間期核クロマチンの超分解能多色イメージング

• 研究課題/領域番号: 24770113
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 独立行政法人情報通信研究機構
• 研究代表者: 松田 厚志 独立行政法人情報通信研究機構, 未来ICT研究所バイオICT研究室, 研究員 (20585723)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2014-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2013年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2013年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円); 2012年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: クロマチン / 高分解能顕微鏡観察 / 超分解能顕微鏡

研究概要

ゲノムは、ユークロマチンとヘテロクロマチンに分かれる。ユークロマチンは脱凝縮しており、ヘテロクロマチンは凝縮していると考えられている。超分解能顕微鏡により分裂酵母の間期核クロマチン構造を解析した結果、サブテロメア領域のヘテロクロマチンが脱凝縮している一方、高度に凝縮した約50kbの領域が隣接しているという、通説とは全く異なるクロマチン構造を見出した。このクロマチン領域の凝縮は、HP1ホモログなど既知のヘテロクロマチン形成とは異なる遺伝経路により支配されていた。

研究成果

• [雑誌論文] 超高分解蛍光顕微鏡法 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松田厚志、平野泰弘、原口徳子
  • 雑誌名: 光アライアンス 巻: 2014年3月号 ページ: 31-35
• [雑誌論文] Autophagosomes form at ER.mitochondria contact sites (2013)
  • 著者名/発表者名: Hamasaki M, Furuta N, Matsuda A, Nezu A, Yamamoto A, Fujita N, Oomori H, Noda T, Haraguchi T, Hiraoka Y, Amano A, Yoshimori T
  • 雑誌名: Nature 巻: 495 号: 7441 ページ: 389-93
  • DOI: 10.1038/nature11910
  • 査読あり
• [雑誌論文] 内構造観察のための超分解能蛍光イメージング技術 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松田厚志、平野泰弘、平岡泰
  • 雑誌名: 細胞工学 巻: Vol 31 ページ: 863-869
• [雑誌論文] 核内構造観察のための超分解能蛍光イメージング技術 (2012)
  • 著者名/発表者名: 1. 松田厚志、平野泰弘、平岡泰
  • 雑誌名: 細胞工学 巻: 31 ページ: 863-869
• [学会発表] 分裂酵母減数分裂期前期染色体構造の3D-SIM解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 丁大橋、松田厚志、原口徳子、平岡泰
  • 学会等名: 「ゲノムを支える非コードDNA領域の機能」公開シンポジウムインターメアによる染色体制御機構
  • 発表場所: 東京大学山上会館、東京都
• [学会発表] 分裂酵母減数分裂期前期染色体構造の３D-SIM解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 丁大橋、松田厚志、原口徳子、平岡泰
  • 学会等名: 「ゲノムを支える非コードＤＮＡ領域の機能」公開シンポジウム
  • 発表場所: 東京大学山上会館、東京都
• [学会発表] 超分解能顕微鏡3DSIMにより見るクロマチン構造 (2013)
  • 著者名/発表者名: 松田厚志
  • 学会等名: 広島大学セミナー
  • 発表場所: 広島大学、広島県広島市
  • 年月日: 2013-09-17
• [学会発表] 高分解能顕微鏡 (2013)
  • 著者名/発表者名: 松田厚志
  • 学会等名: 第21回細胞生物学ワークショップ
  • 発表場所: 未来ICT研究所、兵庫県神戸市
  • 年月日: 2013-08-08
• [学会発表] デノイジング (2013)
  • 著者名/発表者名: 松田厚志
  • 学会等名: 第21回細胞生物学ワークショップ
  • 発表場所: 未来ICT研究所、兵庫県神戸市
  • 年月日: 2013-08-07
• [学会発表] Fine structures of meiosis-specific chromosome and homologous chromosome pairing in S. pombe (2013)
  • 著者名/発表者名: Da-Qiao Ding, Atsushi Matsuda, Tokuko Haraguchi, Yasushi Hiraoka
  • 学会等名: Pombe 2013 (7th International Fission Yeast Meeting)
  • 発表場所: University of London, London, UK
  • 年月日: 2013-06-29
• [学会発表] The Reconstruction process of structured illumination microscopy (2013)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Matsuda
  • 学会等名: Superresolution Microscopy Workshop - Seeing Biology at the Nanoscale
  • 発表場所: IMB, Biopolice, Singapore, Singapore
  • 年月日: 2013-06-19
  • 招待講演
• [学会発表] Practical Localization microscopy on noisy biological samples (2013)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Matsuda
  • 学会等名: Superresolution Microscopy Workshop - Seeing Biology at the Nanoscale
  • 発表場所: IMB, Biopolice, Singapore, Singapore
  • 年月日: 2013-06-18
  • 招待講演
• [学会発表] 分裂酵母減数分裂期前期染色体構造の3D-SIM解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 丁大橋、松田厚志、原口徳子、平岡泰
  • 学会等名: 第31回染色体ワークショップ ・ 第12回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: ホテルおかだ、神奈川県足柄下郡
• [学会発表] Trouble shooting 3DSIM in the Fourier space Structured Illumination (2013)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Matsuda
  • 学会等名: Biomedical Applications and Future Developments meeting
  • 発表場所: Wellcome Trust offices, London, United Kingdom
• [学会発表] Super-resolution microscopic measurements of chromatin compaction in fission yeast reveal uncoupling of condensed chromatin from silent loci (2013)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Matsuda, Hiroshi Kimura, Tokuko Haraguchi, Yasushi Hiraoka
  • 学会等名: EMBO Nuclear Structure and Dynamics meeting
  • 発表場所: L'Isle-sur-la-Sorgue, France
