結核菌臨床分離株における宿主定着・適応因子の究明と遺伝子型別技術の補完

• 研究課題/領域番号: 24689034
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 一部基金
• 研究分野: 公衆衛生学・健康科学
• 研究機関: 長崎大学
• 研究代表者: 和田 崇之 長崎大学, 熱帯医学研究所, 助教 (70332450)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 17,810千円 (直接経費: 13,700千円、間接経費: 4,110千円); 2014年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円); 2013年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円); 2012年度: 8,190千円 (直接経費: 6,300千円、間接経費: 1,890千円)
• キーワード: 感染症 / ゲノム / 公衆衛生 / 分子疫学 / 結核 / 社会医学 / 衛生

研究成果の概要

わが国における結核菌臨床分離株の遺伝的特異性に着目し、日本固有性が高い2系統（G3群、G4群）の比較ゲノム解析と、系統的代表株（計12株）の全ゲノム配列決定を行った。G3/G4群の比較解析では、全国各地から菌株を収集し、ゲノム全域にわたる固有変異の抽出に成功した。変異情報に基づく分子系統樹では両群ともに分岐点が集中しており、いずれも短期間のうちに拡散し、その後国内固有群として広く定着した経緯が示唆された。また、G4群における既存型別法の問題点が浮き彫りとなった。国内株の全ゲノム配列は標準株と高い相同性を示したが、ゲノム内に点在する相同遺伝子間の比較を目的とした参照配列としての活用が期待される。

