| 研究課題/領域番号 |
24659889
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| 研究種目 |
挑戦的萌芽研究
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究分野 |
外科系歯学
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| 研究機関 | 東京医科歯科大学 |
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研究代表者 |
小村 健 東京医科歯科大学, 医歯学総合研究科, 教授 (10334434)
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| 研究分担者 |
森田 圭一 東京医科歯科大学, 硬組織疾患ゲノムセンター, 特任講師 (10396971)
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| 研究期間 (年度) |
2012-04-01 – 2014-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2013年度)
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| 配分額 *注記 |
3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2013年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
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| キーワード | 口腔がん / ゲノム / マイクロアレイ / 11q13.3 / マイクロダイセクション |
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| 研究概要 |
本研究の目的は、臨床検体から高レベルゲノム異常のある微量の細胞だけを対象にゲノム構造異常を検出する「手法」を開発することにある。ホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織からDNAを抽出し、初期DNA量を100ng程度まで減らしても良好なCGHアレイデータが得られることが判明した。また、免疫組織染色後の封入されたプレパラートから抽出したDNAがCGHマイクロアレイ解析可能であることが明らかになった。より微量なDNAでゲノム構造解析を行うために、次世代シーケンサーを用いたターゲットシーケンスを行ったところ、初期DNA量は15ng程度でゲノム変異が検出できた。
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