ピロリ菌型メナキノン生合成経路酵素群の立体構造解析及び反応機構解明

• 研究課題/領域番号: 24780097
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 基金
• 研究分野: 応用生物化学
• 研究機関: 信州大学
• 研究代表者: 新井 亮一 信州大学, 学術研究院繊維学系, 助教 (50344023)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2014年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2013年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2012年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円)
• キーワード: メナキノン / ビタミンK / 生合成 / 酵素反応機構 / X線結晶構造解析 / MqnD / 高度好熱菌 / ピロリ菌 / DHNA synthase / 結晶中酵素反応 / 酵素 / 反応機構 / 構造生物学 / 酵素化学 / Ｘ線結晶構造解析

研究成果の概要

近年、放線菌や高度好熱菌、ピロリ菌等において新たなメナキノン(ビタミンK2)生合成経路が発見された。そこで、本研究では新規メナキノン生合成経路に関わる酵素の反応機構解明を目的としてX線結晶構造解析による立体構造解析を実施した。まず、高度好熱菌由来 MqnDと生成物や生成物類似体との複合体結晶、次に、MqnD(H145A)変異体と基質cDHFLとの複合体結晶のX線結晶構造解析を行った。その結果、最高1.5Å分解能での立体構造解析に成功し、基質や生成物の認識機構、活性部位残基の同定や詳細構造の解明等により、新規メナキノン生合成経路に関わる酵素の反応機構解明につながる十分な成果が得られた。

研究成果

• [国際共同研究] プリンストン大学(米国)
• [雑誌論文] 二量体形成新規人工タンパク質を用いたタンパク質ナノブロック開発による自己組織化ナノ構造複合体の創製 (2016)
  • 著者名/発表者名: 小林 直也、新井 亮一
  • 雑誌名: 分子研レターズ 巻: 73 ページ: 30-31
  • オープンアクセス
• [雑誌論文] 人工タンパク質で「かたち」をつくろう―ブロック遊びしようよ！― (2016)
  • 著者名/発表者名: 小林 直也、新井 亮一
  • 雑誌名: 生物工学会誌 巻: 94
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Expression, purification, crystallization and X-ray diffraction analysis of ChiL, a chitinase from Chitiniphilus shinanonensis (2015)
  • 著者名/発表者名: Miruku Ueda, Makoto Shimosaka, Ryoichi Arai
  • 雑誌名: Acta Crystallographica Section F 巻: 71 号: 12 ページ: 1516-1520
  • DOI: 10.1107/s2053230x15022001
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Self-Assembling Nano-Architectures Created from a Protein Nano-Building Block Using an Intermolecularly Folded Dimeric de Novo Protein. (2015)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi N, Yanase K, Sato T, Unzai S, Hecht MH, Arai R.
  • 雑誌名: J Am Chem Soc. 巻: 137 号: 35 ページ: 11285-11293
  • DOI: 10.1021/jacs.5b03593
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Crystal structure of glycine oxidase from Geobacillus kaustophilus (2015)
  • 著者名/発表者名: Takako Shiono, Takaomi Nomura1, Yoshiaki Nishiya, Ryoichi Arai
  • 雑誌名: Photon Factory Activity Report (2014) 巻: 32 ページ: 204-204
  • オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Crystal Structure of Fab Fragment of an Anti-Osteocalcin C-Terminal Peptide Antibody KTM219 (2015)
  • 著者名/発表者名: Misaki Komatsu, Jinhua Dong, Hiroshi Ueda, and Ryoichi Arai
  • 雑誌名: Photon Factory Activity Report (2014) 巻: 32(B) ページ: 205-205
  • オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Crystal Structure of ChiL, a Chitinase from Chitiniphilus shinanonensis (2015)
  • 著者名/発表者名: Miruku Ueda, Makoto Shimosaka, Ryoichi Arai
  • 雑誌名: Photon Factory Activity Report (2014) 巻: 32(B) ページ: 206-206
  • オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Molecular cloning, gene expression analysis, and recombinant protein expression of novel silk proteins from larvae of a retreat-maker caddisfly, Stenopsyche marmorata (2015)
  • 著者名/発表者名: Xue Bai, Mayo Sakaguchi, Yuko Yamaguchi, Shiori Ishihara, Masuhiro Tsukada, Kimio Hirabayashi, Kousaku Ohkawa, Takaomi Nomura, Ryoichi Arai
  • 雑誌名: Biochemical and Biophysical Research Communications 巻: 464 号: 3 ページ: 814-819
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2015.07.041
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Crystal structure of glycine oxidase from Bacillus thuringiensis (2015)
  • 著者名/発表者名: Sakura Ohishi, Takako Shiono, Yoshiaki Nishiya, Takaomi Nomura, Ryoichi Arai
  • 雑誌名: Photon Factory Activity Report 巻: 31
  • 謝辞記載あり
• [雑誌論文] バイナリーパターンデザインによるデノボタンパク質WA20のドメインスワップ二量体構造 (2013)
  • 著者名/発表者名: 小林直也，新井亮一
  • 雑誌名: 酵素工学研究会誌 巻: 69 ページ: 19-25
• [雑誌論文] Recognition Model of a Uracil Residue in DNA by AP Endonuclease from Methanothermobacter thermautotrophicus (2013)
  • 著者名/発表者名: Tabata, N., Kodera ,T., Arai, R and Shida, T.
