プラスミドが異種細菌間を接合伝達するための必須因子の同定

• 研究課題/領域番号: 24780087
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 応用微生物学
• 研究機関: 静岡大学
• 研究代表者: 新谷 政己 静岡大学, 工学研究科, 准教授 (20572647)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2015-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2014年度)
• 配分額: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円); 2014年度: 1,040千円 (直接経費: 800千円、間接経費: 240千円); 2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2012年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
• キーワード: プラスミド / 接合伝達 / 核様態タンパク質

研究成果の概要

本研究は，環境中における遺伝子の伝播を担うプラスミドpCAR1を用いて，異種細菌間におけるプラスミドの接合伝達を成立させる必須因子の取得を目的として行った．その結果，pCAR1上にコードされる3つの異なる核様態タンパク質(NAPs)が，異種微生物間の接合伝達における必須因子であることが示唆された．またORF145-146は，接合伝達に必須でないが，異種細菌間の伝達頻度に影響を及ぼすことが示された．また，NAP遺伝子は，他の様々な接合伝達性プラスミド上に分布していることも示した．さらに，異種微生物間の伝達を理解する上で重要な，プラスミドを一時的に受容可能な宿主の検出・分離・解析手法も確立した．

研究成果

• [雑誌論文] Effects of three different nucleoid-associated proteins encoded on IncP-7 plasmid pCAR1 on host Pseudomonas putida KT2440 (2015)
  • 著者名/発表者名: Suzuki-Minakuchi C., R. Hirotani, M. Shintani, T. Takeda, Y. Takahashi, K. Matsui, D. Vasileva, C.-S. Yun, K. Okada, H. Yamane, and H. Nojiri
  • 雑誌名: Applied and Environmental Microbiology 巻: 81 号: 8 ページ: 2869-2880
  • DOI: 10.1128/aem.00023-15
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Genomics of microbial plasmids: classification and identification based on replication and transfer systems and host taxonomy (2015)
  • 著者名/発表者名: 新谷政己，Zoe Sanchez，金原和秀
  • 雑誌名: Frontiers in Microbiology 巻: なし
  • DOI: 10.3389/fmicb.2015.00242
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Modulation of primary cell functions of host Pseudomonas bacteria by conjugative plasmid pCAR1 (2015)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, Y., M. Shintani, N. Takase, Y. Kazou, F. Kawamura, H. Hara, H. Nishida, K. Okada, H. Yamane, and H. Nojiri
  • 雑誌名: Environmental Microbiology 巻: 17 号: 1 ページ: 134-155
  • DOI: 10.1111/1462-2920.12515
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Nucleoid-associated proteins encoded on plasmids: Occurrence and mode of function (2015)
  • 著者名/発表者名: 新谷政己，水口（鈴木）千穂，野尻秀昭
  • 雑誌名: Plasmid 巻: 印刷中 ページ: 32-44
  • DOI: 10.1016/j.plasmid.2015.04.008
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Single-cell analyses revealed transfer ranges of IncP-1, IncP-7, and IncP-9 plasmids in a soil bacterial community (2014)
