血管内皮細胞分化におけるエピジェネティクス解析

• 研究課題/領域番号: 24710227
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: システムゲノム科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 神吉 康晴 東京大学, アイソトープ総合センター, 助教 (00534869)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2013年度: 2,080千円 (直接経費: 1,600千円、間接経費: 480千円); 2012年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: エピゲノム制御 / 血管内皮細胞 / 細胞分化 / 転写因子 / ヒストン修飾 / 非翻訳RNA / GATA2

研究概要

本研究では、血管内皮細胞に焦点をあて、その分化機構を転写因子とエピゲノム修飾因子の視点から解析し、新たな分化制御因子を発見するのが目的である。マウスES細胞からの血管内皮細胞分化系を用いて、経時的なtranscriptome解析及びヒストン修飾解析を行った。その結果、特徴的なヒストン修飾パターンから、Gata2、Fli1、Sox7、Sox18を見出した。これら4つの転写因子をそれぞれノックダウンするとGata2のみでも内皮細胞分化は約50%阻害され、4つの転写因子を全てノックダウンすると顕著に阻害される結果となった。本研究により、血管内皮細胞分化の新たな転写因子ネットワークを提唱した。

研究成果

• [雑誌論文] Revolution of nephrology research by deep sequencing : ChIP-seq and RNA-seq. (2014)
  • 著者名/発表者名: Mimura I, Kanki Y, Kodama T, Nangaku M.
  • 雑誌名: Kidney International 巻: 85 号: 1 ページ: 31-38
  • DOI: 10.1038/ki.2013.321
  • 査読あり
• [雑誌論文] Direct evidence for pitavastatin induced chromatin structure change in the KLF4 gene in endothelial cells. (2014)
  • 著者名/発表者名: Maejima T, Inoue T, Kanki Y,,,,, Kodama T, Wada Y
  • 雑誌名: Plos One 巻: in press
  • NAID: 120006667792
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cross-enhancement of ANGPTL4 transcription by HIF1 alpha and PPAR beta/delta is the result of the conformational proximity of two response elements. (2014)
  • 著者名/発表者名: Inoue T, Kohro T, Tanaka T, Kanki Y, Li G, Poh HM, Mimura I, Kobayashi M, Taguchi A, Maejima T, Suehiro JI, Sugiyama A, Kaneki K, Aruga H, Dong S, Stevens JF, Yamamoto S, Tsutsumi S, Fujita T, Ruan X, Aburatani H, Nangaku M, Ruan Y, Kodama T, Wada Y.
  • 雑誌名: Genome Biology 巻: in press
  • 査読あり
• [雑誌論文] GATA factor switching from GATA2 to GATA1 contributes to erythroid differentiation (2013)
  • 著者名/発表者名: Suzuki M, Kobayashi-Osaki M, Tsutsumi S, Pan X, Ohmori S, Takai J, Moriguchi T, Ohneda O, Ohneda K, Shimizu R, Kanki Y, Kodama T, Aburatani H, Yamamoto M
  • 雑誌名: Genes Cells 巻: 18 号: 11 ページ: 921-933
  • DOI: 10.1111/gtc.12086
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inhibition of histone demethylase JMJD1A improves anti-angiogenic therapy and reduces tumor associated macrophages (2013)
  • 著者名/発表者名: Shimamura T, Wang F, Suehiro J, Kanki Y, Wada Y, Yuasa Y, Aburatani H, Miyano S, Minami T, Kodama T, Shibuya M
  • 雑誌名: Cancer Res 巻: 73 号: 10 ページ: 3019-3028
  • DOI: 10.1158/0008-5472.can-12-3231
  • 査読あり
• [雑誌論文] TNF alpha signals through specialized factories where responsive coding and miRNA genes are transcribed. (2012)
  • 著者名/発表者名: Papantonis, A., Kohro, T., Baboo, S., Larkin, J.D., Deng, B., Short, P., Tsutsumi, S., Taylor, S.,Kanki, Y., Kobayashi, M., Li, G., Poh, H., Ruan,X., Aburatani, H., Ruan, Y., Kodama, T., Wada,Y., and Cook, P. R.
  • 雑誌名: The EMBO journal 巻: 31 号: 23 ページ: 4404-4414
  • DOI: 10.1038/emboj.2012.288
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dynamic change of chromatin conformation in response to hypoxia enhances the expression of GLUT3 (SLC2A3) by cooperative interaction of hypoxia-inducible factor 1 and KDM3A. (2012)
  • 著者名/発表者名: Mimura I
  • 雑誌名: Mol Cell Biol. 巻: Aug;32(15) 号: 15 ページ: 3018-3032
  • DOI: 10.1128/mcb.06643-11
  • 査読あり
• [雑誌論文] Alternative splicing of CD44 mRNA by ESRP1 enhances lung colonization of metastatic cancer cell. (2012)