  • 雑誌名: Photon Factory Activity Report 巻: 30 ページ: 287-287
• [雑誌論文] Domain-swapped dimeric structure of a stable and functional de novo 4-helix bundle protein, WA20 (2012)
  • 著者名/発表者名: Ryoichi Arai, Naoya Kobayashi, Akiho Kimura, Takaaki Sato, Kyoko Matsuo, Anna F.Wang, Jesse M.Platt, Luke H.Bradley, Michael H.Hecht
  • 雑誌名: The Journal of Physical Chemistry B 巻: (in press) 号: 23 ページ: 6789-6797
  • DOI: 10.1021/jp212438h
  • 査読あり
• [雑誌論文] Solution structure of IseA, an inhibitor protein of DL-endopeptidases from Bacillus subtilis, reveals a novel fold with a characteristic inhibitory loop (2012)
  • 著者名/発表者名: Arai, R., S. Fukui, N. Kobayashi, and J. Sekiguchi
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: 287(53) 号: 53 ページ: 44736-44748
  • DOI: 10.1074/jbc.m112.414763
  • NAID: 120007104195
  • 査読あり
• [学会発表] 人工蛋白質ナノブロック(PN-Block)による自己組織化ナノ構造創製：“ネオバイオ分子”創出へ向けて (2016)
  • 著者名/発表者名: 小林直也、木村尚弥、新井亮一
  • 学会等名: 第16回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡県福岡市）
  • 年月日: 2016-06-09
  • 招待講演
• [学会発表] 超安定化二量 体人工蛋白質Super WA20 (SUWA)の安定化機構解析と蛋白質ナノブロックへの応用 (2016)
  • 著者名/発表者名: 木村尚弥、小林直也、新井亮一
  • 学会等名: 第16回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡県福岡市）
  • 年月日: 2016-06-08
• [学会発表] 抗オステオカルシンC末端ペプチド抗体KTM219 Fab断片のX線結晶構造解析： Q-body作動原理の理解へ向けて (2016)
  • 著者名/発表者名: 小松 美沙紀、董 金華、上田 宏、新井 亮一
  • 学会等名: 第16回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場（福岡県福岡市）
  • 年月日: 2016-06-07
• [学会発表] 二量体形成新規人工タンパク質を用いた蛋白質ナノブロック(PN-Block)による自己組織化ナノ構造複合体の創製 (2016)
  • 著者名/発表者名: 小林直也、新井亮一
  • 学会等名: PF研究会「徹底討論！小角散乱の魅力～基礎・応用・産業利用」
  • 発表場所: 高エネルギー加速器研究機構（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2016-03-31
  • 招待講演
• [学会発表] 超安定化二量体人工タンパク質Super WA20 (SUWA)の創製 (2016)
  • 著者名/発表者名: 木村尚弥、小林直也、新井亮一
  • 学会等名: PF研究会「徹底討論！小角散乱の魅力～基礎・応用・産業利用」
  • 発表場所: 高エネルギー加速器研究機構（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2016-03-30
• [学会発表] 人工蛋白質ナノブロックによる自己組織化ナノ構造複合体の創製 (2016)
  • 著者名/発表者名: 小林直也、柳瀬慶一，佐藤高彰，雲財悟，Michael H. Hecht，新井亮一
  • 学会等名: 蛋白研セミナー「構造を基盤とする蛋白質科学における未解決問題」
  • 発表場所: 東京大学先端科学技術研究センター（東京都目黒区）
  • 年月日: 2016-03-01
• [学会発表] 超安定化二量体デノボ人工タンパク質Super WA20の創製 (2016)
  • 著者名/発表者名: 木村尚弥、小林直也、新井亮一
  • 学会等名: 蛋白研セミナー「構造を基盤とする蛋白質科学における未解決問題」
  • 発表場所: 東京大学先端科学技術研究センター（東京都目黒区）
  • 年月日: 2016-03-01
• [学会発表] 分子間フォールディング二量体超安定化人工タンパク質Super WA20 (SUWA) の創製 (2015)
  • 著者名/発表者名: 木村尚弥、小林直也、新井亮一
  • 学会等名: BMB2015(第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会・合同大会)
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-02
• [学会発表] 抗オステオカルシンC末端ペプチド抗体KTM219のFab断片のX線結晶構造解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小松 美沙紀、董 金華、上田 宏、新井 亮一
