ＤＮＡメチル化によるＴ細胞系列への運命制御機構の解明

• 研究課題/領域番号: 24689042
• 研究種目: 若手研究(A)
• 配分区分: 一部基金
• 研究分野: 血液内科学
• 研究機関: 独立行政法人理化学研究所
• 研究代表者: 伊川 友活 独立行政法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 上級研究員 (60450392)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 26,260千円 (直接経費: 20,200千円、間接経費: 6,060千円); 2013年度: 8,060千円 (直接経費: 6,200千円、間接経費: 1,860千円); 2012年度: 18,200千円 (直接経費: 14,000千円、間接経費: 4,200千円)
• キーワード: T細胞分化 / 運命決定 / Np95 / エピジェネティクス / DNAメチル化

研究成果の概要

細胞の分化・系列決定過程における系列状態の維持にはクロマチンの修飾やDNAのメチル化などのエピジェネティック制御機構が深く関与している。しかしその詳細は明らかでない。本研究により、DNAのメチル化に重要な働きをするNp95がT細胞分化に必須であることを我々は見いだした。Np95のT細胞分化における機能を調べるために、T細胞特異的Np95欠損マウスを作成し解析したところ、T前駆細胞段階で分化が顕著に阻害されていた。このT前駆細胞では本来発現するはずのない遺伝子の発現が誘導されていた。このことから、DNAメチル化はT細胞分化過程において特にT前駆細胞の運命維持に重要であることが示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Gene regulation. Transcribed enhancers lead waves of coordinated transcription in transitioning mammalian cells (2015)
  • 著者名/発表者名: Arner E, Daub CO, Vitting-Seerup K, Andersson R, Lilje B, Drabløs F, Lennartsson A, Rönnerblad M, Hrydziuszko O, Vitezic M, Freeman TC, Alhendi AM, Arner P, Axton R, Baillie JK, Beckhouse A, Bodega B, Briggs J, Brombacher F, Davis M, Detmar M, Ehrlund A, Endoh M, Eslami A, Fagiolini M, et al.
  • 雑誌名: Science 巻: 347 号: 6225 ページ: 1010-1014
  • DOI: 10.1126/science.1259418
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The transcription repressors Bach2 and Bach1 promote B cell development by repressing myeloid program. (2014)
  • 著者名/発表者名: Itoh-Nakadai A, Hikota R, Muto A, Kometani K, Matsui-Watanabe M, Sato Y, Kobayashi M, Nakamura A, Miura Y, Yano Y, Tashiro S, Sun J, Ikawa T, Ochiai K, Kurosaki T, and Igarashi K.
  • 雑誌名: Nature Immunol. 巻: 15 号: 12 ページ: 1171-1180
  • DOI: 10.1038/ni.3024
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Zinc transporter SLC39A10/ZIP10 controls humoral immunity by modulating B-cell receptor signal strength. (2014)
  • 著者名/発表者名: Hojyo S., T. Miyai, H. Fujishiro, M. Kawamura, T. Yasuda, A. Hijikata, B-H Bin, T. Irie, J. Tanaka, T. Atsumi, M. Murakami, M. Nakayama, O. Ohara, S. Himeno, H. Yoshida, H. Koseki, T. Ikawa, K. Mishima, and T. Fukada.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 巻: 111 号: 32 ページ: 11786-11791
  • DOI: 10.1073/pnas.1323557111
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Zinc transporter SLC39A10/ZIP10 facilitates antiapoptotic signaling during early B-cell development (2014)
  • 著者名/発表者名: Miyai T, Hojyo S, Ikawa T, Kawamura M, Irie T, Ogura H, Hijikata A, Bin BH, Yasuda T, Kitamura H, Nakayama M, Ohara O, Yoshida H, Koseki H, Mishima K, Fukada T
  • 雑誌名: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 巻: 111 号: 32 ページ: 11780-11785
  • DOI: 10.1073/pnas.1323549111
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Genetic and epigenetic control of early lymphocyte development (2014)
  • 著者名/発表者名: Ikawa T
  • 雑誌名: Curr Top Microbiol Immunol. 巻: 381 ページ: 1-20
  • DOI: 10.1007/82_2014_370
  • ISBN: 9783319073941, 9783319073958
  • オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The epigenetic regulator Uhrf1 facilitates proliferation and maturation of colonic regulatory T cells (2014)
  • 著者名/発表者名: Yuuki Obata*, Yukihiro Furusawa*, Takaho A. Endo, Jafar Sharif, Daisuke Takahashi, Koji Atarashi, Manabu Nakayama, Satoshi Onawa, Yumiko Fujimura, Masumi Takahashi, Tomokatsu Ikawa, Takeshi Otsubo, Yuki I. Kawamura, Taeko Dohi, Shoji Tajima, Osamu Ohara, Kenya Honda, Shohei Hori, Hiroshi Ohno, Haruhiko Koseki and Koji Hase. 【* : 筆頭筆者】
  • 雑誌名: Nature Immunology 巻: 15 号: 6 ページ: 571-579
  • DOI: 10.1038/ni.2886
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A promoter-level mammalian expression atlas. (2014)
  • 著者名/発表者名: Forrest, A.R.R., Kawaji, H., Rehli, M., Baillie, J.K, de Hoon, M.J.L., Haberle, V., Lassmann, T., Kulakovskiy, I.V., Lizio, M., Itoh, M., Andersson, R., Mungall, C. J.,et al.
