がん原遺伝子ＲＡＳの新しい遺伝子サイレンシング機能の解明

• 研究課題/領域番号: 24700951
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 発がん
• 研究機関: 東北大学
• 研究代表者: 舟山 亮 東北大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (20452295)
• 研究協力者: 長嶋 剛史 東北大学, 大学院医学系研究科, 助教 (80443000) ; 細金 正樹 東北大学, 大学院医学系研究科, 大学院生
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2013年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円); 2012年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: エピジェネティクス / ヒストン / 発がん / RAS / 転写 / サイレンシング / ｓｈRNA / スクリーニング / shRNA

研究概要

RAS-MAPKシグナルは細胞のがん化を防ぐ遺伝子の発現量を低下させてしまう。これは、細胞のがん抑制機構を崩壊させ、細胞のがん化を促進すると考えられる。本研究課題では、RAS-MAPKシグナルによる遺伝子発現の抑制機構について研究を実施し、発現が抑制される遺伝子領域で特定のヒストンタンパク質の翻訳後修飾が増加することを明らかにした。転写が抑制される遺伝子では、転写量が低下した後にこのヒストン修飾量が増加していた。また、転写抑制に関わる3種類のクロマチンタンパク質を同定した。

研究成果

• [雑誌論文] RNA sequencing-based identification of aberrant imprinting in cloned mice. (2014)
  • 著者名/発表者名: Okae H, Matoba S, Nagashima T, Mizutani E, Inoue K, Ogonuki N, Chiba H, Funayama R, Tanaka S, Yaegashi N, Nakayama K, Sasaki H, Ogura A, Arima T.
  • 雑誌名: Hum Mol Genet. 巻: 23 号: 4 ページ: 992-1001
  • DOI: 10.1093/hmg/ddt495
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ras-Induced Changes in H3K27me3 Occur after Those in Transcriptional Activity (2013)
  • 著者名/発表者名: Hosogane M, Funayama R, Nishida Y, Nagashima T, Nakayama K.
  • 雑誌名: PLoS Genet. 巻: 9 号: 8 ページ: e1003698-e1003698
  • DOI: 10.1371/journal.pgen.1003698
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distinct MicroRNAs Expression Profile in Primary Biliary Cirrhosis and Evaluation of miR 505-3p and miR197-3p as Novel Biomarkers (2013)
  • 著者名/発表者名: Ninomiya, M., Kondo, Y., Funayama, R., Nagashima, T., Kogure, T., Kakazu, E., Kimura, O., Ueno, Y., Nakayama, K., Shimosegawa, T.
  • 雑誌名: PloS one 巻: 8 号: 6 ページ: e66086-e66086
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0066086
  • 査読あり
• [雑誌論文] ChIP-seq解析をはじめる人のために-ENCODEのChIP-seq解析ガイドライン (2013)
  • 著者名/発表者名: 舟山亮
  • 雑誌名: 実験医学増刊 巻: 31 ページ: 201-205
  • URL: https://www.yodosha.co.jp/jikkenigaku/book/9784758103282/index.html
• [雑誌論文] Illumina社製シークエンサーの特徴と可能性 (2013)
  • 著者名/発表者名: 中山啓子, 舟山亮
  • 雑誌名: 肝胆膵 巻: 67 ページ: 25-33
  • URL: http://arcmedium.co.jp/publication02.php?a=201307
• [雑誌論文] ChIP-seq解析をはじめる人のために-ENCODEのChIP-seq解析ガイドライン- (2013)
  • 著者名/発表者名: 舟山亮
  • 雑誌名: 実験医学増刊 巻: 31 ページ: 201-205
• [雑誌論文] Exome sequencing identifies a novel TTN mutation in a family with hereditary myopathy with early respiratory failure (2013)
  • 著者名/発表者名: Izumi R, Niihori T, Aoki Y, Suzuki N, Kato M, Warita H, Takahashi T, Tateyama M, Nagashima T, Funayama R, Abe K, Nakayama K, Aoki M, Matsubara Y
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 58(5) 号: 5 ページ: 259-66
  • DOI: 10.1038/jhg.2013.9
  • NAID: 10031177220
  • 査読あり
• [雑誌論文] Y-chromosome-linked B- and NK-cell deficiency in mice (2013)
  • 著者名/発表者名: Sun SL, Horino S, Itoh-Nakadai A, Kawabe T, Asao A, Takahashi T, So T, Funayama R, Kondo M, Saitsu H, Matumoto N, Nakayama K, and Ishii N
  • 雑誌名: J. Immunol. 巻: 190 号: 12 ページ: 6209-6220
  • DOI: 10.4049/jimmunol.1300303
  • 査読あり
• [雑誌論文] Gain-of-Function Mutations in RIT1 Cause Noonan Syndrome, a RAS/MAPK Pathway Syndrome (2013)
  • 著者名/発表者名: Aoki Y, Niihori T, Banio T, Okamoto N, Mizuno S, Kurosawa K, Ogata T, Takada F, Yano M, Ando T, Hoshika T, Barnett C, Ohashi H, Kawame H, Hasegawa T, Okutani T, Nagashima T, Hasegawa S, Funayama R, Nagashima T Nakayama K, Inoue S, Watanabe Y, Oeura T, Matsubara Y
  • 雑誌名: The American Journal of Human Genetics 巻: Volume 93, Issue 1 号: 1 ページ: 173-180
  • DOI: 10.1016/j.ajhg.2013.05.021
  • 査読あり
• [雑誌論文] ChIP-seq解析をはじめる人のために-ENCODEのChIP-seq解析ガイドライン- (2013)
  • 著者名/発表者名: 舟山亮
  • 雑誌名: 実験医学増刊号 巻: 31 ページ: 201-205
• [雑誌論文] Use of illumina deep sequencing technology to differentiate hepatitis Cvirus variants (2012)
  • 著者名/発表者名: Ninomiya M, Ueno Y, Funayama R, Kagashima T, Nishida Y, Kondo Y, Inoue J, Kakazu E, Kimura O, Nakayama K, Shimosegawa T
  • 雑誌名: Journal of clinical microbiology 巻: 50 号: 3 ページ: 857-866
  • DOI: 10.1128/jcm.05715-11
  • 査読あり
• [雑誌論文] 高感度に多型を検出するためのエキソーム・シークエンシング (2012)
  • 著者名/発表者名: 舟山亮, 長嶋剛史, 中山啓子
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 30 ページ: 629-34
  • URL: https://www.yodosha.co.jp/jikkenigaku/book/9784758100816/index.html
• [雑誌論文] Bach1 is critical for the transformation of mouse embryonic fibroblast by RasV12 and maintains ERK signaling (2012)
  • 著者名/発表者名: Nakanome A, Brydoun A, Matsumoto M, Ota K, Funayama R, Nakayama K, Ono M, Shiga K, Kobayashi T, Igarashi K
  • 雑誌名: Oncogene 巻: 32 号: 27 ページ: 3231-3245
  • DOI: 10.1038/onc.2012.336
  • 査読あり
• [雑誌論文] Nrf2-MafG heterodimers contribute globally to antioxidant and metabolic networks (2012)
  • 著者名/発表者名: Hirotsu Y, Katsuoka F, Funayama R, Nagashima T, Nishida Y, Nakayama K, Engel JD, Yamamoto M.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 巻: 40 号: 20 ページ: 10228-10239
  • DOI: 10.1093/nar/gks827
  • 査読あり
• [学会発表] がん遺伝子Rasによる転写変化後のH3K27me3修飾変化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 細金正樹, 舟山亮, 西田有一郎, 長嶋剛史, 中山啓子
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2013-12-03
• [学会発表] Ras-MAPKシグナルを介したFas遺伝子の転写抑制機構の解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 舟山亮, 細金正樹, 長嶋剛史, 中山啓子
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2013-12-03
• [学会発表] RAS-MAPKシグナルによる遺伝子発現制御とエピゲノム変化 (2013)
  • 著者名/発表者名: 舟山亮
  • 学会等名: 疾患エピゲノムコアセンター第1回ミニシンポジウム
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2013-10-26
• [学会発表] Comprehensive Analysis of Ras-Mediated Alternative Splicing (2013)
  • 著者名/発表者名: Matsushima, W., Funayama, R., Nagashima, T., Nakayama, K.
  • 学会等名: NIH-Tohoku University-JSPS Symposium
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2013-05-10
• [学会発表] Change of Trimethylation of H3K27 Occurs after Ras-mediated Transcriptional Regulation (2013)
  • 著者名/発表者名: Nakayama, K., Hosogane, M., Funayama, R., Nagashima, T.
  • 学会等名: NIH-Tohoku University-JSPS Symposium
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2013-05-09
• [学会発表] がん遺伝子Rasによる転写制御後にH3K27me3修飾変化が誘起される (2012)