  • 学会等名: BMB2015(第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会・合同大会)
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-02
• [学会発表] キチン分解細菌Chitiniphilus shinanonensis由来キチン分解酵素ChiLの立体構造解析及び反応機構解明 (2015)
  • 著者名/発表者名: 植田みるく, 下坂誠, 新井亮一
  • 学会等名: BMB2015(第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会・合同大会)
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-02
• [学会発表] 人工蛋白質ナノブロック(PN-Block)による自己組織化ナノ構造複合体の創出 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小林直也、木村尚弥、新井亮一
  • 学会等名: BMB2015(第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会・合同大会)
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
  • 招待講演
• [学会発表] ナノ構造複合体のスマートプロテインデザイン：人工設計蛋白質を用いた蛋白質ナノブロックの開発及び超安定化 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小林直也、木村尚弥、新井亮一
  • 学会等名: 第６７回日本生物工学会大会
  • 発表場所: 城山観光ホテル（鹿児島県鹿児島市）
  • 年月日: 2015-10-28
  • 招待講演
• [学会発表] キチン分解細菌Chitiniphilus shinanonensis由来キチン分解酵素ChiLの立体構造解析及び酵素反応 (2015)
  • 著者名/発表者名: 植田みるく, 下坂誠, 新井亮一
  • 学会等名: 第６７回日本生物工学会大会
  • 発表場所: 城山観光ホテル（鹿児島県鹿児島市）
  • 年月日: 2015-10-26
• [学会発表] メナキノン生合成系酵素MqnD の基質複合体及び生成物複合体の立体構造解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 新井亮一, 小松美沙紀，池田早希，松尾京子，大利 徹
  • 学会等名: 酵素工学研究会第74回講演会
  • 発表場所: 東京大学山上会館（東京都文京区）
  • 年月日: 2015-10-16
• [学会発表] 分子間フォールディング二量体超安定化人工タンパク質Super WA20 (SUWA) の創製 (2015)
  • 著者名/発表者名: 木村尚弥、小林直也、新井亮一
  • 学会等名: 酵素工学研究会第74回講演会
  • 発表場所: 東京大学山上会館（東京都文京区）
  • 年月日: 2015-10-16
• [学会発表] 人工タンパク質ナノブロックによるナノ構造複合体の創出及び解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 新井亮一
  • 学会等名: 第7回生体分子相互作用解析フォーラムワークショップ
  • 発表場所: 昭光通商（株）本社（東京都港区）
  • 年月日: 2015-08-27
  • 招待講演
• [学会発表] ファージディスプレイ法と次世代シーケンサーを利用した mSin3 PAH1 ドメイン結合天然変性領域ペプチドの網羅的配列探索・解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 半田雅憲，寺西弘志，西村善文，新井亮一
  • 学会等名: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • 年月日: 2015-06-26
• [学会発表] ドメインスワップ二量体人工蛋白質を用いた蛋白質ナノブロックによる人工蛋白質複合体の創出 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小林直也，新井亮一
  • 学会等名: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • 年月日: 2015-06-26
  • 招待講演
• [学会発表] 超安定化ドメインスワップ二量体人工タンパク質Super WA20 (SUWA) の創製 (2015)
  • 著者名/発表者名: 木村尚弥、小林直也、古賀（巽）理恵、古賀信康、新井亮一
  • 学会等名: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • 年月日: 2015-06-25
• [学会発表] ドメインスワップ人工蛋白質タンデムWA20 による自己組織的ナノ構造複合体の創製と解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 稲野紘一、小林直也、古賀（巽）理恵、古賀信康、Michael H. Hecht、佐藤高彰、新井亮一
  • 学会等名: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • 年月日: 2015-06-25
• [学会発表] 小角X 線溶液散乱法によるユビキチン分子の静的構造及び重合過程の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 稲野紘一、小林直也、新井亮一、佐藤高彰