  • 著者名/発表者名: Yae T, Tsuchihashi K, Ishimoto T, Motohara T, Yoshikawa M, Yoshida GJ, Wada T, Masuko T,Mogushi K, Tanaka H, Osawa T, Kanki Y, et al
  • 雑誌名: Nature Communications 巻: 6;3 号: 1 ページ: 883-883
  • DOI: 10.1038/ncomms1892
  • 査読あり
• [学会発表] 染色体立体構造網羅解析からの細胞特異性解読へのアプローチ (2014)
  • 著者名/発表者名: 神吉康晴
  • 学会等名: 京都大学再生医科学研究所平成25年度共同研究報告会
  • 発表場所: 京都大学再生医科学研究所、京都市、日本
  • 招待講演
• [学会発表] エピゲノム制御からの 新規血管新生因子の同定 (2014)
  • 著者名/発表者名: 神吉康晴
  • 学会等名: 第2回生活習慣病の分子細胞病態学研究会
  • 発表場所: ホテル椿山荘東京、東京都、日本
• [学会発表] A novel epigenetic mechanism revealed tumor associated angiogenesis (2013)
  • 著者名/発表者名: 神吉 康晴
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、神奈川県
• [学会発表] Transcription factor GATA2 is indispensable for the differentiation and maintenance of vascular endothelial cells (2013)
  • 著者名/発表者名: 神吉 康晴
  • 学会等名: 第86回日本生化学会大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、神奈川県
• [学会発表] Transcription factor GATA2 is indispensable for the differentiation and maintenance of vascular endothelial cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki
  • 学会等名: The 11th Japan-Korea Joint Symposium on Vascular Biology
  • 発表場所: Hyatt Regency Jeju Hotel, Korea
• [学会発表] Comprehensive analyses revealed the epigenetic switch during the endothelial cell differentiation (2013)
  • 著者名/発表者名: 神吉 康晴
  • 学会等名: 第12回日本再生医療学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、神奈川県
• [学会発表] Transcription factor GATA2 is indispensable for the differentiation and maintenance of vascular endothelial cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki, Taichi Matsunaga, Hiroyuki Aburatani, Youichiro Wada, Tatsuhiko Kodama, Jun Yamashita, Takashi Minami
  • 学会等名: The 11th Japan-Korea Joint Symposium on Vascular Biology
  • 発表場所: Hyatt Regency jeju Hotel, Jeju Island, Korea
• [学会発表] Transcription factor GATA2 is indispensable for the differentiation and maintenance of vascular endothelial cells (2013)
  • 著者名/発表者名: 神吉康晴、興梠貴英、堤修一、三村維真理、松永太一、山水康平、片山志織、油谷浩幸、児玉龍彦、和田洋一郎、山下潤、南敬
  • 学会等名: 第86回日本生化学会大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜市、日本
• [学会発表] A novel epigenetic mechanism revealed tumor associated angiogenesis (2013)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki, Jun-ichi Suehiro, Tsuyoshi Osawa, Imari Mimura, Youichiro Wada, Hiroyuki Aburatani, Tatsuhiko Kodama, Takashi Minami
  • 学会等名: 第72回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、横浜市、日本
• [学会発表] Three Dimensional Chromatin Architecture Correlates with Two Opposite Transcription Factors, which contributes the Cell Specificity (2013)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki
  • 学会等名: The 5th HOPE meeting
  • 発表場所: グランドプリンスホテル新高輪
• [学会発表] Comprehensive analyses revealed the epigenetic switch during the endothelial cell differentiation. (2013)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki, Taichi Matsunaga, Youichiro Wada, Jun Yamashita, Takashi Minami
  • 学会等名: 第12回日本再生医療学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] Two transcription factors mediated opposite chromatin conformation correlates with endothelial cell specificity (2012)
  • 著者名/発表者名: 神吉 康晴
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場、福岡県
• [学会発表] Molecular mechanism about sustained VCAM-1 induction by the transcriptome and epigenomic analyses (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki
  • 学会等名: 第20回日本血管生物医学会学術集会(The 10th Korea-Japan Joint Symposium on Vascular Biology)
  • 発表場所: 徳島あわぎんホール、徳島県
