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低分子RNAネットワークのシステム的理解と新たな癌制御アプローチへの応用

研究課題

研究課題/領域番号 24689018
研究種目

若手研究(A)

配分区分一部基金
研究分野 病態医化学
研究機関東京大学

研究代表者

鈴木 洋  東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (00587793)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 中途終了 (2014年度)
配分額 *注記
26,520千円 (直接経費: 20,400千円、間接経費: 6,120千円)
2014年度: 8,580千円 (直接経費: 6,600千円、間接経費: 1,980千円)
2013年度: 8,450千円 (直接経費: 6,500千円、間接経費: 1,950千円)
2012年度: 9,490千円 (直接経費: 7,300千円、間接経費: 2,190千円)
キーワードmicroRNA / 低分子RNA / がん / がん微小環境 / ネットワーク / 病理学 / 遺伝子 / システム生物学 / 癌 / シグナル伝達
研究概要

本研究では、様々な病態における低分子RNAの発現異常の分子基盤となる低分子RNA生合成経路の新規調節機構、および悪性腫瘍との関係を明らかにすることを目的とする。また、低分子RNAの作動機構をネットワークレベルでシステム的に理解することを目的とする。平成24年度では、まず、miRNAによる標的mRNAの抑制効果を複数の内在性miRNAの発現量が変動する状況に外挿することが可能であるかを検討した。このために、GSEA-FAME analysis(GFA)という新規解析手法を開発し、癌のトランスクリプトームにおいてmiRNAがmRNA発現に与える負の影響が広範囲に観察されること、この原理を応用して、より頑健な新規バイオマーカーや新規治療標的をゲノムワイド発現解析から抽出できる可能性を明らかにした(Nucleic Acid Res, 41, e62)。また、これまでにMCPIP1と呼ばれるribonucleaseがmiRNAの生合成を抑制することを見出しているが、平成24年度では、MCPIP1によるmiRNA前駆体の分解を抑制するRNA結合タンパクLaとMCPIP1の関係について、乳癌の遺伝子発現データを解析し、DicerおよびLaとMCPIP1が拮抗関係にあることを見出した(J Biol Chem, 288, 723-736)。平成25年度では、GFA解析をT細胞リンパ腫の網羅的遺伝子発現解析データに拡張し、各リンパ腫サブタイプが特徴的なmiRNA活性パターンを示すことを明らかにするとともに、NPM-ALK陽性の悪性リンパ腫(未分化大細胞型リンパ腫)で発現異常が認められる複数のmiRNAの同定に成功し、mRNA発現データの解析からmiRNA―mRNAネットワークを類推できる可能性を新たに見出した(Leukemia, 27, 2107-2111)。

現在までの達成度 (区分)
理由

25年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

25年度が最終年度であるため、記入しない。

次年度の研究費の使用計画

25年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実績報告書
  • 研究成果

    (50件)

すべて 2014 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (17件) (うち査読あり 9件、 オープンアクセス 2件) 学会発表 (29件) (うち招待講演 8件) 図書 (4件)

  • [雑誌論文] EVI1 oncogene promotes KRAS pathway through suppression of microRNA-96 in pancreatic carcinogenesis.2014

    • 著者名/発表者名
      Tanaka M, Suzuki HI, Shibahara J, Kunita A, Isagawa T, Yoshimi A, Kurokawa M, Miyazono K, Aburatani H, Ishikawa S, Fukayama M.
    • 雑誌名

      Oncogene

      巻: 33(19) 号: 19 ページ: 2454-63

    • DOI

      10.1038/onc.2013.204

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Computational dissection of distinct microRNA activity signatures associated with peripheral T cell lymphoma subtypes2013

    • 著者名/発表者名
      Suzuki HI
    • 雑誌名

      Leukemia

      巻: 27 号: 10 ページ: 2107-2111

    • DOI

      10.1038/leu.2013.121

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Bone morphogenetic protein-9 inhibits lymphatic vessel formation via activin receptor-like kinase 1 during development and cancer progression2013

    • 著者名/発表者名
      Yoshimatsu Y
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.

