カレイ目魚類のミトコンドリアゲノミクス：高次系統解析とゲノム構造の進化

• 研究課題/領域番号: 24770082
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 独立行政法人国立科学博物館
• 研究代表者: 佐藤 崇 独立行政法人国立科学博物館, 標本資料センター, 特定非常勤研究員 (60436516)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2014年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2012年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
• キーワード: カレイ目 / ミトコンドリアゲノム / 分子系統 / 分子進化 / 遺伝子配置 / 系統解析

研究成果の概要

本研究では，ミトコンドリアゲノム全塩基配列をもちいて，カレイ目魚類の全体を網羅する頑健な系統樹を構築することを目指して解析を進めた．最終的に，既知のカレイ目のほぼ全科と半数以上の属，15%の種数をカバーする13科72属100種の新規データを決定し，外群や既登録データを加えた総計180種を網羅する系統樹を構築することができた．その結果，カレイ目の単系統性は弱いながらも支持され，現行の分類体系に即した目内の2亜目や3上科の単系統性も支持された．また，ヒラメ科が大きく2つに分かれる非単系統群であることを明瞭に示すことができた．さらに本目魚類から，4科で8パターンの遺伝子配置変動が発見された．

研究成果

• [雑誌論文] Mitochondrial genomic investigation of flatfish monophyly. (2014)
  • 著者名/発表者名: Campbell M. A., J. A. Lopez, T. P. Satoh, W. J. Chen and M. Miya
  • 雑誌名: Gene 巻: 551(2) 号: 2 ページ: 176-182
  • DOI: 10.1016/j.gene.2014.08.053
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] First Record of the Longlure Flatfish, Asterorhombus filifer (Pleuronectiformes: Bothidae), from Japan (2014)
  • 著者名/発表者名: Katayama, E., T. P. Satoh and K. Matsuura.
  • 雑誌名: Species Diversity 巻: 19 号: 2 ページ: 85-89
  • DOI: 10.12782/sd.19.2.085
  • NAID: 110009872232
  • ISSN: 1342-1670, 2189-7301
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Mitogenomic circumscription of a novel percomorph fish clade mainly comprising "Syngnathoidei" (Teleostei) (2014)
  • 著者名/発表者名: Ha Yeun Song, K. Mabuchi, T. P. Satoh, J. A. Moore, Y. Yamanoue, M. Miya, M. Nishida
  • 雑誌名: Gene 巻: 542 号: 2 ページ: 146-155
  • DOI: 10.1016/j.gene.2014.03.040
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolutionary origin of the Scombridae (tunas and mackerels) : members of a Paleogene adaptive radiation with 14 other pelagic fish families (2013)
  • 著者名/発表者名: Miya, M., Friedman, M., Satoh, T.P., Takeshima, H., Sado, T., Iwasaki, W., Yamanoue, Y., Nakatani, M., Mabuchi, K., Inoue, J.G., Poulsen, J.Y., Fukunaga, T., Sato, Y. and Nishida, M
  • 雑誌名: PLOS ONE 巻: 8 号: 9 ページ: e73535-e73535
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0073535
  • 査読あり
• [雑誌論文] MitoFish and MitoAnnotator : a mitochondrial genome database of fish with an accurate and automatic annotation pipeline (2013)
  • 著者名/発表者名: Iwasaki, W., Fukunaga T., Isagozawa R., Yamada K., Maeda Y., Satoh T.P., Sado T., Mabuchi K., Takeshima H., Miya, M. and Nishida M
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 巻: 30 号: 11 ページ: 2531-2540
  • DOI: 10.1093/molbev/mst141
  • 査読あり
• [学会発表] ミトコンドリアゲノム全長配列によるカレイ目魚類の網羅的系統解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 佐藤 崇・宮 正樹・西田 睦
  • 学会等名: 日本魚類学会
  • 発表場所: 神奈川県立 生命の星・地球博物館
  • 年月日: 2014-11-15 – 2014-11-16
• [学会発表] 若狭湾で採集されたサケガシラ属魚類 (2014)
  • 著者名/発表者名: 田城 文人・佐藤 崇・鈴木 啓太・佐藤 圭一
  • 学会等名: 日本魚類学会
  • 発表場所: 神奈川県立 生命の星・地球博物館
  • 年月日: 2014-11-15 – 2014-11-16
• [学会発表] ミトコンドリアゲノム全長配列から推定されたダルマガレイ科魚類の系統関係 (2012)
  • 著者名/発表者名: 佐藤 崇，他2名
  • 学会等名: 日本魚類学会
  • 発表場所: 山口県下関市水産大学校
• [学会発表] 国立科学博物館に所蔵する四国海盆や小笠原諸島近海で採集された深海魚標本 (2012)
  • 著者名/発表者名: 篠原現人，中江雅典，佐藤 崇，他3名
  • 学会等名: 日本魚類学会
  • 発表場所: 山口県下関市水産大学校
• [学会発表] Phylogeny of the lefteye flounders (family Bothidae): a mitogenomic perspective.
  • 著者名/発表者名: Takashi P. Satoh, Masaki Miya and Mutsumi Nishida
  • 学会等名: The 9th Indo-Pacific Fish Conference
  • 発表場所: Okinawa Convention Center
• [学会発表] 自然史標本からわかること ～標本を利用した研究例の紹介～
  • 著者名/発表者名: 佐藤 崇
  • 学会等名: 日本進化学会第１５回大会
  • 発表場所: 筑波大学
  • 招待講演