• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

プレマイクロRNA29aを標的とした分子設計指針の導出

研究課題

研究課題/領域番号 24710262
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 ケミカルバイオロジー
研究機関大阪大学

研究代表者

福澄 岳雄  大阪大学, 産業科学研究所, 特任助教 (00592768)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円)
2013年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
2012年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
キーワードRNA / ディスプレイスメントアッセイ / 分子間相互作用 / スクリーニング / ライブラリー / 表面プラズモン共鳴 / SPR / ケミカルバイオロジー / 分子間相互作用解析
研究概要

RNA研究の活発化に伴い,RNAを標的とした分子設計指針の確立が期待されている。RNAはヘアピンループやステムループ等のRNAに特有な高次構造を有し,これらがタンパクによる認識部位となる。しかし,小分子設計の視点では,多様性に富むRNAの構造をどのような分子が認識でき,どのような結合様式があるのかといった分子設計には不可欠となる基本情報が不足している。それゆえに,従来の創薬研究で利用されているタンパクを標的とした分子設計の知見を活かせていない。そこでRNAステムループに特異的に結合する分子に必要とされる構造要件を抽出するため,医療応用が注目されているマイクロRNAのなかでも,心疾患に関与していることが明らかにされているmiRNA29aに着目した。miRNA29aの生合成前駆体であるpre-miR29aに結合する小分子はmiRNA29aの機能抑制に利用でき,マイクロRNA研究での利用が期待されているためである。
pre-miR29aステムループを標的として設計した,8位にヘテロ環を導入したアデニン誘導体を合成した。合成した化合物ライブラリーは,先に研究室で開発していた蛍光指示薬を用いた蛍光ディスプレイスメントアッセイにより評価した。アデノシン8位に導入したヘテロ環の種類によって蛍光回復率に差が見られ,pre-miRNA29aに結合する候補化合物が合成した化合物ライブラリーの中から見つかった。
蛍光ディスプレイスメントアッセイにより得られた候補化合物とpre-miRNA29aとの定量的な結合解析を行うために,表面プラズモン共鳴(SPR)イメージング法を利用した定量的分子間相互作用解析を実施した。具体的には,5’位をビオチン標識したRNAを,SAセンサーチップ上に固定化した。さらに,候補化合物との相互作用解析を実施することにより,化合物構造がRNA配列に与える相関関係を考察した。

報告書

(2件)
  • 2013 実績報告書
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて 2013 2012

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Xanthone derivatives as potential inhibitors of miRNA processing by human Dicer: Targeting secondary structures of pre-miRNA by small molecules.2013

    • 著者名/発表者名
      Asako Murata, Takeo Fukuzumi, Shiori Umemoto, Kazuhiko Nakatani
    • 雑誌名

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      巻: 23 号: 1 ページ: 252-255

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2012.10.108

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure-activity studies on the fluorescent indicator in the displacement assay for the screening of small molecules binding to RNA.2012

    • 著者名/発表者名
      Shiori Umemoto, Seongwang Im, Jinhua Zhang, Masaki Hagihara, Asako Murata, Yasue Harada, Takeo Fukuzumi, Takahiro Wazaki, Shin-ichi Sasaoka, and Kazuhiko Nakatani
    • 雑誌名

      Chemistry A European Journal

      巻: 18 号: 32 ページ: 9999-10008

    • DOI

      10.1002/chem.201103932

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] マイクロRNA前駆体を標的とした小分子ライブラリーの合成と評価2013

    • 著者名/発表者名
      福澄岳雄・村田亜沙子・原田恭枝・梅本詩織・中谷和彦
    • 学会等名
      日本薬学会年会 第133年会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Synthesis of Small Molecule Library for pre-miRNA Secondary Structures2012

    • 著者名/発表者名
      Takeo Fukuzumi, Asako Murata, Yasue Harada, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      RNA 2012 The 17th Annual Meeting of the RNA Society
    • 発表場所
      Ann Arbor, Michigan, USA
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Synthesis of Small Molecule Library for pre-miRNA29a2012

    • 著者名/発表者名
      Takeo Fukuzumi, Asako Murata, Yasue Harada, Kazuhiko Nakatani
    • 学会等名
      IKCOC12
    • 発表場所
      Kyoto
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi