RSEーPCRと次世代シーケンサによるマイクロサテライトマーカーの簡便大量開発法

• 研究課題/領域番号: 24658138
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 森林科学
• 研究機関: 九州大学
• 研究代表者: 白石 進 九州大学, 大学院・農学研究院, 教授 (70226314)
• 研究期間 (年度): 2012
• 研究課題ステータス: 完了 (2012年度)
• 配分額: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円); 2012年度: 3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
• キーワード: DNAマーカー / マイクロサテライト / 4塩基繰返し / 森林科学 / 育種学 / 分子生態学 / ４塩基繰返し

研究概要

近年,育種学,遺伝学および生態学の分野で広く用いられているDNAマーカーの中で,最も変異性(多様性)に富み,高い遺伝情報量を有するマイクロサテライト(以下,MS)マーカーの新規開発法を構築した。次世代シーケンサーの特性を活用することにより,従来法で膨大な作業と大きな経費を要していたMS領域のDNA断片のクローニングと塩基配列情報の取得を,簡便・安価に行うことが可能となった。

研究成果

• [雑誌論文] Development of tetra-nucleotide microsatellite markers in Pinus kesiyaRoyle ex Gordon (2013)
  • 著者名/発表者名: Thao DV, Yamashita M, Watanabe A, Shiraishi S
  • 雑誌名: Conservation Genet Resour 巻: 5 ページ: 405-407
• [雑誌論文] Isolation and characterization of tetranucleotide microsatellite markers for Pinus merkusii (2013)
  • 著者名/発表者名: Thao DV, Widyatmoko AYPBC, Guan L Watanabe A, Gotoh E, Shiraishi S
  • 雑誌名: Conservation Genet Resour 巻: 5 ページ: 433-436
• [雑誌論文] Development of tetranucleotide microsatellite markers in Pinus kesiya Royle ex Gordon (2012)
  • 著者名/発表者名: D. V. Thao, M. Yamashita, A. Watanabe, S. Shiraishi
  • 雑誌名: Conservation Genetics Resources 巻: 5 号: 2 ページ: 405-407
  • DOI: 10.1007/s12686-012-9814-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation and characterization of tetranucleotide microsatellite markers for Pinus merkusii (2012)
  • 著者名/発表者名: D. V. Thao, A. Y. P. B. C. Widyatmoko, L. Guan, E. Gotoh, A. Watanabe, S. Shiraishi
  • 雑誌名: Conservation Genetics Resources 巻: 5 号: 2 ページ: 433-436
  • DOI: 10.1007/s12686-012-9821-4
  • 査読あり