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計算モデルを用いた哺乳類の概日リズムと細胞周期のカップリング機構の研究

研究課題

研究課題/領域番号 24710230
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 システムゲノム科学
研究機関山口大学

研究代表者

Faure Adrien (FAURE Adrien)  山口大学, 理工学研究科, 助教 (00610627)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2016-03-31
研究課題ステータス 完了 (2015年度)
配分額 *注記
3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
2015年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2014年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円)
2013年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円)
2012年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円)
キーワードcell cycle / circadian rhythms / logical modeling / regulatory network / circuit functionality / logical model / circadian clock / mammals / regulatory circuits / network / 概日リズム / 細胞周期 / ブーリアンモデル / 論理的モデル化手法 / シミュレーション
研究成果の概要

この研究の当初の目的は、概日時計による細胞周期の引き込みモデルを作ることであったが、この研究の開始年に、そのようなモデルは他者により発表されたため、当初の計画の方向を若干変更した。即ち、彼らのモデルを活用し、引き込みを解析する論理モデルを作成するためのテンプレートとした。
彼らのモデルが複雑であることや、研究の初期段階で得られた結果により、回路機能解析手法にある限界があることが明らかになり、問題が当初の想定より解決が困難であることが分かった。しかしながら、哺乳類の新しい細胞周期モデルを開発することができ、その論文は欧州で開催される国際会議ECCB2016に受理された。

報告書

(5件)
  • 2015 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2014 実施状況報告書
  • 2013 実施状況報告書
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2015 2013 2012

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 1件)

  • [雑誌論文] Boolean mapping of a multivalued model using GINsim - A toy example2015

    • 著者名/発表者名
      K. Mitani, H. Matsuno and A. Faure
    • 雑誌名

      IEICE Tech. Rep.

      巻: 114 ページ: 31-34

    • NAID

      110010017535

    • 関連する報告書
      2014 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Logical analysis of the entrainment of the cell cycle by the circadian clock2013

    • 著者名/発表者名
      Wataru Mori, Hiroshi Matsuno, Adrien Faure
    • 雑誌名

      IEICE Technical Report

      巻: MSS2013-88 ページ: 73-76

    • NAID

      110009861812

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Circuit functionality analysis in a gene regulatory network using GINsim - A toy example2013

    • 著者名/発表者名
      Kaori Mitani, Hiroshi Matsuno, Adrien Faure
    • 雑誌名

      IEICE Technical Report

      巻: MSS2013-86 ページ: 65-68

    • NAID

      110009861810

    • 関連する報告書
      2013 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Revisiting Delta-Notch signaling in Drosophila through logical modeling and analysis2013

    • 著者名/発表者名
      Mayuka Onishi, Hiroshi Matsuno, Adrien Faure
    • 雑誌名

      IEICE Technical Report

      巻: MSS2012-64 ページ: 31-36

    • NAID

      110009712286

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [雑誌論文] 状態推移シミュレーションによる時計遺伝子機構のシステム解析2012

    • 著者名/発表者名
      森渉, Adrien Faure, 松野浩嗣
    • 雑誌名

      第25回回路とシステムワークショップ論文集

      巻: - ページ: 450-455

    • NAID

      40019434407

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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