研究成果

• [雑誌論文] Clonality and micro-diversity of a nationwide spreading genotype of Mycobacterium tuberculosis in Japan. (2015)
  • 著者名/発表者名: Takayuki Wada, Tomotada Iwamoto, Aki Tamaru, Junji Seto, Tadayuki, Ahiko, Kaori Yamamoto, Atushi Hase, Shinji Maeda, and Taro Yamamoto.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 10(3) 号: 3 ページ: e0118495-e0118495
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0118495
  • NAID: 120006987070
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Characterization of Mycolic Acids in Total Fatty Acid Methyl Ester Fractions from <i>Mycobacterium</i> Species by High Resolution MALDI-TOFMS (2015)
  • 著者名/発表者名: Teramoto K, Suga M, Sato T, Wada T, Yamamoto A, Fujiwara N
  • 雑誌名: Mass Spectrometry 巻: 4 号: 1 ページ: A0035-A0035
  • DOI: 10.5702/massspectrometry.A0035
  • NAID: 130005095680
  • ISSN: 2186-5116, 2187-137X
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Second worldwide proficiency study on variable number of tandem repeats typing of Mycobacterium tuberculosis complex (2014)
  • 著者名/発表者名: de Beer JL, Kodmon C, van Ingen J, Supply P, van Soolingen D; Global Network for Molecular Surveillance of Tuberculosis 2010.
  • 雑誌名: International Journal of Tuberculosis and Lung Diseases 巻: 18(5) 号: 5 ページ: 594-600
  • DOI: 10.5588/ijtld.13.0531
  • 査読あり
• [雑誌論文] Pathological Findings of an outbreak of Mycobacterium marinum infection in Japanese Forest Green tree frogs, Rhacophorus arboreus (2014)
  • 著者名/発表者名: Haridy M, Tachikawa Y, Yoshida S, Maeda S, Wada T, Inoue S, Sakai H, Yanai T.
  • 雑誌名: Journal of Comparative Pathology 巻: In press
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multiplex agarose gel electrophoresis system for variable number of tandem repeats genotyping: Analysis example using Mycobacterium tuberculosis. (2013)
  • 著者名/発表者名: Wada T, Maeda S.
  • 雑誌名: Electrophoresis 巻: 34 号: 8 ページ: 1171-1174
  • DOI: 10.1002/elps.201200471
  • 査読あり
• [雑誌論文] 複数自治体をまたぐ広域的結核分子疫学の基盤構築―JATA(12)-VNTR型別に基づくクラスター形成とその傾向― (2013)
  • 著者名/発表者名: 和田崇之、田丸亜貴、岩本朋忠、有川健太郎、中西典子、小向潤、松本健二、長谷篤
  • 雑誌名: 結核 巻: 88 ページ: 393-398
  • NAID: 10031162884
  • 査読あり
• [雑誌論文] JATA(12)-VNTR型別による結核集団発生事例の菌株異同調査 (2013)
  • 著者名/発表者名: 田丸亜貴、和田崇之、岩本朋忠、長谷篤
  • 雑誌名: 結核 巻: 88 ページ: 399-403
  • NAID: 10031162885
  • 査読あり
• [雑誌論文] Whole-genome Sequence of the Potentially Hyper-transmissible Multi-DrugResistant Mycobacterium tuberculosis Beijing Strain, OM-V02_005. (2013)
  • 著者名/発表者名: Yoshitaka Tateishi, Aki Tamaru, Yoshitoshi Ogura, Mamiko Niki, TakayukiWada, Taro Yamamoto, Kazuto Hirata, Tetsuya Hayashi and Sohkichi Matsumoto.
  • 雑誌名: Genome Announcement 巻: 8 号: 4 ページ: 608-613
  • DOI: 10.1128/genomea.00608-13
  • 査読あり
• [雑誌論文] 23) Evolutionary robust SNPs reveal the misclassification of Mycobacterium tuberculosis Beijing family strains into sublineages. (2013)
  • 著者名/発表者名: Noriko Nakanishi, Takayuki Wada, Kentaro Arikawa, Julie Millet, Nalin Rastogi, and Tomotada Iwamoto
  • 雑誌名: Infect. Genet. Evol. 巻: 16 ページ: 174-177
  • DOI: 10.1016/j.meegid.2013.02.007
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dominant Incidence of Multidrug and Extensively Drug-Resistant Specific Mycobacterium tuberculosis Clones in Osaka Prefecture, Japan. (2012)
  • 著者名/発表者名: Tamaru, A., C. Nakajima, T. Wada, Y. Wang, M. Inoue, R. Kawahara, R. Maekura, Y. Ozeki, H. Ogura, K. Kobayashi, Y. Suzuki, and S. Matsumoto.
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 7 号: 8 ページ: e42505-e42505
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0042505
  • 査読あり
• [学会発表] ゲノム解析が解き明かす結核の拡散経緯とこれから (2015)
  • 著者名/発表者名: 和田 崇之