  • 著者名/発表者名: 細金正樹, 舟山亮, 西田有一郎, 長嶋剛史, 中山啓子
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-14
• [学会発表] shRNAライブラリのスクリーニングによる遺伝子サイレンシング機構の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 舟山亮, 細金正樹, 長嶋剛史, 中山啓子
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-13
• [学会発表] RASシグナルによる選択的スプライシング変化の網羅的解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松島和洋, 舟山亮, 長嶋剛史, 中山啓子
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡
  • 年月日: 2012-12-12
• [学会発表] Comprehensive analysis of altemative splicing by next-generation sequencer (2012)
  • 著者名/発表者名: Matsushima, W., Funayama, R., Nagashima, T., Nakayama, K.
  • 学会等名: Winter Camp of GCOE 2012, Tohoku University Global COE for Conquest of Signal Transduction Diseases with"Network Medicine"
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2012-02-04
• [学会発表] Change of trimethylation of H3K27 occurs after Ras-mediated transcriptional regulation (2012)
  • 著者名/発表者名: Hosogane, M., Funayama, R., Nishida, Y., Nagashima, T., Nakayama, K.
  • 学会等名: Winter Camp of GCOE 2012, Tohoku University Global COE for Conquest of Signal Transduction Diseases with"Network Medicine"
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2012-02-04
• [学会発表] がん遺伝子Rasによる転写制御後にH3K27me3修飾変化が誘起される (2012)
  • 著者名/発表者名: 細金正樹, 舟山亮, 西田有一郎, 長嶋剛史, 中山啓子
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡県福岡市
• [学会発表] shRNAライブラリのスクリーニングによる遺伝子サイレンシング機構の解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 舟山亮, 細金正樹, 長嶋剛史, 中山啓子
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡県福岡市
• [学会発表] Nrf2-小Maf転写因子のゲノムワイド解析による遺伝子発現制御システムの解明 (2012)
  • 著者名/発表者名: 弘津陽介, 勝岡史城, 舟山亮, 長嶋剛史, 西田有一郎, 中山啓子, ジェームスダグラスエンゲル, 山本雅之
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡県福岡市
• [学会発表] RASシグナルによる選択的スプライシング変化の網羅的解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松島和洋, 舟山亮, 長嶋剛史, 中山啓子
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡県福岡市
• [学会発表] Bach1によるPparg遺伝子発現抑制を介した脂肪細胞分化阻害 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松本光代, 白木琢磨, ブリドンアンドレイ, 舟山亮, 西田有一郎, 中山啓子, 八重樫伸生, 五十嵐和彦
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡県福岡市
• [学会発表] RAS-MAPK シグナルによる遺伝子発現制御とエピゲノム変化
  • 著者名/発表者名: 舟山亮
  • 学会等名: 疾患エピゲノムコアセンター第1回ミニシンポジウム～未知の生命現象・疾患の解明を目指して～
  • 発表場所: 東北大学医学部（宮城県仙台市）
• [学会発表] Ras-MAPKシグナルを介したFas遺伝子の転写抑制機構の解析
  • 著者名/発表者名: 舟山亮, 細金正樹, 長嶋剛史, 中山啓子
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
• [学会発表] がん遺伝子Rasによる転写変化後のH3K27me3修飾変化
  • 著者名/発表者名: 細金正樹, 舟山亮, 西田有一郎, 長嶋剛史, 中山啓子
  • 学会等名: 第36回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
• [学会発表] Change of Trimethylation of H3K27 Occurs after Ras-mediated Transcriptional Regulation
  • 著者名/発表者名: Nakayama, K., Hosogane, M., Funayama, R., Nagashima, T.
  • 学会等名: NIH-Tohoku University-JSPS Symposium
  • 発表場所: 艮陵会館（宮城県仙台市）
• [学会発表] Comprehensive Analysis of Ras-Mediated Alternative Splicing
  • 著者名/発表者名: Matsushima, W., Funayama, R., Nagashima, T., Nakayama, K.
  • 学会等名: NIH-Tohoku University-JSPS Symposium
  • 発表場所: 艮陵会館（宮城県仙台市）
• [備考]
  • URL: http://www.devgen.med.tohoku.ac.jp/index.html