  • 雑誌名: Nature 巻: 507 号: 7493 ページ: 462-470
  • DOI: 10.1038/nature13182
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Loss of mTOR complex 1 induces developmental blockage in early T-lymphopoiesis and eradicates T-cell acute lymphoblastic leukemia cells. (2013)
  • 著者名/発表者名: Hoshii T, Kasada A, Hatakeyama T, Ohtani M, Tadokoro Y, Naka K, Ikenoue T, Ikawa T, Kawamoto H, Fehling HJ, Araki K, Yamamura K, Matsuda S, Hirao A
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A. 巻: 111 号: 10 ページ: 3805-3810
  • DOI: 10.1073/pnas.1320265111
  • 査読あり
• [雑誌論文] MicroRNA-126-mediated control of cell fate in B-cell myeloid progenitors as a potential alternative to transcriptional factors. (2013)
  • 著者名/発表者名: Okuyama K, Ikawa T, Gentner B, Hozumi K, Harnprasopwat R, Lu J, Yamashita R, Ha D, Toyoshima T, Chanda B, Kawamata T, Yokoyama K, Wang S, Ando K, Lodish HF, Tojo A, Kawamoto H, Kotani A
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A. 巻: 110 号: 33 ページ: 13410-13415
  • DOI: 10.1073/pnas.1220710110
  • 査読あり
• [雑誌論文] Regeneration of Human Tumor Antigen-Specific T Cells from iPSCs Derived from Mature CD8+ T Cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Vizcardo, R
  • 雑誌名: Cell Stem Cell 巻: 12 号: 1 ページ: 31-36
  • DOI: 10.1016/j.stem.2012.12.006
  • 査読あり
• [雑誌論文] Process for immune defect and chromosomal translocation during early thymocyte development lacking ATM (2012)
  • 著者名/発表者名: Isoda T, Takagi M, Piao J, Nakagama S,Sato M, Masuda K, Ikawa T, Azuma M, Morio T, Kawamoto H, Mizutani S
  • 雑誌名: Blood 巻: 120(4) 号: 4 ページ: 789-9
  • DOI: 10.1182/blood-2012-02-413195
  • 査読あり
• [雑誌論文] Runx1-Cbfβ facilitates early B lymphocyte development by regulating expression of Ebf1. (2012)
  • 著者名/発表者名: Seo Wooseok
  • 雑誌名: Journal of Experimental Medicine 巻: 209 号: 7 ページ: 1255-1262
  • DOI: 10.1084/jem.20112745
  • 査読あり
• [雑誌論文] E2A and CBP/p300 act in synergy to promote chromatin accessibility of the immunoglobulin | locus. (2012)
  • 著者名/発表者名: Sakamoto, S., ffakae, K., Anzai, Y., Murai, K., Tamaki, N., Miyazaki, M., Miyazaki, K., Romanow, W. J., Ikawa, T., Kitamura, D., Yanagihira, I., Minato, N., Murre, C., Agata, Y
  • 雑誌名: J. Immunol 巻: 188 号: 11 ページ: 5547-5560
  • DOI: 10.4049/jimmunol.1002346
  • 査読あり
• [学会発表] Gene regulatory network orchestrating B cell fate specification (2015)
  • 著者名/発表者名: Tomokatsu Ikawa
  • 学会等名: RIKEN EPIGENETICS in Kobe
  • 発表場所: 神戸市 RIKEN CDB
  • 年月日: 2015-02-13
• [学会発表] Epigenetic maintenance of T cell identity by Polycomb-mediated suppression of Pax5 (2014)
