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分子シミュレーションによる魚介類タンパク質の不安定性の解明

研究課題

研究課題/領域番号 24658186
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 水産化学
研究機関東海大学

研究代表者

落合 芳博  東海大学, 海洋学部, 教授 (50160891)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
2013年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2012年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワードタンパク質 / 構造揺らぎ / 不安定性 / 魚介類 / 分子シミュレーション / 筋肉 / 安定性
研究概要

魚介類由来の代表的なタンパク質(トロポミオシン、ミオグロビン、ミオシン)につき、構造の不安定性について分子動力学シミュレーションを用いて検討した。温度や圧力を変化させた時の構造揺らぎを推定し、種特異的な安定性の違い、同一タンパク質分子内における揺らぎの程度などについて詳細に調べた。巨大分子のミオシンを除くタンパク質については、不安定性に関わる分子内の領域を特定することができた。特にトロポミオシンでは、分子の屈曲に及ぼすアミノ酸置換の影響について新たな知見を得ることができ、一方、ミオグロビンについては、広範囲の温度帯や圧力条件下における構造揺らぎの程度を詳しく解析できた。

報告書

(3件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (1件) 学会発表 (10件)

  • [雑誌論文] ミオグロビン―基礎から応用まで2012

    • 著者名/発表者名
      落合芳博
    • 雑誌名

      冷凍

      巻: 87 ページ: 341-347

    • NAID

      10030763746

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Strategies of acclimation to deep sea : Structure simulation of myoglobin molecules from aquatic animals under high pressure2013

    • 著者名/発表者名
      Y. Ochiai, H. Ozawa
    • 学会等名
      10^<th> International Marine Biotechnology Conference
    • 発表場所
      Brisbane Convention & Exhibition Centre, Australia
    • 年月日
      2013-11-12
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Analysis of flexibility and curvature of tropomyosin by molecular dynamics simulation2013

    • 著者名/発表者名
      H. Ozawa, Y. Ochiai, K. Umezawa, S. Ishiwata, M. Takano
    • 学会等名
      日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      京都国際会館
    • 年月日
      2013-10-29
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 分子シミュレーションを用いた筋肉トロポミオシン断片の局所構造解析2013

    • 著者名/発表者名
      小澤秀夫、梅澤公二、高野光則、石渡信一、渡部終五、落合芳博
    • 学会等名
      日本水産学会秋季大会
    • 発表場所
      三重大学生物資源学部
    • 年月日
      2013-09-21
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書 2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Simulation of the Thermal-stability differences of myoglobins from aquatic animals2013

    • 著者名/発表者名
      Y. Ochiai
    • 学会等名
      Asian Biophysics Association
    • 発表場所
      Ramada Plaza, Jeju (韓国)
    • 年月日
      2013-05-27
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 水産分野における分子シミュレーションの有用性2012

    • 著者名/発表者名
      落合芳博
    • 学会等名
      日本水産学会中部支部大会
    • 発表場所
      アスト津(津市)
    • 年月日
      2012-12-08
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] MD simulation of the structural fluctuations of sea hare Aplysia limacina myoglobin2012

    • 著者名/発表者名
      Y. Ochiai
    • 学会等名
      The 9th Asia-Pacific Marine Biotechnology Conference
    • 発表場所
      カルポート(高知)
    • 年月日
      2012-07-13
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書 2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Simulation of the thermal-stability differences of myoglobin from aquatic animals

    • 著者名/発表者名
      Y. Ochiai
    • 学会等名
      8th Asian Biophysics Association Symposium
    • 発表場所
      Ramada Hotel, Jeju, Korea
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Strategies of acclimation to deep sea: Structure simulation of myoglobin molecules from aquatic animals under high pressure

    • 著者名/発表者名
      Y. Ochiai, H. Ozawa
    • 学会等名
      10th International Marine Biotechnology Conference
    • 発表場所
      Brisbane Convention & Exhibition Centre, Australia
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 水産分野における分子シミュレーションの有用性

    • 著者名/発表者名
      落合芳博
    • 学会等名
      日本水産学会中部支部大会
    • 発表場所
      アスト津(津市)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Simulation of the Thermal-stability Differences of Myoglobins from Aquatic Animals

    • 著者名/発表者名
      Y. Ochiai
    • 学会等名
      Asian Biophysics Association Jeju 2013
    • 発表場所
      Ramada Plaza Jeju(韓国)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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