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RNA修飾の欠損と自己免疫疾患:SLE発症の新たな分子機構

研究課題

研究課題/領域番号 24659476
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分基金
研究分野 膠原病・アレルギー内科学
研究機関宮崎大学

研究代表者

剣持 直哉  宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 教授 (00133124)

連携研究者 高柳 淳  慶應義塾大学, 医学部, 講師 (80245464)
研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
研究課題ステータス 完了 (2014年度)
配分額 *注記
3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2013年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワードRNA修飾 / 自己免疫 / 抗RNA抗体 / リボソームRNA / snRNA / snoRNA / scaRNA / ゼブラフィッシュ / リボソーム / rRNA / ディスケリン / ゼブラフィッシュモデル / 自己免疫疾患 / 人工抗体
研究成果の概要

生体内のRNAはすべてなんらかの修飾を受けている。しかし、修飾の生理的役割はほとんど解明されていない。一方、自己免疫疾患の患者からRNAに結合する抗体が検出された。RNA修飾が自己・非自己を識別する目印になっている可能性がある。これを明らかにするために、RNA修飾を特異的に認識する人工抗体の開発と、RNA修飾が欠損したゼブラフィッシュモデルの作製・解析を行った。その結果、脊椎動物の初期発生においてRNA修飾が必須であること、また多数の遺伝子の発現が修飾に呼応して変動していることを明らかにした。

報告書

(4件)
  • 2014 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2013 実施状況報告書
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて 2015 2014 2013 2012 2011 その他

すべて 雑誌論文 (9件) (うち査読あり 8件、 オープンアクセス 1件、 謝辞記載あり 1件) 学会発表 (13件) (うち招待講演 3件) 図書 (1件) 備考 (6件)

  • [雑誌論文] scaRNAs regulate splicing and vertebrate heart development.2015

    • 著者名/発表者名
      Patil P, Kibiryeva N, Uechi T, Marshall J, Artman M, O'Brien JE, Kenmochi N, Bittel DC.
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Acta (in press)

      巻: 0 ページ: 0-0

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Incomplete splicing of neutrophil-specific genes affects neutrophil development in a zebrafish model of poikiloderma with neutropenia2015

    • 著者名/発表者名
      Patil P, Uechi T, Kenmochi N
    • 雑誌名

      RNA Biology

      巻: 12 号: 4 ページ: 426-434

    • DOI

      10.1080/15476286.2015.1017240

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Ribosomal protein deficiency causes Tp53-independent erythropoiesis failure in zebrafish2014

    • 著者名/発表者名
      Yadav V.G., Chakraborty A., Uechi T., and Kenmochi N.
    • 雑誌名

      Int. J. Biochem. Cell Biol.

      巻: 49 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1016/j.biocel.2014.01.006

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] リボソーム病ーリボソーム合成の異常と疾患ー2013

    • 著者名/発表者名
      剣持 直哉
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 85(10) ページ: 909-915

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [雑誌論文] snOPY : a small nucleolar RNA orthological gene database2013

    • 著者名/発表者名
      Yoshihama M., Nakao A., and Kenmochi N.
    • 雑誌名

      BMC Research Notes

      巻: 6 号: 1 ページ: 426-426

    • DOI

      10.1186/1756-0500-6-426

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A detection method for intronic snoRNA genes using extended- weight-updating SOM with appearance probability of bases2013

    • 著者名/発表者名
      Yamamori K., Matsuo T., Iwakiri J., Kenmochi N., and Yoshihara I.
    • 雑誌名

      Artificial Life and Robotics

      巻: 17 号: 3-4 ページ: 405-411

    • DOI

      10.1007/s10015-012-0072-y

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 構造モデルに基づく塩基配列からのboxC/D型snoRNA遺伝子検出法2013

    • 著者名/発表者名
      山森一人
    • 雑誌名

      情報処理学会論文誌:数理モデル化と応用

      巻: 6(1) ページ: 79-89

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dissecting the protein-RNA interface : the role of protein surface shapes and RNA secondary structures in protein-RNA recognition2012

    • 著者名/発表者名
      Iwakiri J., Tateishi H., Chakraborty A., Patil P., and Kenmochi N.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: 40 号: 8 ページ: 3299-3306

    • DOI

      10.1093/nar/gkr1225

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Loss of ribosomal RNA modification causes developmental defects in zebrafish2011

    • 著者名/発表者名
      Higa-Nakamine S, Suzuki T (第2著者) 他7名
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 40 号: 1 ページ: 391-398

    • DOI

      10.1093/nar/gkr700

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] snOPY and RPG: snoRNA遺伝子およびリボソームタンパク質遺伝子データベースの構築2015

