| 研究課題/領域番号 |
24710212
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| 研究種目 |
若手研究(B)
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| 配分区分 | 基金 |
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| 研究分野 |
ゲノム生物学
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| 研究機関 | 新潟薬科大学 |
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研究代表者 |
川野 光興 新潟薬科大学, 応用生命科学部, 助教 (00455338)
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| 研究期間 (年度) |
2012-04-01 – 2014-03-31
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| 研究課題ステータス |
完了 (2013年度)
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| 配分額 *注記 |
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2013年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2012年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
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| キーワード | マイクロRNA前駆体 / 機能性RNA / トランスクリプトーム / 次世代シーケンシング解析 / RNA編集 / 遺伝子発現 / ゲノム / LNAオリゴ / 小分子RNA / 次世代シーケンス / DNA/LNAオリゴ |
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| 研究概要 |
HeLa細胞で高発現している約80塩基のRNA配列リストを次世代シーケンス解析により作成し、それらRNAに相補的となる約30種類のLNA/DNAオリゴを合成した。これらのオリゴを逆転写反応液中に加え、標的となるcDNA産物の特異的な除去を行った。このようにして調整したcDNAライブラリーを次世代シーケンス解析したところ、LNA/DNAオリゴを加えないライブラリーに比べ、約10倍のpre-miRNAタグを回収することができ、ゲノムへのマップ部位も約2倍になった。これらデータを用いて詳細な解析を行ったところ、pre-miRNAの部位特異的な塩基付加や、中間産物の存在等を明らかにすることができた。
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