家族性ＩｇＡ腎症で例示されるエクソーム解析による原因遺伝子同定プロトコールの確立

• 研究課題/領域番号: 24710223
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: ゲノム医科学
• 研究機関: 国立遺伝学研究所
• 研究代表者: 細道 一善 国立遺伝学研究所, 総合遺伝研究系, 助教 (50420948)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2013年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2012年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
• キーワード: エクソームシーケンス / IgA腎症 / 疾患関連遺伝子

研究概要

本研究課題は、家族性IgA腎症を対象とし、エクソームシーケンスによる疾患原因変異の同定、疾患発症機序の解明、ならびにこれら一連の原因遺伝子同定から情報解析技術を駆使したプロトコールを確立することを目指している。家族性IgA腎症1家系のエクソームシーケンスによってIgAのトランスサイトーシスに関わり、腎臓で発現するEEA1に原因候補となる変異を同定した。さらに、家族性IgA腎症の発端者24名のうち5名に位置の異なる3つのEEA1の変異が認められた。これらの変異の集団内頻度は1%以下であるが、発端者24名中5名と高頻度に認められ、EEA1の変異は家族性IgA腎症の20%を説明しうると考えられた。

研究成果

• [雑誌論文] Exome sequencing identifies novel rheumatoid arthritis-susceptible variants in the BTNL2 (2013)
  • 著者名/発表者名: Mitsunaga S, Hosomichi K, Okudaira Y, Nakaoka H, Kunii N, Suzuki Y, Kuwana M, Sato S, Kaneko Y, Homma Y, Kashiwase K, Azuma F, Kulski JK, Inoue I, Inoko H
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 58 ページ: 210-215
  • NAID: 40019642228
  • 査読あり
• [雑誌論文] (2013)
  • 著者名/発表者名: 細道一善, 光永滋樹, 井ノ上逸朗
  • 雑誌名: 医学のあゆみ ページ: 439-443
• [雑誌論文] 次世代シークエンサーのデータ処理について (2013)
  • 著者名/発表者名: 細道一善, 井ノ上逸朗
  • 雑誌名: 分子精神医学 ページ: 101-107
• [雑誌論文] 次世代シーケンサー (2013)
  • 著者名/発表者名: 後藤眞, 細道一善, 成田一衛
  • 雑誌名: Annual Review腎臓 巻: 13 ページ: 995-1001
• [雑誌論文] 次世代シークエンサーのデータ処理について (2013)
  • 著者名/発表者名: 細道一善 井ノ上逸朗
  • 雑誌名: 分子精神医学 巻: 13 ページ: 101-107
• [雑誌論文] 次世代シークエンサー (2013)
  • 著者名/発表者名: 後藤眞 細道一善 成田一衛
  • 雑誌名: Annual Review 腎臓 2013 巻: 1 ページ: 101-107
• [雑誌論文] エクソーム解析による新規関節リウマチ感受性遺伝子の探索 (2013)
  • 著者名/発表者名: 細道一善 光永滋樹 井ノ上逸朗
  • 雑誌名: 医学のあゆみ 巻: 245 ページ: 439-443
• [学会発表] Exome Sequencing Identifies a Novel EEA1 Variant in Japanese Familial IgA Nephropathy (2012)
  • 著者名/発表者名: Shin Goto, Kazuyoshi Hosomichi, Hiroyasu Tsukaguchi, Ichiei Narita
  • 学会等名: American Society of Nephrology Kidney Week 2012
  • 発表場所: San Diego, USA
• [学会発表] Whole exome sequencing analysis of Japanese familial IgA nephropathy
  • 著者名/発表者名: Shin Goto, Kazuyoshi Hosomichi, Hiroyasu Tsukaguchi, Hirofumi Watanabe, Ituro Inoue, Ichiei Narita
  • 学会等名: The 14th Asian Pacific Congress of Nephrology
  • 発表場所: Shinagawa Prince Hotel