  • 著者名/発表者名: Tomokatsu Ikawa
  • 学会等名: 日本免疫学会
  • 発表場所: 京都市 国立京都国際会館
  • 年月日: 2014-12-11
• [学会発表] T細胞系列への運命決定とエピジェネティクス (2014)
  • 著者名/発表者名: 伊川 友活
  • 学会等名: LEGENDセミナー
  • 発表場所: 京都市 ホテルグランヴィア京都
  • 年月日: 2014-12-09
  • 招待講演
• [学会発表] Maintenance of T cell identity by Polycomb group proteins (2014)
  • 著者名/発表者名: Ikawa T
  • 学会等名: France-Japan Immunology meeting
  • 発表場所: フランス カシス
  • 年月日: 2014-10-23
  • 招待講演
• [学会発表] Genetic and epigenetic control of early lymphocyte development (2014)
  • 著者名/発表者名: Ikawa T
  • 学会等名: Max Planck Institute seminar
  • 発表場所: ドイツ フライブルグ
  • 年月日: 2014-10-20
  • 招待講演
• [学会発表] Polycomb group proteins Ring1A/B are required for the maintenance of T cell fate (2014)
  • 著者名/発表者名: Ikawa T
  • 学会等名: CSHL meeting
  • 発表場所: アメリカ コールドスプリングハーバー
  • 年月日: 2014-04-22
• [学会発表] 細胞分化の研究に魅せられて (2014)
  • 著者名/発表者名: 伊川 友活
  • 学会等名: 新学術領域「細胞運命制御」若手の会
  • 発表場所: 浜松市 浜名湖ロイヤルホテル
  • 年月日: 2014-04-22
  • 招待講演
• [学会発表] A genetic network during the T cell lineage specification. (2013)
  • 著者名/発表者名: Tomokatsu Ikawa
  • 学会等名: The 6th International Workshop of Kyoto T cell conference 2013.
  • 発表場所: 京都市
• [学会発表] Roles of Polycomb group proteins in the maintenance of T cell fate. (2013)
  • 著者名/発表者名: Tomokatsu Ikawa
  • 学会等名: 15th International Congress of Immunology.
  • 発表場所: イタリア ミラノ
• [学会発表] Epigenetic regulation in T cell lineage commitment. (2013)
  • 著者名/発表者名: Tomokatsu Ikawa
  • 学会等名: The 5th LJI & IMS-RCAI Joint Workshop.
  • 発表場所: 横浜市
  • 招待講演
• [学会発表] Maintenance of T cell identity by Polycomb group complexes. (2013)
  • 著者名/発表者名: Tomokatsu Ikawa
  • 学会等名: 日本免疫学会
  • 発表場所: 幕張市
• [学会発表] A novel system to clarify the gene regulatory networks in B cell lineage commitment. (2013)
  • 著者名/発表者名: Miyai Tomohiro, Tomokatsu Ikawa
  • 学会等名: 日本免疫学会
  • 発表場所: 幕張市
• [学会発表] Maintenance of T cell fate after the commitment to the T cell lineage (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomokatsu Ikawa
  • 学会等名: 日本免疫学会
  • 発表場所: 神戸市
  • 年月日: 2012-12-06
• [学会発表] Gene regulatory networks in T cell lineage specification (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomokatsu Ikawa
  • 学会等名: FANTOM5 MEETING
  • 発表場所: 横浜市
  • 年月日: 2012-10-31
• [学会発表] T細胞系列へ決定後の運命維持機構 (2012)
  • 著者名/発表者名: 伊川 友活
  • 学会等名: Kyoto T cell Conference
  • 発表場所: 京都市
  • 年月日: 2012-07-06
• [学会発表] Induction of myelo-lymphoid stem cells by suppressing E-protein activities (2012)
  • 著者名/発表者名: Tomokatsu Ikawa
  • 学会等名: Gene expression & signaling in the immune system
  • 発表場所: 京都市
  • 年月日: 2012-04-25