ヌクレオチド除去修復欠損性日光過敏症のウイルス発現系とゲノム解析による網羅的探索

• 研究課題/領域番号: 24659533
• 研究種目: 挑戦的萌芽研究
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 皮膚科学
• 研究機関: 長崎大学
• 研究代表者: 荻 朋男 長崎大学, 原爆後障害医療研究所, 准教授 (80508317)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円); 2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2012年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: ヌクレオチド除去修復 / DNA修復

研究成果の概要

DNA修復活性を測定する手法の開発は、基礎研究や臨床診断のみならず、抗がん剤の開発などの応用研究にも有用である。本研究では、収集した症例をUDS/RRS、細胞DNA損傷感受性試験、チェックポイント誘導試験などのDNA修復機能を包括的に調査するアッセイ系を確立した。DNA修復機構に関与する遺伝子を発現するレンチウイルスを細胞に感染させ、上記エンドポイントで評価することで、疾患責任遺伝子相補性群の決定が可能である。相補性群が未知であるものについは、次世代ゲノム解析を実施して変異決定を実施する。これら典型的な解析により、患者細胞を受領後、変異同定まで最短で1週間で実施可能であった。

研究成果

• [雑誌論文] A rapid, comprehensive system for assaying DNA repair activity and cytotoxic effects of DNA-damaging reagents. (2015)
  • 著者名/発表者名: Nan Jia, Yuka Nakazawa, Chaowan Guo, Mayuko Shimada, Mieran Sethi, Yoshito Takahashi, Hiroshi Ueda, Yuji Nagayama, Tomoo Ogi
  • 雑誌名: Nature Protocols 巻: 10 号: 1 ページ: 12-24
  • DOI: 10.1038/nprot.2014.194
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Hypomorphic PCNA mutation underlies a human DNA repair disorder. (2014)
  • 著者名/発表者名: Baple EL, Chambers H, Cross HE, Fawcett H, Nakazawa Y, Chioza BA, Harlalka GV, Mansour S, Sreekantan-Nair A, Patton MA, Muggenthaler M, Rich P, Wagner K, Coblentz R, Stein CK, Last JI, Taylor AM, Jackson AP, Ogi T, Lehmann AR, Green CM, Crosby AH.
  • 雑誌名: Journal of Clinical Investigation 巻: 124 号: 7 ページ: 3137-3146
  • DOI: 10.1172/jci74593
  • 査読あり
• [雑誌論文] PRKDC mutations in a SCID patient with profound neurological abnormalities. (2013)
  • 著者名/発表者名: Woodbine L, Neal JA, Sasi NK, Shimada M, Deem K, Coleman H, Dobyns WB, Ogi T, §Meek K, §Davies EG, §Jeggo PA.
  • 雑誌名: The Journal of Clinical Investigation 巻: 123 号: 7 ページ: 2969-2980
  • DOI: 10.1172/jci67349
  • 査読あり
• [雑誌論文] Malfunction of Nuclease ERCC1-XPF Results in Diverse Clinical Manifestations and Causes Cockayne Syndrome, Xeroderma Pigmentosum, and Fanconi Anemia. (2013)
  • 著者名/発表者名: Kashiyama, K, Nakazawa, Y, Pilz, DT, Guo, C, Sasaki, K, et al.
  • 雑誌名: The American Journal of Human Genetics 巻: 92 号: 5 ページ: 807-819
  • DOI: 10.1016/j.ajhg.2013.04.007
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional characterization of the novel BRAF complex mutation, BRAF(V600delinsYM), identified in papillary thyroid carcinoma. (2013)
  • 著者名/発表者名: Matsuse, M.
  • 雑誌名: Int. J. Cancer 巻: 132 号: 3 ページ: 738-743
  • DOI: 10.1002/ijc.27709
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of the first ATRIP-deficient patient and novel mutations in ATR define a clinical spectrum for ATR-ATRIP Seckel syndrome (2012)
  • 著者名/発表者名: *Ogi T , Walker S, Stiff T, Hobson E, Limsirichaikul S, Carpenter G, Prescott K, Suri M, Byrd P, Matsuse M, Mitsutake N, Nakazawa Y, Vasudevan P, Barrow M, Stewart G, Taylor M, O'Driscoll M, and Jeggo P
  • 雑誌名: PLoS Genetics 巻: 8 号: 11 ページ: e1002945-e1002945