• [学会発表] The initiation step about the changes of transcription factor bindings and histone modifications is involved in sustained gene inductions (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki
  • 学会等名: Keystone Symposia 2013 Aging and Diseases of Aging
  • 発表場所: Miyako Hotel Tokyo、東京都
• [学会発表] Regulation of the Endothelial-Mesenchymal Transition (EndMT) (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 札幌市教育文化会館、北海道
• [学会発表] Epigenetic Switch on the Differentiation of Mouse Vascular Endothelial Cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki
  • 学会等名: International Society for Stem Cell Research 10th Annual Meeting
  • 発表場所: Pacifico Yokohama、神奈川県
• [学会発表] Epigenetically coordinated GATA2 bindings are necessary for the endothelial cell specificity (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki, Takahide Kohro, Shuichi Tsutsumi, Imari Mimura, Takao Hamakubo, Takashi Minami, Youichiro Wada, Hiroyuki Aburatani, Tatsuhiko Kodama
  • 学会等名: 第6回日本エピジェネティクス研究会年会
  • 発表場所: 東京都学術総合センター
• [学会発表] ChIP-sequence Reveals Functional Interleukin-4-Inducible STAT6 Binding to the Vascular Cell Adhesion Molecule 1 Promoter (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu KANKI
  • 学会等名: 第12回東京大学生命科学シンポジウム
  • 発表場所: 東京大学
• [学会発表] Regulation of the Endothelial-Mesenchymal Transition (EndMT) (2012)
  • 著者名/発表者名: YASUHARU KANKI, Shuing Jiang, Shuichi Tstsumi, Takahide Kohro, Imari Mimura, Tatsuhiko Kodama, Makoto Naito, Hiroyuki Aburatani, Takashi Minami
  • 学会等名: 第71回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 札幌市教育文化会館
• [学会発表] ChIP-sequence Reveals Functional Interleukin-4-Inducible STAT6 Binding to the Vascular Cell Adhesion Molecule 1 Promoter (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki
  • 学会等名: NGS現場の会第2回研究会
  • 発表場所: 大阪ホテル阪急エキスポパーク
• [学会発表] The initiation step about the changes of transcription factor bindings and histone modifications is involved in sustained gene inductions. (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki, Hideto Tozawa, Jun-ichi Suehiro, Shuichi Tsutsumi, Takahide Kohro, Hiroyuki Aburatani, Youichiro Wada, Takashi Minami, Takao Hamakubo, Tatsuhiko Kodama
  • 学会等名: Keystone Symposia 2013 Aging and Diseases of Aging
  • 発表場所: Sheraton Miyako Hotel Tokyo
• [学会発表] Epigenetic Switch on the Differentiation of Mouse Vascular Endothelial Cells (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu KANKI, Kohei Yamamizu, Jun Yamashita
  • 学会等名: International Society for Stem Cell Research 10th Annual Meeting
  • 発表場所: Pacifico Yokohama
• [学会発表] Molecular mechanism about sustained VCAM-1 induction by the transcriptome and epigenomic analyses. (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu Kanki
  • 学会等名: 第20回日本血管生物医学会学術集会 (The 10th Korea-Japan Joint Symposium on Vascular Biology)
  • 発表場所: 徳島あわぎんホール
• [学会発表] Two transcription factors mediated opposite chromatin conformation correlates with endothelial cell specificity (2012)
  • 著者名/発表者名: Yasuharu KANKI, Teppei Shimamura, Miyako Fujii, Imari Mimura, Tsuyoshi Inoue, Takao Hamakubo, Hiroyuki Aburatani, Satoru Miyano, Takashi Minami, Youichiro Wada, Tatsuhiko Kodama
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場
• [図書] 血管医学 (2013)
  • 著者名/発表者名: 神吉康晴
  • 総ページ数: 9
  • 出版者: メディカルレビュー社
• [産業財産権] 血管内皮細胞の活性化に起因する疾患の治療又は予防剤 (2014)
  • 発明者名: 南 敬, 神吉 康晴, 末弘 淳一
  • 権利者名: 東京大学TLO/JST
  • 産業財産権種類: 特許
  • 取得年月日: 2014-01-28
  • 外国