異に関わらず汎用性を持ってゲノム網羅的発現遺伝子解析を行える手法であることが確認された。構築したブナのドラフトゲノムは442Mb（カバー率が約80%）で、推定された遺伝子の数は48,618個であった。このブナのドラフトゲノムはブナ目で最初のドラフトゲノム情報であり、今後のブナ目樹木の機能ゲノミクス研究に役立つ基盤情報であると考えられた。
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