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ボロン酸による核酸末端構造認識を利用した核酸検出プローブの開発研究

研究課題

研究課題/領域番号 24710264
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 ケミカルバイオロジー
研究機関東京工業大学 (2013)
神奈川大学 (2012)

研究代表者

岡本 到  東京工業大学, 生命理工学研究科, 東工大特別研究員 (40460133)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
2013年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2012年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
キーワードRNA検出 / ボロン酸 / 蛍光 / 核酸 / フェニルボロン酸 / 核酸化学 / ボロン酸エステル / 光誘起電子移動 / 分子認識 / プローブ / ジオール
研究概要

本研究の目的は、RNA鎖を配列特異的に検出可能なプローブの開発である。PET現象により消光される蛍光発色団とフェニルボロン酸部位を持つDNA鎖をプローブとして利用した。RNA鎖に特徴的な化学構造である3'末端cis-2,3-ジオール構造をボロン酸エステル形成反応により認識し、標的RNA鎖と二重鎖形成した時のみ消光が解消され、蛍光回復しRNA検出が可能となると期待した。研究の結果、蛍光発色団とフェニルボロン酸部位を併せ持つプローブの合成に成功した。このプローブはRNA鎖と二重鎖を形成した時に蛍光の回復が見られた。一方、DNA鎖存在下では蛍光の回復は見られなかった。

報告書

(3件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2013 2012

すべて 学会発表 (7件)

  • [学会発表] 標的RNA鎖3'末端と結合し蛍光強度が増加する新規RNA検出プローブの合成と性質2013

    • 著者名/発表者名
      大野健太郎, 小野晶, 岡本到
    • 学会等名
      日本化学会第93春季年会
    • 発表場所
      立命館大学びわこ・くさつキャンパス
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 標的RNA鎖3'末端に結合し蛍光強度が変化する新規RNA検出プローブの合成と性質2013

    • 著者名/発表者名
      大野健太郎, 實吉尚郎, 小野晶, 岡本到
    • 学会等名
      第7回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋大学東山キャンパス
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Synthesis of a RNA detecting probe which binds a 3- end sequence of a target RNA and increase fluorescence intensity2013

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Ohno, Hisao Saneyoshi, Akira Ono, Itaru Okamoto
    • 学会等名
      The 40th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2013)
    • 発表場所
      Kanagawa University, Yokohama, (222-223pp)
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Synthesis of a RNA detecting probe which binds a 3’end sequence of a target RNA and increase fluorescence intensity2013

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Ohno , Hisao Saneyoshi, Akira Ono, Itaru Okamoto
    • 学会等名
      The 40th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 標的RNA鎖3'末端と結合し蛍光強度が増加する新規RNA検出プローブの合成と性質2013

    • 著者名/発表者名
      大野健太郎、小野晶、岡本到
    • 学会等名
      日本化学会 第93回 春季年会
    • 発表場所
      立命館大学びわこ・草津キャンパス 滋賀
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Preparation of a Novel RNA Detecting Probe which Increase Fluorescent Intensity by Binding to the 3'‐End of a Target RNA2012

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Ohno, Akira Ono, Itaru Okamoto
    • 学会等名
      XX International Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids
    • 発表場所
      Montreal, Quebec, Canad
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] Preparation of a Novel RNA Detecting Probe which Increase Fluorescent Intensity by Binding to the 3’‐End of a Target RNA2012

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Ohno, Akira Ono, Itaru Okamoto
    • 学会等名
      XX International Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids
    • 発表場所
      Montreal, Canada
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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