非特異―特異複合体形成の動的構造解析による転写因子のＤＮＡ認識機構の解明

• 研究課題/領域番号: 24770106
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 公益財団法人サントリー生命科学財団
• 研究代表者: 原田 英里砂 公益財団法人サントリー生命科学財団, その他部局等, 研究員 (70541332)
• 連携研究者: 菅瀬 謙治 公財)サントリー生命科学財団 (00300822)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2013年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円); 2012年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
• キーワード: NMR / 蛋白質構造

研究概要

iPS細胞作製に用いられる転写因子（Yamanaka因子）の１つであるSox2タンパク質ではHMG（High Mobility Group）ドメインがたった6-7残基のDNA配列を認識し結合することで、DNAと複合体を形成する。本研究では、sox2のDNA認識機構を理解するためにNMRを用いた解析を行い、sox2のHMGドメイン単体では揺らいでおり、認識配列のDNAに結合することで構造が安定化するということを見出した。

研究成果

• [雑誌論文] Solid-state NMR spectra of lipid- anchored proteins under magic angle spinning (2014)
  • 著者名/発表者名: Nomura, K., Harada, E., Sugase, K., Shimamoto, K.
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. B. 巻: 118 ページ: 2405-2413
  • 査読あり
• [学会発表] Characterizing Conformational Flexibility of a DNA Binding Protein (2014)
  • 著者名/発表者名: Erisa Harada, Tsuyoshi Konuma, Kenji Sugase
  • 学会等名: 55th Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference
  • 発表場所: Boston, USA
• [学会発表] Characterizing Conformational Flexibility of a DNA Binding Protein (2014)
  • 著者名/発表者名: Erisa Harada, Tsuyoshi Konuma, Kenji Sugase
  • 学会等名: 55th Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference
  • 発表場所: アメリカ ボストン
• [学会発表] Mechanism of the distal regulation of substrate binding through intrinsic fluctuation in an enzyme (2013)
  • 著者名/発表者名: Kenji Sugase
  • 学会等名: The 10^<th> Korea-Japan Bilaterial Symposium on Biological NMR
  • 発表場所: Seuol, Korea
  • 年月日: 2013-07-04
• [学会発表] Analysis of protein dynamics in living human cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Kenji Sugase, Erisa Harada, Toshio Takahashi, Shoko Mori
  • 学会等名: 第36回分子生物学会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] Elucidation of nonspecific DNA-binding mechanism by quantitative analysis of chemical shift changes (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsuyoshi Konuma, Erisa Harada, Takashi Oda, Mamoru Sato, Kenji Sugase
  • 学会等名: 5^<th> Asia-Pacific NMR Symposium
  • 発表場所: Brisbane, Australia
• [学会発表] Extracting information on protein dynamics from crowded NMR spectra using relaxation dispersion difference (2013)
  • 著者名/発表者名: Tsuyoshi Konuma, Erisa Harada, Kenji Sugase
  • 学会等名: 5^<th> Asia-Pacific NMR Symposium
  • 発表場所: Brisbane, Australia
• [学会発表] Analysis of protein dynamics in living human cells (2013)
  • 著者名/発表者名: Kenji Sugase, Erisa Harada, Toshio Takahashi, Shoko Mori
  • 学会等名: 第３６回分子生物学会
  • 発表場所: 神戸
• [学会発表] Elucidation of the DNA-binding dynamics of the transcription factor Oct3/4 POU homeodomain (2012)
  • 著者名/発表者名: Tsuyoshi Konuma, Erisa Harada, Kenji Sugase
  • 学会等名: 25th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
  • 発表場所: Lyon, France
• [学会発表] 揺らぎが制御するヘム分解酵素反応の遠位効果 (2012)
  • 著者名/発表者名: 原田、杉島、原田、野口、福山、菅瀬
  • 学会等名: 第35回 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