研究課題
挑戦的萌芽研究
寄生虫が近縁の自由生活種と比べて長寿命である理由を明らかにするため、ベネズエラ糞線虫のドラフトゲノムを構築し、宿主侵入後の遺伝子発現や自由生活線虫との違いを詳細に検討した。次世代シーケンサによりリードデータを取得しドラフトゲノムを構築した。アセンブル全長は55.5Mb、最長断片長15Mb、N50断片数5、N50最低長2Mbと高品質なドラフトが得られた。タンパク質コード遺伝子は18,048個だった。自由生活線虫と植物寄生線虫には存在せず、動物寄生線虫のみに存在する遺伝子にヘム合成の最終酵素であるフェロケラターゼがあった。この遺伝子は細菌からの水平転移によって獲得したと考えられた。
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