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1002945
  • NAID: 120006985789
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mutations in UVSSA cause UV-sensitive syndrome and impair RNA polymerase IIo processing in transcription-coupled nucleotide-excision repair (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakazawa Y, Sasaki K, Mitsutake N, Yamashita S, Ogi T, et al
  • 雑誌名: Nat Genet 巻: 44(5) 号: 5 ページ: 586-92
  • DOI: 10.1038/ng.2229
  • NAID: 120006985586
  • 査読あり
• [学会発表] 放射線感受性および各種発達異常を示す遺伝性疾患の新規責任遺伝子の同定と分子機能解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 中沢由華、郭朝万、嶋田繭子、宮崎仁美、唐田清伸、荻朋男
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Molecular and functional study on the initiation of transcription coupled nucleo tide excision repair (2014)
  • 著者名/発表者名: Guo C, Nakazawa Y, Shimada M, Jia N, Karata K, Miyazaki H, Ogi T.
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] 転写と共役したヌクレオチド除去修復のin vitro反応系の構築 (2014)
  • 著者名/発表者名: 唐田清伸、郭朝万、荻朋男
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] コケイン症候群様の臨床症状を示す遺伝性疾患の責任遺伝子探索 (2014)
  • 著者名/発表者名: 宮崎仁美、中沢由華、郭朝万、嶋田繭子、賈楠、唐田清伸、荻朋男
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] エキソーム解析を用いたDNA修復機構欠損性疾患の新規責任遺伝子の探索 (2014)
  • 著者名/発表者名: 嶋田繭子、中沢由華、郭朝万、賈楠、宮崎仁美、唐田清伸、荻朋男
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Molecular cloning and characterisation of new human DNA repair genes (2014)
  • 著者名/発表者名: Ogi T
  • 学会等名: The 9th 3R Symposium
  • 発表場所: 御殿場高原ホテル（静岡県御殿場市）
  • 年月日: 2014-11-17 – 2014-11-21
• [学会発表] Molecular characterization and functional analysis of XRCC4, a novel pathological gene for radiation sensitivity and developmental abnormalities (2014)
  • 著者名/発表者名: Guo C, Nakazawa Y, Shimada M, Woodbine L, Jia N, Karata K, Miyazaki H, Lehmann A, Jeggo PA, Ogi T.
  • 学会等名: The 9th 3R Symposium
  • 発表場所: 御殿場高原ホテル（静岡県御殿場市）
  • 年月日: 2014-11-17 – 2014-11-21
• [学会発表] ERCC1/XPF deficiency causes three NER- deficient disorders: a patient with various symptoms of xeroderma pigmentosum, Cockayne syndrome & Fanconi anemia. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nakazawa Y, Kashiyama K, Pilz DT, Guo C, Shimada M, Sasaki K, Fawcett H, Wing JF, Lewin SO, Carr L, Li TS, Yoshiura K, Utani A, Hirano A, Greenblatt D, Nardo T, Stefanini M, McGibbon D, Sarkany R, Fassihi H, Mitsutake N, Lehmann AR, Ogi T.
  • 学会等名: The 9th 3R Symposium
  • 発表場所: 御殿場高原ホテル（静岡県御殿場市）
  • 年月日: 2014-11-17 – 2014-11-21
• [学会発表] ゲノム不安定性疾患群の新規責任遺伝子の同定と分子機能解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: 第57回日本甲状腺学会学術集会
  • 発表場所: コングレコンベンションセンター（大阪府大阪市）
  • 年月日: 2014-11-14
  • 招待講演
• [学会発表] ヒストンH3K9メチル化酵素類のDNA二重鎖切断修復反応への関与 (2014)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: 第87回日本生化学会大会 シンポジウム
  • 発表場所: 国立京都国際会館（京都府京都市）
  • 年月日: 2014-10-15 – 2014-10-18
• [学会発表] 転写共役ヌクレオチド除去修復の開始反応の分子機構 (2014)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: 日本放射線影響学会第57回大会 ワークショップ
  • 発表場所: 鹿児島県民交流センター（鹿児島県鹿児島市）
  • 年月日: 2014-10-01 – 2014-10-03