  • 著者名/発表者名: Shintani M, Matsui K, Inoue J, Hosoyama A, Ohji S, Yamazoe A, Nojiri H, Kinbara K, Ohkuma M
  • 雑誌名: Appl. Environ. Microbiol. 巻: 80 号: 1 ページ: 138-145
  • DOI: 10.1128/aem.02571-13
  • 査読あり
• [雑誌論文] Conjugative elements: Host chromosome function modifiers (2014)
  • 著者名/発表者名: 新谷政己，高橋裕里香，野尻秀昭
  • 雑誌名: Biodegradative Bacteria 巻: 2014 ページ: 129-152
  • DOI: 10.1007/978-4-431-54520-0_7
  • ISBN: 9784431545194, 9784431545200
  • 査読あり
• [雑誌論文] 環境中におけるプラスミドの挙動解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 新谷政己，松井一泰，金原和秀，野尻秀昭
  • 雑誌名: 環境バイオテクノロジー学会誌 巻: 13 ページ: 125-134
  • NAID: 40020320833
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mobile genetic elements (MGEs) carrying catabolic genes. (2013)
  • 著者名/発表者名: 新谷 政己
  • 雑誌名: Management of Microbial Resources in the Environment” (eds. A. Malik, E. Grohmann, and M. Alves) 巻: なし ページ: 167-214
  • DOI: 10.1007/978-94-007-5931-2_8
  • ISBN: 9789400759305, 9789400759312
  • 査読あり
• [雑誌論文] 異なる栄養条件下におけるプラスミドの接合伝達頻度の比較解析 (2012)
  • 著者名/発表者名: 新谷政己，李美英，松井一泰，大熊盛也，岡田憲典，野尻秀昭
  • 雑誌名: 環境バイオテクノロジー学会誌 巻: 12(2) ページ: 163-167
  • NAID: 40019972074
  • 査読あり
• [学会発表] 接合伝達性プラスミドのモデル環境下における挙動解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 片岡大亮，飯田健義，大熊盛也，金原和秀，新谷政己
  • 学会等名: 日本農芸化学会2015年度大会
  • 発表場所: 岡山大学（岡山県，岡山市）
  • 年月日: 2015-03-26 – 2015-03-29
• [学会発表] 宿主の状態がプラスミドの接合伝達に及ぼす影響の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 柳田晃輔，松井一泰，新谷政己，水口（鈴木）千穂，岡田憲典，野尻秀昭
  • 学会等名: 日本農芸化学会2015年度大会
  • 発表場所: 岡山大学（岡山県，岡山市）
  • 年月日: 2015-03-26 – 2015-03-29
• [学会発表] 一細胞解析手法によるプラスミドの宿主域解明の試み (2015)
  • 著者名/発表者名: 新谷政己
  • 学会等名: 第9回日本ゲノム微生物学会
  • 発表場所: 神戸大学（兵庫県，神戸市）
  • 年月日: 2015-03-06 – 2015-03-08
  • 招待講演
• [学会発表] Behaviors of IncP-1 plasmids in various environments. (2015)
  • 著者名/発表者名: 新谷政己
  • 学会等名: Thailand-Japan Joint Symposium
  • 発表場所: Kasetsert University （タイ王国）
  • 年月日: 2015-03-05
  • 招待講演
• [学会発表] Transfers of degradative plasmids in various environments (2015)
  • 著者名/発表者名: 新谷政己
  • 学会等名: Interdisciplinary Symposium on Environmental Microbiology for Sustainable Society
  • 発表場所: 名古屋工業大学（愛知県，名古屋市）
  • 年月日: 2015-02-05 – 2015-02-06
  • 招待講演
• [学会発表] Behaviors of plasmids in various environments (2014)
  • 著者名/発表者名: 新谷政己
  • 学会等名: 第3回浜松科学技術研究振興会ミニシンポジウム"Research Frontiers in Environmental Microbiology-Behaviors and Diversity-