      巻: 10 号: 47 ページ: 18940-18945

    • DOI

      10.1073/pnas.1310479110

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Circular RNA―RNAの新しい形とその機能2013

    • 著者名/発表者名
      鈴木洋
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: 31(9) ページ: 1385-1386

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [雑誌論文] RNA言語を編む : miRNA-mRNAネットワーク同定へのアプローチ2013

    • 著者名/発表者名
      鈴木洋,宮園浩平
    • 雑誌名

      細胞工学

      巻: 32(8) ページ: 886-892

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [雑誌論文] 遺伝子発現解析を用いたリンパ系腫瘍の分類2013

    • 著者名/発表者名
      鈴木洋,宮園浩平
    • 雑誌名

      血液内科

      巻: 67(6) ページ: 750-754

    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [雑誌論文] p53 actions on microRNA expression and maturation pathway2013

    • 著者名/発表者名
      Suzuki HI
    • 雑誌名

      Methods Mol Biol

      巻: 962 ページ: 165-181

    • DOI

      10.1007/978-1-62703-236-0_14

    • ISBN
      9781627032353, 9781627032360
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Widespread inference of weighted microRNA-mediated gene regulation in cancer transcriptome analysis2013

    • 著者名/発表者名
      Suzuki HI
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 41 号: 5 ページ: e62-e62

    • DOI

      10.1093/nar/gks1439

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Prostate cancer cells and bone stromal cells mutually interact with each other through bone morphogenetic protein-mediated signals2012

    • 著者名/発表者名
      Nishimori H
    • 雑誌名

      J Biol Chem

      巻: 287 号: 24 ページ: 20037-20046

    • DOI

      10.1074/jbc.m112.353094

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Sjogren syndrome antigen B (SSB)/La promotes global microRNA expression by binding microRNA precursors through stem-loop recognition.2012

    • 著者名/発表者名
      C Liang, et al.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 288(1) ページ: 723-736

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Control of MicroRNA Maturation by p53 Tumor Suppressor and MCPIP1 Ribonuclease.2012

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki, et al.
    • 雑誌名

      The Enzymes

      巻: 32 ページ: 163-183

    • DOI

      10.1016/b978-0-12-404741-9.00008-8

    • ISBN
      9780124047419
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of human lung cancer-associated fibroblasts in three dimensional in vitro co-culture model2012

    • 著者名/発表者名
      Masafumi Horie, Akira Saito, Mitsuhiro Ohshima, Yasuyuki Morishita, Jun Nakajima, Tadashi Kohyama, Takahide Nagase
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun

      巻: 423 号: 2 ページ: 158-163

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0056587

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] がんにおけるmiRNA生合成機構の異常と治療標的としての可能性2012

    • 著者名/発表者名
      鈴木洋, 宮園浩平
    • 雑誌名

      遺伝子医学MOOK

      巻: 23 ページ: 214-218

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] microRNAプロセシングとがん制御シグナル経路のクロストーク2012

    • 著者名/発表者名
      鈴木洋, 宮園浩平
    • 雑誌名

      細胞

      巻: 44(10) ページ: 448-451

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] がん抑制遺伝子p53によるマイクロRNAプロセシング制御の解明2012

    • 著者名/発表者名
      鈴木洋
    • 雑誌名

      最新医学

      巻: 67(9) ページ: 2050-2055

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] 疾患モジュレーターとしての低分子RNA生合成機構2012

    • 著者名/発表者名
      鈴木洋, 宮園浩平
    • 雑誌名

      細胞

      巻: 44(14) ページ: 589-592

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [雑誌論文] 慢性リンパ性白血病におけるmicroRNAの機能異常2012

    • 著者名/発表者名
      鈴木洋, 宮園浩平
    • 雑誌名

      血液内科

      巻: 65(6) ページ: 846-852

    • NAID

      40019555265

    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Widespread inference of weighted microRNA-mediated gene regulation in cancer transcriptome analysis2013

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki, et al.
    • 学会等名
      Keystone symposia "RNA Silencing"
    • 発表場所
      Whietler Conference Centre(カナダ)
    • 年月日
      2013-03-22
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Widespread inference of weighted microRNA-mediated gene regulation in cancer transcriptome analysis2013

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki, et al.
    • 学会等名
      9th Joint Conference of the American Association for Cancer Research and the Japanese Cancer Association
    • 発表場所
      ハイアツトリージェンシー(アメリカ合衆国)
    • 年月日
      2013-02-24
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] BMP-9/ALK-1 signals inhibit proliferation of lymphatic endothelial cells and reprogram them to blood vascular endothelial cells through down-regulation of Proxl expression2013

