| 研究課題/領域番号 |
24700295
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| 研究種目 |
若手研究(B)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
生体生命情報学
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| 研究機関 | 国立研究開発法人理化学研究所 (2013-2015)
大阪大学 (2012) |
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研究代表者 |
木戸 善之 国立研究開発法人理化学研究所, 生命システム研究センター, 客員研究員 (70506310)
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| 研究期間 (年度) |
2012-04-01 – 2016-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2015年度)
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| 配分額 *注記 |
3,900千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 900千円)
2014年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2013年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
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| キーワード | 分散コンピューティング / 遺伝子発現ネットワーク推定 / ジョブスケジューラ / 可視化 / 分散並列コンピューティング / スケジューリング / 遺伝子ネットワーク / ネットワーク推定 / 分散並列計算 |
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| 研究成果の概要 |
本研究では，大規模な遺伝子制御ネットワークを解析するアプリケーションのための，並列計算機上でのワークスティーリング手法のジョブを可能にするジョブスケジューラの研究，開発を行った．大規模な遺伝子制御ネットワークとは人間の全遺伝子，約20000遺伝子の相関を解析すること相互作用や影響などを知ることができる．本研究を通じ，ネットワーク推定として余計なジョブについては枝刈りをするための判断機構，アルゴリズムを動かすためのジョブスケジューラフレームワークを開発した．また大規模な遺伝子解析結果を表示するための可視化アプリケーションについても研究を進めることができた．
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