  • 学会等名: 第20回国際結核セミナー
  • 発表場所: ヤクルトホール（東京都港区）
  • 年月日: 2015-03-05
  • 招待講演
• [学会発表] Phylogenetic uniqueness and its historical backgrounds of Mycobacterium tuberculosis in Japan (2015)
  • 著者名/発表者名: Wada T, Iwamoto T, Maeda S, Seto J, Tamaru A, Hase A, Murakami K, Takara T, Ahiko T, Yamamoto T.
  • 学会等名: International Symposium on Genome Science 2015 "Expanding Frontiers of Genome Science II"
  • 発表場所: Hitotsubashi-Hall (Minato-ku, Tokyo, Japan)
  • 年月日: 2015-01-20 – 2015-01-21
• [学会発表] 抗酸菌属に潜む分類学と臨床現場の乖離 (2015)
  • 著者名/発表者名: 和田 崇之
  • 学会等名: 日本分類学会連合第14回総会
  • 発表場所: 国立科学博物館（東京都港区）
  • 年月日: 2015-01-11
  • 招待講演
• [学会発表] Opportunistic and pathogenic Mycobacteria: importance of systematic surveillance of mycobacteriosis based on pathological diagnosis (2014)
  • 著者名/発表者名: Wada T, Yoshida S, Yamamoto T, Yanai T.
  • 学会等名: Asian Society of Zoo and Wildlife Medicine (2014 meeting in Vietnam)
  • 発表場所: Tam dao National Park (Tam Dao, Vietnam)
  • 年月日: 2014-10-14
• [学会発表] M株の広域的分離の原因究明─比較ゲノム解析に基づく「結核ゲノム疫学」の導入 (2014)
  • 著者名/発表者名: 和田崇之、岩本朋忠、瀬戸順二、田丸亜貴、前田伸司、長谷篤、山本太郎
  • 学会等名: 第89回日本結核病学会総会
  • 発表場所: 長良川国際会議場（岐阜）
  • 年月日: 2014-05-10
• [学会発表] 日本株BCGに含まれるバリアントの比率変化の検討 (2014)
  • 著者名/発表者名: 大原直也、趙娜、和田崇之、藤原永年、前田伸司、山本三郎、中山真彰、井上哲圭、瀧井猛将、前山順一
  • 学会等名: 第89回日本結核病学会総会
  • 発表場所: 長良川国際会議場（岐阜）
  • 年月日: 2014-05-09
• [学会発表] 超高分解能 MALDI Spiral-TOFMS によるミコール酸の簡易迅速分析法 (2014)
  • 著者名/発表者名: 藤原永年、和田崇之、前田伸司
  • 学会等名: 第89回日本結核病学会総会
  • 発表場所: 長良川国際会議場（岐阜）
  • 年月日: 2014-05-09
• [学会発表] 結核菌国内臨床株の比較ゲノム解析：大規模拡散株と国内定着系統群を追跡する (2014)
  • 著者名/発表者名: 和田 崇之
  • 学会等名: 第84回実験結核研究会
  • 発表場所: 長良川国際会議場（岐阜）
  • 年月日: 2014-05-08
• [学会発表] 結核菌北京型1,054株を用いた遺伝的系統解析法の評価 (2013)
  • 著者名/発表者名: 中西典子、和田崇之、有川健太郎、岩本朋忠
  • 学会等名: 第86回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 幕張メッセ(千葉)
• [学会発表] 反復配列多型法による型別結果比較における問題点とその対策 (2012)
  • 著者名/発表者名: 前田伸司、和田崇之
  • 学会等名: 第87回日本結核病学会総会
  • 発表場所: 広島国際会議場(広島)
• [学会発表] 結核菌国内臨床株の比較ゲノム解析：大規模拡散株と国内定着系統群を追跡する
  • 著者名/発表者名: 和田崇之
  • 学会等名: 第84回実験結核研究会
  • 発表場所: 長良川国際会議場（岐阜）
• [学会発表] 結核菌における遺伝型別一致株の比較ゲノム解析
  • 著者名/発表者名: 和田崇之、岩本朋忠、瀬戸順二、田丸亜貴、前田伸司、長谷篤、山本太郎
  • 学会等名: 第87回日本細菌学会総会
  • 発表場所: タワーホール船堀（東京）
• [学会発表] 結核分子疫学研究の現在と未来
  • 著者名/発表者名: 和田崇之
  • 学会等名: 第19回国際結核セミナー
  • 発表場所: ヤクルトホール（東京）
  • 招待講演
• [学会発表] Pathological findings of Mycobacteriosis in Japanese forest green tree frogs, Rhacophorus arboreus.
  • 著者名/発表者名: Haridy M, Tachikawa Y, Wada T, Yoshida S, Maeda S, Inoue S, Sakai H, Yanai T
  • 学会等名: Combined Conference 2013, One Health in Asia Pacific.
  • 発表場所: Institute of Technical Education (Singapore)
• [学会発表] Mycobcterium kansasii: its epidemiological background in humans and a case of infection in black bearded Sakis in a zoo.
  • 著者名/発表者名: Wada T, Yoshida S, Takata M, Tomita M, Tsuyuguchi K, Yanai T, Yamamoto T
  • 学会等名: Combined Conference 2013, One Health in Asia Pacific.
  • 発表場所: Institute of Technical Education (Singapore)
• [学会発表] 反復配列多型(VNTR)分析法による結核菌型別―精度管理と考え方,使い方―
  • 著者名/発表者名: 和田崇之
  • 学会等名: 第72回日本公衆衛生学会総会
  • 発表場所: 三重県総合文化センター（三重）
  • 招待講演
• [学会発表] わが国における結核分子疫学と伝搬経路推定:結核中蔓延国としての役割について
  • 著者名/発表者名: 和田崇之，山本太郎
  • 学会等名: 第54回日本熱帯医学会大会
  • 発表場所: 長崎ブリックホール（長崎）
• [学会発表] Genotyping of Mycobacterium tuberculosis (MTB), especially Beijing genotype MTB, in Japan by using the variable-number of tandem repeats (VNTR) and a next generation sequencer (NGS).
  • 著者名/発表者名: Maeda S, Wada T, Naka T, Shibata M, Fujiwara N
  • 学会等名: The 5th EMBO meeting 2013
  • 発表場所: Amsterdam RAI (Netherlands)
• [学会発表] 結核菌の遺伝的多様性がもたらす研究展開：公衆衛生から自然史まで
  • 著者名/発表者名: 和田崇之
  • 学会等名: H25年度長崎県職臨床技師会研修会
  • 発表場所: 長崎県央保健所（長崎）
  • 招待講演
• [備考] 結核菌VNTRハンドブック
  • URL: http://www.chieiken.gr.jp/