    • 著者名/発表者名
      鎌田脩作, 吉浜麻生, 中尾彰宏, 上地珠代, 剣持直哉
    • 学会等名
      第3回リボソームミーティング
    • 発表場所
      宮崎
    • 年月日
      2015-03-17 – 2015-03-18
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] ゼブラフィッシュ初期発生におけるRNA修飾の役割2014

    • 著者名/発表者名
      剣持直哉
    • 学会等名
      第37回分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Incomplete splicing of myeloperoxidase gene affects Neutrophil Development in the Zebrafish model of Poikiloderma with Neutropenia2014

    • 著者名/発表者名
      Prakash Patil, Tamayo Uechi, Naoya Kenmochi
    • 学会等名
      第37回分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2014-11-25 – 2014-11-27
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] Reduced Expression of scaRNAs Disrupts Spliceosome Function and Heart Development in Zebrafish and Infants with Tetralogy of Fallot2014

    • 著者名/発表者名
      Douglas C Bittel, Prakash Patil, Tamayo Uechi, Nataliya Kibiryeva, Jennifer Marshall, Mike Artman, James E O'Brien Jr, Naoya Kenmochi
    • 学会等名
      American Heart Association Scientific Sessions
    • 発表場所
      Chicago, USA
    • 年月日
      2014-11-15 – 2014-11-19
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] RPG and snOPY: Databases for ribosomal protein genes and small nucleolar RNA genes2014

    • 著者名/発表者名
      Maki Yoshihama, Akihiro Nakao, Shusaku Kamada, Naoya Kenmochi
    • 学会等名
      The 19th Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      Quebec, Canada
    • 年月日
      2014-06-03 – 2014-06-08
    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [学会発表] A detection method for snoRNA modification domain by fully indexable dictionary retrieving2014

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Yamamoto, Kunihito Yamamori, Naoya Kenmochi, Masaru Aikawa
    • 学会等名
      AROB 19th 2014
    • 発表場所
      別府
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] リボソームRNAの修飾はゼブラフィッシュの初期発生に必須の役割を果たす2013

    • 著者名/発表者名
      剣持 直哉
    • 学会等名
      第36回 日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] RPG and snOPY: リボソームタンパク質遺伝子およびsnoRNA遺伝子データベースの構築2013

    • 著者名/発表者名
      吉浜 麻生、中尾 彰宏、上地 珠代、剣持 直哉
    • 学会等名
      第36回 日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [学会発表] ゼブラフィッシュを用いたリボソーム病発症機構の解析2013

    • 著者名/発表者名
      剣持直哉
    • 学会等名
      第2回 遺伝性貧血班班会議
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 構造モデルに基づく塩基配列からのboxC/D型snoRNA遺伝子検出法2012

    • 著者名/発表者名
      山森一人
    • 学会等名
      第90回 数理モデル化と問題解決(MPS)研究会
    • 発表場所
      小樽
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 機能性RNAの構造特異的な抗体のスクリーニング法の開発2012

    • 著者名/発表者名
      吉浜麻生
    • 学会等名
      第36回 蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • 発表場所
      宮崎
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] RNA修飾の欠損はゼブラフィッシュの初期発生に重大な影響を与える2012

    • 著者名/発表者名
      剣持直哉
    • 学会等名
      第14回 日本RNA学会年会
    • 発表場所
      仙台
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Impairment of Ribosomal RNA Modification Causes Developmental Defects in Zebrafish2012

    • 著者名/発表者名
      Naoya Kenmcohi
    • 学会等名
      The 17th Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      Ann Arbor, USA
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [図書] eLS: Ribosomes and Ribosomal Proteins: More Than Just ‘Housekeeping’2012

    • 著者名/発表者名
      Chakraborty, A
    • 総ページ数
      11
    • 出版者
      John Wiley & Sons Ltd
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [備考] 剣持研究室ホームページ

    • URL

      http://ribosome.med.miyazaki-u.ac.jp/labo

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] リボソームタンパク質遺伝子データベース

    • URL

      http://ribosome.med.miyazaki-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] snoRNA遺伝子データベース

    • URL

      http://snoopy.med.miyazaki-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2014 実績報告書
  • [備考] 剣持研究室ホームページ

    • URL

      http://ribosome.med.miyazaki-u.ac.jp/labo/

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [備考] snoRNA遺伝子データベース

    • URL

      http://snoopy.med.miyazaki-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [備考] リボソームタンパク質遺伝子データベース

    • URL

      http://ribosome.med.miyazaki-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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