  • 発表場所: 静岡大学（静岡県，浜松市）
  • 年月日: 2014-10-25
  • 招待講演
• [学会発表] モデル環境下における接合伝達性プラスミドの挙動解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 飯田健義, 竹本裕史, 山村杏子, 片岡大亮, 金原和秀, 新谷政己
  • 学会等名: 環境微生物系学会合同大会2014
  • 発表場所: アクトシティ浜松コングレスセンター（静岡県，浜松市）
  • 年月日: 2014-10-21 – 2014-10-24
• [学会発表] プラスミドの接合伝達に影響を与える環境要因の探索 (2014)
  • 著者名/発表者名: 柳田晃輔，松井一泰，新谷政己，水口(鈴木)千穂，岡田憲典，野尻秀昭
  • 学会等名: 環境微生物系学会合同大会2014
  • 発表場所: アクトシティ浜松コングレスセンター（静岡県，浜松市）
  • 年月日: 2014-10-21 – 2014-10-24
• [学会発表] 可動性遺伝因子を介した微生物のコミュニケーション (2014)
  • 著者名/発表者名: 新谷政己
  • 学会等名: 第66回日本生物工学会大会シンポジウム「若手が切り拓く “Biofilm/cell-cell communication研究の新展開”」
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道，札幌市）
  • 年月日: 2014-09-09 – 2014-09-11
  • 招待講演
• [学会発表] モデル環境下における接合伝達性プラスミドの挙動解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 飯田健義, 竹本裕史, 山村杏子, 片岡大亮, 金原和秀, 新谷政己
  • 学会等名: 第66回日本生物工学会大会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター（北海道，札幌市）
  • 年月日: 2014-09-09 – 2014-09-11
• [学会発表] 環境微生物の一細胞レベルの単離と解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 新谷政己
  • 学会等名: 日本農芸化学会2014年度大会
  • 発表場所: 明治大学生田キャンパス（神奈川県）
  • 招待講演
• [学会発表] 環境条件がIncP-7群プラスミドpCAR1の接合伝達頻度・宿主域に及ぼす影響の解明 (2014)
  • 著者名/発表者名: 柳田晃輔，松井一泰，新谷政己，岡田憲典，野尻秀昭
  • 学会等名: 日本農芸化学会2014年度大会
  • 発表場所: 明治大学生田キャンパス（神奈川県）
• [学会発表] プラスミドNAH7の受容の可否に影響を及ぼす受容菌Pseudomonas resinovoransゲノム上の遺伝子の解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 李美英，高橋裕里香，松井一泰，新谷政己，岡田憲典，野尻秀昭
  • 学会等名: 日本農芸化学会2014年度大会
  • 発表場所: 明治大学生田キャンパス（神奈川県）
• [学会発表] プラスミドpCAR1にコードされる核様体タンパク質が接合伝達に与える影響の解明 (2014)
  • 著者名/発表者名: 松井一泰，廣谷龍輔，武田俊春，尹忠銖，新谷政己，岡田憲典，野尻秀昭
  • 学会等名: 日本農芸化学会2014年度大会
  • 発表場所: 明治大学生田キャンパス（神奈川県）
• [学会発表] 遺伝因子を介した微生物のコミュニケーション (2013)
  • 著者名/発表者名: 新谷政己
  • 学会等名: 第44回中部化学関係学協会支部連合秋季大会
  • 発表場所: 静岡大学浜松キャンパス（静岡県）
  • 招待講演
• [学会発表] IncP-7群プラスミドpCAR1の接合伝達に関与するORF145およびORF146の機能解析 (2013)
  • 著者名/発表者名: 新谷政己，徳丸裕樹，金原和秀，野尻秀昭
  • 学会等名: 日本農芸化学会2013年度大会
  • 発表場所: 東北大学（宮城県）
• [学会発表] 複合微生物系におけるプラスミド・トランスポゾンの挙動解析
  • 著者名/発表者名: 新谷政己
  • 学会等名: 第1回先端科学合同セミナー
  • 発表場所: 琵琶湖コンファレンスセンター（滋賀県）
• [備考] 金原・新谷研究室
  • URL: http://163.43.139.71/~tmshint/
• [備考] 静岡大学教員データベース
  • URL: https://tdb.shizuoka.ac.jp/RDB/public/Default2.aspx?id=11068&l=0
• [備考] 静岡大学教員データベース
  • URL: https://tdb.shizuoka.ac.jp/RDB/public/Default2.aspx?id=11068&l=0
• [備考] 金原・新谷研究室ホームページ
  • URL: http://163.43.139.71/~tmshint/
• [備考] 金原・新谷研究室ホームページ
  • URL: http://163.43.139.71/~tmshint/