• [学会発表] 分裂酵母減数分裂期前期染色体構造の３D-SIM解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 丁大橋、松田厚志、原口徳子、平岡泰
  • 学会等名: 第31回染色体ワークショップ・第12回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: ホテルおかだ、神奈川県足柄下郡
• [学会発表] Trouble shooting 3DSIM in the Fourier space (2013)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Matsuda
  • 学会等名: Structured Illumination: Biomedical Applications and Future Developments meeting
  • 発表場所: Wellcome Trust offices, London,United Kingdom
• [学会発表] Super-resolution microscopic measurements of chromatin compaction in fission yeast reveal uncoupling of condensed chromatin from silent loci (2013)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Matsuda, Hiroshi Kimura, Tokuko Haraguchi, Yasushi Hiraoka
  • 学会等名: EMBO Nuclear Structure and Dynamics meeting
  • 発表場所: The Domaine de Mousquety, L'Isle-sur-la-Sorgue, France
• [学会発表] 超分解能顕微鏡3DSIMにより見るクロマチン構造 (2013)
  • 著者名/発表者名: 松田厚志
  • 学会等名: 広島大学セミナー
  • 発表場所: 広島大学、広島県
  • 招待講演
• [学会発表] 高分解能顕微鏡 (2013)
  • 著者名/発表者名: 松田厚志
  • 学会等名: 第21回細胞生物学ワークショップ
  • 発表場所: 未来ICT研究所、神戸市
• [学会発表] Fine structures of meiosis-specific chromosome and homologous chromosome pairing in S. pombe (2013)
  • 著者名/発表者名: Da-Qiao Ding, Atsushi Matsuda, Tokuko Haraguchi, Yasushi Hiraoka
  • 学会等名: Pombe 2013
  • 発表場所: University of London, UK
• [学会発表] The Reconstruction process of structured illumination microscopy (2013)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Matsuda
  • 学会等名: Superresolution Microscopy Workshop - Seeing Biology at the Nanoscale
  • 発表場所: IMB, Biopolice, Singapore
  • 招待講演
• [学会発表] Practical Localization microscopy on noisy biological samples (2013)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Matsuda
  • 学会等名: Superresolution Microscopy Workshop - Seeing Biology at the Nanoscale
  • 発表場所: IMB, Biopolice, Singapore
  • 招待講演
• [学会発表] 分裂酵母の間期核クロマチンの凝縮率 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松田厚志、木村宏、平岡泰、原口徳子
  • 学会等名: 第30回染色体ワークショップ・第11回核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 兵庫県立淡路夢舞台国際会議場、兵庫県淡路市
  • 年月日: 2012-12-21
• [学会発表] 分裂酵母減数分裂期染色体構造の相同染色体対合における役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 丁大橋、松田厚志、原口徳子、平岡泰
  • 学会等名: 第35回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡、福岡県福岡市
  • 年月日: 2012-12-13
  • 招待講演
• [学会発表] Deep STORM (2012)
  • 著者名/発表者名: 松田厚志
  • 学会等名: 第4回「光塾」
  • 発表場所: 北海道大学、北海道札幌市
  • 年月日: 2012-08-26
  • 招待講演
• [学会発表] Live and precise 3D registration of multicolor 3D structured illumination microscopy unveils higher-order structural organization of fission yeast chromatin (2012)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Matsuda, Yasushi Hiraoka, Tokuko Haraguchi
  • 学会等名: Focus on Microscopy 2012
  • 発表場所: SUNTEC Singapore International Convention & Exhibition Centre, Singapore, Singapore
  • 年月日: 2012-04-02
• [学会発表] Deep STORM (2012)
  • 著者名/発表者名: 松田厚志
  • 学会等名: 第4回「光塾」
  • 発表場所: 北海道大学、北海道
  • 招待講演
• [学会発表] 分裂酵母減数分裂期染色体構造の相同染色体対合における役割 (2012)
  • 著者名/発表者名: 丁大橋、松田厚志、原口徳子、平岡泰
  • 学会等名: 第35回 日本分子生物学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡、福岡県
  • 招待講演
• [学会発表] 分裂酵母の間期核クロマチンの凝縮率 (2012)
  • 著者名/発表者名: 松田厚志、木村宏、平岡泰、原口徳子
  • 学会等名: 第30 回 染色体ワークショップ・第 11 回 核ダイナミクス研究会
  • 発表場所: 兵庫県立 淡路夢舞台国際会議場、兵庫県
• [学会発表] Live and precise 3D registration of multicolor 3D structured illumination microscopy unveils higher-order structural organization of fission yeast chromatin (2012)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Matsuda, Yasushi Hiraoka, Tokuko Haraguchi
  • 学会等名: Focus on Microscopy
  • 発表場所: Suntec, Singapore
• [備考]
  • URL: http://www2.nict.go.jp/advanced_ict/bio/w131103/CellMagic/
• [備考]
  • URL: http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/labs/hiraoka/index.html
• [備考] 情報通信研究機構・未来ICT研究所・バイオICT研究室ホームページ
  • URL: http://www2.nict.go.jp/advanced_ict/bio/w131103/CellMagic/
• [備考] 大阪大学生命機能研究科核ダイナミクス研究室ホームページ
  • URL: http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/labs/hiraoka/index.html