複雑かつ大規模なデータ処理のためのデータマイニング及び機械学習法

• 研究課題/領域番号: 24700140
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 知能情報学
• 研究機関: 東京工業大学
• 研究代表者: 田部井 靖生 東京工業大学, 情報理工学(系)研究科, 東工大特別研究員 (20589824)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2014年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円); 2013年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2012年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: データマイニング / 機械学習 / 類似検索 / ケモインフォマティクス / 簡潔データ構造 / 類似度検索 / アルゴリズム / ビッグデータ / 国際情報交換

研究成果の概要

本研究プロジェクトでは, 大規模データを処理する上で重要な検索技術と圧縮技術を応用した大規模機械学習技術に焦点をあてて研究開発を行い成果を挙げることにできた. 主な成果としては, 大規模ネットワーク検索技術, 大規模データに対する分類器の学習手法の開発である. 開発した手法の論文は, 分野におけるトップの国際会議に採択され研究発表を行ってきた. さらに, 手法を実装したソフトウェアーを公開し, 世界中の研究者・技術者に利用され始めている.

研究成果

• [雑誌論文] Scalable prediction of compound-protein interactions using minwise hashing (2013)
  • 著者名/発表者名: Y.Tabei and Y.Yamanishi
  • 雑誌名: BMC Systems Biology 巻: 7 号: Suppl 6 ページ: S3-S3
  • DOI: 10.1186/1752-0509-7-s6-s3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of chemogenomic features from drug-target interaction networks using interpretable classifiers (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuo Tabei, Edouard Pauwels, Veronique Stoven, Kazuhiro Takemoto, Yoshihiro Yamanishi
  • 雑誌名: Bioinrmatics 巻: 28 号: 18 ページ: 487-494
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/bts412
  • 査読あり
• [雑誌論文] Succinct Multibit Tree: Compact Representation of Multibit Trees by Using Succinct Data Structures in Chemical Fingerprint Searches (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuo Tabei
  • 雑誌名: Lecture Notes in Computer Science 巻: 7534 ページ: 201-213
  • 査読あり
• [雑誌論文] Variable-Length Codes for Space-Efficient Grammar-Based Compression (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshimasa Takabatake, Yasuo Tabei, Hiroshi Sakamoto
  • 雑誌名: Lecture Notes in Computer Science 巻: 7608 ページ: 398-410
  • 査読あり
• [学会発表] Succinct Interval-Splitting Tree for Scalable Similarity Search of Compound-Protein Pairs with Property Constraints (2013)
  • 著者名/発表者名: Y.Tabei, A.Kishimoto, M.Kotera, Y.Yamanishi
  • 学会等名: 19th ACM SIGKDD Conference on Knowledge Discovery and Data Mining (KDD2013)
  • 発表場所: シカゴ
• [学会発表] Identification of chemogenomic features from drug-target interaction networks using interpretable classifiers (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuo Tabei, Edouard Pauwels, Veronique Stoven, Kazuhiro Takemoto, Yoshihiro Yamanishi
  • 学会等名: 11th European Conference on Computational Biology (ECCB)
  • 発表場所: Basel, Switzerland
• [学会発表] Succinct Multibit Tree: Compact Representation of Multibit Trees by Using Succinct Data Structures in Chemical Fingerprint Searches (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuo Tabei
  • 学会等名: 12th Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI)
  • 発表場所: Ljubljana, Slovenia
• [学会発表] Variable-Length Codes for Space-Efficient Grammar-Based Compression (2012)
  • 著者名/発表者名: Yoshimasa Takabatake, Yasuo Tabei, Hiroshi Sakamoto
  • 学会等名: 19th International Symposium on String Processing and Information Retrieval (SPIRE)
  • 発表場所: Cartagena, Colombia
• [備考] MinwiseのC++による実装
  • URL: https://sites.google.com/site/interactminhash/
• [備考] コンパクトなデータ表現による機械学習法の実装
  • URL: https://sites.google.com/site/interactminhash/
• [備考] Succinct Multibit Tree
  • URL: https://code.google.com/p/smbt/
• [備考] olca-plus-plus
  • URL: https://code.google.com/p/olca-plus-plus/