大腸癌の発癌や進展に深く関与しうる長鎖ｎｃＲＮＡの量的・質的な異常の探索

• 研究課題/領域番号: 24680092
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 一部基金
• 研究分野: 腫瘍診断学
• 研究機関: 札幌医科大学
• 研究代表者: 丸山 玲緒 札幌医科大学, 医学部, 准教授 (60607985)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 26,910千円 (直接経費: 20,700千円、間接経費: 6,210千円); 2014年度: 8,710千円 (直接経費: 6,700千円、間接経費: 2,010千円); 2013年度: 8,580千円 (直接経費: 6,600千円、間接経費: 1,980千円); 2012年度: 9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円)
• キーワード: lncRNA / 長鎖nRNA / 大腸癌 / ヒストン修飾 / DNAメチル化 / 長鎖ncRNA / ChIPSeq / バイオインフォマティクス

研究成果の概要

本研究は内視鏡によって得られる臨床検体を分子レベルで統合的・包括的に解析することにより、大腸癌において重要な役割を果たす長鎖ncRNAの量的・質的な異常を同定することを目的とした。これまでに20検体以上のヒストン修飾に関するChIPSeqデータを収集し、さらに公共データベースが提供するオミックスデータを用いて統合解析を行い、大腸癌において普遍的にDNAメチル化により不活性化している長鎖ncRNAや、癌で高発現しており発癌に関与しうる長鎖ncRNAを同定できた。また多数の臨床検体でのメチル化や発現状態の確認、さらに癌細胞株を用いた実験により、それら長鎖ncRNAが細胞に及ぼす影響を明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Analysis of DNA methylation in bowel lavage fluid for detection of colorectal cancer (2014)
  • 著者名/発表者名: Harada T, Yamamoto E, Yamano HO, Nojima M, Maruyama R, Kumegawa K, Ashida M, Yoshikawa K, Kimura T, Harada E, Takagi R, Tanaka Y, Aoki H, Nishizono M, Nakaoka M, Tsuyada A, Niinuma T, Kai M, Shimoda K, Shinomura Y, Sugai T, Imai K, Suzuki H
  • 雑誌名: Cancer prevention research 巻: 7 ページ: 1002-1010
  • 査読あり
• [学会発表] Systematic identification of long non-coding RNAs involved in gastritis and gastric tumorigenesis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Maruyama R, Kitajima H, Yamamoto E, Niinuma T, Yorozu A, Kumegawa K, Nishiyama K, Tsuyada A, Suzuki R, Kai M, Tokino T, Shinomura Y, Suzuki H.
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] Systematic identification of long non-coding RNAs involved in gastritis and gastric tumorigenesis. (2014)
  • 著者名/発表者名: Maruyama R, Kitajima H, Yamamoto E, Niinuma T, Yorozu A, Kumegawa K, Tsuyada A, Suzuki R, Kai M, Tokino T, Shinomura Y, Suzuki H.
  • 学会等名: 第73回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Genome-wide identification of lincRNAs epigenetically silenced by DNA methylation in colon cancer (2014)
  • 著者名/発表者名: Igarashi T, Kumegawa K, Maruyama R, Yamamoto E, Tsuyada A, Suzuki R, Niinuma T, Kai M, Yamano H, Sugai T, Tokino T, Shinomura Y, Suzuki H.
  • 学会等名: 第73回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [学会発表] Genome-wide identification of novel long noncoding RNAs epigenetically silenced by DNA methylation in colon cancer (2014)
  • 著者名/発表者名: 粂川 昂平
  • 学会等名: Keystone Symposia Conference Cancer Epigenetics
  • 発表場所: サンタフェ、アメリカ合衆国
  • 年月日: 2014-02-08
• [学会発表] 消化器癌の発生や進展に関与する長鎖ncRNAの量的・質的異常の探索と臨床応用への試み (2013)
  • 著者名/発表者名: 丸山玲緒
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸国際会議場、神戸
  • 年月日: 2013-12-03
• [学会発表] 消化器癌において重要な役割を果たす長鎖ncRNAの網羅的同定の試み (2013)
  • 著者名/発表者名: 丸山玲緒
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2013-10-05
• [学会発表] 消化器癌の発生や進展に関与する長鎖ncRNAの量的・質的異常の探索と臨床応用への試み (2013)
  • 著者名/発表者名: 丸山玲緒
  • 学会等名: 第33回日本分子腫瘍マーカー研究会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜
  • 年月日: 2013-10-02
• [学会発表] Integrated analysis of clinical ChIPSeq data and public databases identified candidate long non-coding RNAs critically involved in gastrointestinal cancer. (2013)
  • 著者名/発表者名: 丸山玲緒
  • 学会等名: アメリカ癌学会年会
  • 発表場所: ワシントンDC、アメリカ合衆国
  • 年月日: 2013-04-06
• [学会発表] Integrated analysis of clinical ChlPSeq data and public databases identified candidate long non-coding RNAs critically involved in gastrointestinal cancer (2012)
  • 著者名/発表者名: 丸山玲緒
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡県)
  • 年月日: 2012-12-11
• [学会発表] Integrated analysis of clinical ChlPSeq data and public databases identified candidate long non-coding RNAs critically involved in gastrointestinal cancer (2012)
  • 著者名/発表者名: 丸山玲緒
  • 学会等名: 生命医薬情報学連合大会
  • 発表場所: タワーホール船堀(東京都)
  • 年月日: 2012-10-15
• [学会発表] 大腸癌においてエピジェネティックに抑制されている長鎖ncRNAの網羅的同定の試み (2012)
  • 著者名/発表者名: 丸山玲緒
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: ホテルロイトン札幌(北海道)
  • 年月日: 2012-09-19
• [学会発表] 消化管内視鏡の生検検体におけるヒストン修飾の網羅的な解析と新規分子マーカー同定の試み (2012)
  • 著者名/発表者名: 丸山玲緒
  • 学会等名: 第32回日本分子腫瘍マーカー研究会
  • 発表場所: さっぽろ芸文館(北海道)
  • 年月日: 2012-09-18
• [学会発表] 大腸癌においてエピジェネティックに抑制されている長鎖ncRNAの網羅的同定の試み (2012)
  • 著者名/発表者名: 粂川昂平
  • 学会等名: 第14回日本RNA学会年会
  • 発表場所: 東北大学百周年記念会館(宮城県)
  • 年月日: 2012-07-18