    • 著者名/発表者名
      Y Yoshimatsu, et al.
    • 学会等名
      9th Joint Conference of the American Association for Cancer Research and the Japanese Cancer Association
    • 発表場所
      ハイアツトリージェンシー(アメリカ合衆国)
    • 年月日
      2013-02-24
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 低分子RNAの生合成機構の多様性と病態形成での役割に関する研究2013

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki.
    • 学会等名
      新学術領域「RNA制御学」班会議
    • 発表場所
      レオパレス仙台(宮城県 仙台市)
    • 年月日
      2013-01-07
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] BMP-9 inhibits proliferation of lymphatic endothelial cells and reprograms them to blood vascular endothelial cells through downregulation of Proxl expression2012

    • 著者名/発表者名
      Y Yoshimatsu, et al.
    • 学会等名
      第20回日本血管生物医学会学術集会
    • 発表場所
      あわぎんホール(徳島県 徳島市)
    • 年月日
      2012-12-06
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Widespread inference of weighted microRNA-mediated gene regulation in cancertranscriptome analysis2012

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki, et al.
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium by JSPS Core-to-CoreProgram ″Cooperative International Framework in TGF-β Family Signaling″
    • 発表場所
      昭和薬科大学(東京都 町田市)
    • 年月日
      2012-10-29
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] BMP-9 inhibits proliferation of lymphatic endothelial cells and reprograras them to blood vascular endothelial cells through downregulation of Proxl expression2012

    • 著者名/発表者名
      Y Yoshimatsu, et al.
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium by JSPS Core-to-Core Program ″Cooperative International Framework in TGF-β Family Signaling″
    • 発表場所
      昭和薬科大学(東京都 町田市)
    • 年月日
      2012-10-29
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Complexity of microRNA biogenesis and Inference of small RNA network through transcriptome analysis2012

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki, K Miyazono.
    • 学会等名
      第71回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      札幌市教育文化会館(北海道 札幌市)
    • 年月日
      2012-09-20
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] small RNA研究の最前線~microRNAの生合成と機能解析~2012

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki.
    • 学会等名
      第5回Symphony
    • 発表場所
      ホテルメトロポリタンェドモント飯田橋(東京都 千代田区)(招待講演)
    • 年月日
      2012-09-02
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Specialization of microRNA biogenesis pathways and their alteration in human cancer2012

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki.
    • 学会等名
      第22回広島がんセミナー・第4回JARIジョイント国際シンポジウム
    • 発表場所
      グランドプリンスホテル広島(招待講演)
    • 年月日
      2012-08-30
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] TGF-βによる内皮間葉移行におけるRhoシグナルとMRTF転写因子の役割2012

    • 著者名/発表者名
      H Mihira, HI Suzuki, et al.
    • 学会等名
      第48回日本小児循環器学会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府 京都市)
    • 年月日
      2012-07-05
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] Negative regulation of miRNA biogenesis by MCPIP1 ribonuclease2012

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki.
    • 学会等名
      RNAi, MicroRNAs, Single Cell Biology & Stem Cells -2012 Meeting
    • 発表場所
      Hilton Garden Inn(アメリカ合衆国)(招待講演)
    • 年月日
      2012-05-01
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 拡大する小さなRNAの世界~miRNAめ生合成と癌における役割~2012

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki, K Miyazono.
    • 学会等名
      日本分子生物学会第12回春季シンポジウム
    • 発表場所
      石和温泉慶山(山梨県 笛吹市)(招待講演)
    • 年月日
      2012-04-25
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] MS-1血管内皮細胞におけるTGF-betaによる間葉細胞移行の分子機序2012

    • 著者名/発表者名
      H Mihira, HI Suzuki, et al.
    • 学会等名
      第115回日本小児科学会学術集会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(福岡県 福岡市)
    • 年月日
      2012-04-22
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [学会発表] 診断・治療への応用を目指した microRNAネットワークの理解

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki, K Miyazono.
    • 学会等名
      ゲノム創薬フォーラム第32回談話会:マイクロRNAの新展開と創薬への利用
    • 発表場所
      東京大学医科学研究所(東京都 港区)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] microRNA研究の新展開

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki, K Miyazono.
    • 学会等名
      第1回AAA
    • 発表場所
      ロイヤルパークホテル(東京都 中央区)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] RNA言語を編む