• [学会発表] DNA修復機構の異常により発症する先天性疾患とゲノム不安定性/発がん (2014)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: 第20回日本家族性腫瘍学会学術集会 教育講演
  • 発表場所: コラッセ福島（福島県福島市）
  • 年月日: 2014-06-13
  • 招待講演
• [学会発表] Transcription, DNA damage and Repair (2014)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: International Symposium on Xeroderma Pigmentosum and Related Diseases
  • 発表場所: 神戸国際会議場（神戸市）
• [学会発表] 紫外線高感受性症候群～UVSSA遺伝子の発見と病態解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: 第22回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
  • 発表場所: ホテルニュー水戸屋（仙台市）
• [学会発表] Transcription, DNA damage and Repair (2013)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: 11th International Conference on Environmental Mutagens
  • 発表場所: Bourbon Convention & Spa Resort Cataratas do Iguassu（ブラジル）
  • 招待講演
• [学会発表] 転写共役修復とRNAポリメラーゼの修飾分子基盤 (2013)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: 2013年度国立遺伝学研究所研究会「染色体DNAの安定維持の分子メカニズム」
  • 発表場所: 国立遺伝学研究所（三島市）
• [学会発表] DNA repair deficient genetic disorders and their clinical diagnosis (2013)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: CS meeting Amy and freiends
  • 発表場所: St David's Park Hotel（イギリス）
• [学会発表] 紫外線高感受性症候群～UVSSA遺伝子の発見と病態解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: 日本美容皮膚科学会・学術大会
  • 発表場所: 神戸国際会議場（神戸市）
  • 招待講演
• [学会発表] DNA 修復欠損性遺伝性疾患の責任因子の検索と分子機構の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: 日本環境変異原学会-変異機構研究会 第26回夏の学校
  • 発表場所: アイプラザ一宮（一宮市）
  • 招待講演
• [学会発表] Repair of UV-induced DNA damage (2013)
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: Youth Scientific School "Problems of Basic and Applied Radiobiology"
  • 発表場所: Medical Radiological Research Center（ロシア）
• [学会発表] Mutations in UVSSA cause UV-sensitive syndrome and impair RNA polymerase IIo processing in transcription-coupled nucleotide-excision repair (2012)
  • 著者名/発表者名: 荻 朋男
  • 学会等名: 3R meeting
  • 発表場所: 兵庫
• [学会発表] Molecular cloning and characterisation of KIAA1530/UVSSA, the responsible gene for UV sensitive syndrome complementation group-A (2012)
  • 著者名/発表者名: 荻 朋男
  • 学会等名: BIO JAPAN
  • 発表場所: 横浜
  • 招待講演
• [学会発表] 紫外線高感受性症候群責任因子UVSSAによる損傷停止RNAポリメラーゼのユビキチン化修飾メカニズムの解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 荻 朋男
  • 学会等名: 日本遺伝学会第84回大会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] Molecular cloning and characterisation of KIAA1530/UVSSA, the responsible gene for UV sensitive syndrome complementation group-A (2012)
  • 著者名/発表者名: 荻 朋男
  • 学会等名: 駿河台国際シンポジウム
  • 発表場所: 東京
  • 招待講演
• [学会発表] ヒトDNA修復遺伝子の同定と機能解析
  • 著者名/発表者名: 荻朋男
  • 学会等名: The International Kick-Off Symposium for Atomic Bomb Disease Institute at Nagasaki University
  • 発表場所: 長崎大学医学部 良順会館（長崎市）
  • 招待講演
• [学会発表] 紫外線感受性症候群責任遺伝子UVSSAの同定と分子機能解析
  • 著者名/発表者名: 荻 朋男
  • 学会等名: 日本皮膚科学会
  • 発表場所: 長崎
  • 招待講演
• [備考] 長崎大学 がん・ゲノム不安定性研究拠点ホームページ
  • URL: http://www.nrgic.prj.nagasaki-u.ac.jp/
• [備考] 長崎大学がん・ゲノム不安定性研究拠点ホームページ
  • URL: http://www.nrgic.prj.nagasaki-u.ac.jp/
• [備考] 長崎大学 がん・ゲノム不安定性研究拠点ホームページ
  • URL: http://www.nrgic.prj.nagasaki-u.ac.jp/