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki, K Miyazono.
    • 学会等名
      東京医科大学 がん医科学分野 大学院領域特別講義
    • 発表場所
      東京医科大学(東京都 新宿区)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Beyond fine tuners: microRNAの生合成とネットワーク制御 の分子基盤

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki.
    • 学会等名
      平成25年度 文部科学省 新学術領域研究 がん研究分野の特性等を踏まえた支援活動 公開シンポジウム
    • 発表場所
      一橋大学一橋講堂(東京都 千代田区)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] TGF-βによる内皮間葉系細胞移行におけるRhoシグナルとMRTF転写因子の役割

    • 著者名/発表者名
      H Mihira, HI Suzuki, et al.
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県 横浜市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] リンパ管発生および腫瘍リンパ管新生におけるBMP-9/ALK-1シグナルの役割

    • 著者名/発表者名
      Y Yoshimatsu, et al.
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県 横浜市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] FGF/MEK signals maintain the identity of tumor endothelial cells through negative regulation of TGF-b-induced endothelial-to-mesenchymal transition (EndMT)

    • 著者名/発表者名
      Y Akatsu, A Katsura, et al.
    • 学会等名
      第21回日本血管生物医学会学術集会
    • 発表場所
      千里阪急ホテル(大阪府 豊中市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] BMP-9/ALK-1 signals negatively regulate the lymphatic vessel formation in development and cancer by downregulating Prox 1

    • 著者名/発表者名
      Y Yoshimatsu, et al.
    • 学会等名
      第21回日本血管生物医学会学術集会
    • 発表場所
      千里阪急ホテル(大阪府 豊中市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Decoding RNA language for the future nucleic acid medicine

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki, K Miyazono.
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県 横浜市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] マイクロRNA生合成機構および マイクロRNAネットワークに関する研究

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki.
    • 学会等名
      第72回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県 横浜市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Computational dissection of microRNA-mRNA network by GSEA-FAME analysis

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki, H Matsuyama, et al.
    • 学会等名
      The 3rd International Symposium by JSPS Core-to-Core Program “Cooperative International Framework in TGF-β Family Signaling”
    • 発表場所
      大和屋本店(愛媛県 松山市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] BMP-9 negatively regulates lymphatic vessel formation

    • 著者名/発表者名
      Y Yoshimatsu, et al.
    • 学会等名
      The 3rd International Symposium by JSPS Core-to-Core Program “Cooperative International Framework in TGF-β Family Signaling”
    • 発表場所
      大和屋本店(愛媛県 松山市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] Understanding RNA language for the future nucleic acid medicine

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki, K Miyazono.
    • 学会等名
      Small RNAs to Stem Cells & Epigenetic Reprogramming Asia-2013 Meeting
    • 発表場所
      山上会館(東京都 文京区)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] microRNAバイオロジーの新展開

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki, K Miyazono.
    • 学会等名
      鳥取大学 特別講義
    • 発表場所
      鳥取大学(鳥取県 鳥取市)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] microRNA バイオロジーと 次世代核酸医薬の交差点

    • 著者名/発表者名
      HI Suzuki, K Miyazono.
    • 学会等名
      日本がん分子標的治療学会第9回TRワークショップ
    • 発表場所
      都市センターホテル(東京都 千代田区)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
    • 招待講演
  • [図書] 原理からよくわかるリアルタイムPCR完全実験ガイド 10章 miRNA 生合成経路をみる MCPIP1 がmiRNA 生合成に与える影響を例に2013

    • 著者名/発表者名
      鈴木洋,宮園浩平
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [図書] がん増殖と悪性化の分子機構(宮澤恵二・伊藤進 編) 9章 がんとmicroRNA2012

    • 著者名/発表者名
      鈴木洋
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [図書] がん増殖と悪性化の分子機構(宮澤恵二・伊藤進 編) 11章 がんとオートファジー2012

    • 著者名/発表者名
      鈴木洋
    • 出版者
      化学同人
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書
  • [図書] デヴィータがんの分子生物学 30章 リンパ腫2012

    • 著者名/発表者名
      鈴木洋
    • 出版者
      メディカル・サイエンス・インターナショナル
    • 関連する報告書
      2012 実績報告書

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公開日: 2012-04-24   更新日: 2019-07-29  

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