  • 学会等名: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • 年月日: 2015-06-24
• [学会発表] キチン分解細菌Chitiniphilus shinanonensis由来キチン分解酵素ChiLのＸ線結晶構造解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 植田みるく, 下坂誠, 新井亮一
  • 学会等名: 第15回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • 年月日: 2015-06-24
• [学会発表] ファージディスプレイ法と次世代シーケンサーを利用したmSin3 PAH1ドメイン結合天然変性領域ペプチドの網羅的配列探索・解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 半田雅憲，寺西弘志，西村善文，新井亮一
  • 学会等名: 第79回日本生化学会中部支部例会
  • 発表場所: 信州大学松本キャンパス（長野県松本市）
  • 年月日: 2015-05-23
• [学会発表] ドメインスワップ二量体人工蛋白質WA20を利用した蛋白質ナノブロックによる人工蛋白質複合体構造の創製 (2015)
  • 著者名/発表者名: 小林直也，柳瀬慶一，佐藤高彰，Michael H. Hecht，新井亮一
  • 学会等名: 第79回日本生化学会中部支部例会
  • 発表場所: 信州大学松本キャンパス（長野県松本市）
  • 年月日: 2015-05-23
• [学会発表] ドメインスワップ人工蛋白質タンデムWA20による自己組織的ナノ構造複合体の創製と解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 稲野紘一、小林直也、古賀（巽）理恵、古賀信康、Michael H. Hecht、佐藤高彰、新井亮一
  • 学会等名: 第79回日本生化学会中部支部例会
  • 発表場所: 信州大学松本キャンパス（長野県松本市）
  • 年月日: 2015-05-23
• [学会発表] 超安定化ドメインスワップ二量体人工タンパク質Super WA20 (SUWA)の創製 (2015)
  • 著者名/発表者名: 木村尚弥、小林直也、古賀（巽）理恵、古賀信康、新井亮一
  • 学会等名: 第79回日本生化学会中部支部例会
  • 発表場所: 信州大学松本キャンパス（長野県松本市）
  • 年月日: 2015-05-23
• [学会発表] キチン分解細菌Chitiniphilus shinanonensis由来キチン分解酵素ChiLのＸ線結晶構造解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 植田みるく, 下坂誠, 新井亮一
  • 学会等名: 第79回日本生化学会中部支部例会
  • 発表場所: 信州大学松本キャンパス（長野県松本市）
  • 年月日: 2015-05-23
• [学会発表] 配列パターンデザインによる新規人工設計タンパク質の半合理的創製と構造解析およびナノ構造構築への応用 (2015)
  • 著者名/発表者名: 新井亮一
  • 学会等名: 酵素工学研究会第73回講演会
  • 発表場所: 大阪府立大学I-siteなんば（大阪府大阪市）
  • 年月日: 2015-04-24
  • 招待講演
• [学会発表] 配列パターンデザインによる人工蛋白質・ペプチドの創出と応用 (2014)
  • 著者名/発表者名: 新井 亮一
  • 学会等名: 信州大学農学部バイオサイエンス若手研究会第４回シンポジウム
  • 発表場所: 信州大学農学部（長野県南箕輪村）
  • 年月日: 2014-12-17
  • 招待講演
• [学会発表] ヒゲナガカワトビケラ由来新規シルク蛋白質及び関連蛋白質の同定、解析、発現系構築 (2014)
  • 著者名/発表者名: 坂口真代、Xue Bai、山口裕子、野村隆臣、大川浩作、石川えり、塚田益裕、平林公男、新井亮一
  • 学会等名: 信州大学農学部バイオサイエンス若手研究会第４回シンポジウム
  • 発表場所: 信州大学農学部（長野県南箕輪村）
  • 年月日: 2014-12-17
• [学会発表] ドメインスワップ二量体人工タンパク質を利用した蛋白質ナノブロックによる自己組織化ナノ構造の創製 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小林直也，柳瀬慶一，佐藤高彰，Michael H. Hecht，新井亮一
  • 学会等名: 信州大学農学部バイオサイエンス若手研究会第４回シンポジウム
  • 発表場所: 信州大学農学部（長野県南箕輪村）
  • 年月日: 2014-12-17
• [学会発表] パターンデザインペプチドライブラリーを利用した天然変性蛋白質ターゲット分子高親和性ペプチドの開発と相互作用解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 半田雅憲，寺西弘志，西村善文，新井亮一
  • 学会等名: 信州大学農学部バイオサイエンス若手研究会第４回シンポジウム
  • 発表場所: 信州大学農学部（長野県南箕輪村）
  • 年月日: 2014-12-17
• [学会発表] メナキノン生合成系酵素MqnD の基質複合体及び生成物複合体の立体構造解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小松美沙紀，池田早希，松尾京子，大利 徹，新井亮一
  • 学会等名: 信州大学農学部バイオサイエンス若手研究会第４回シンポジウム
  • 発表場所: 信州大学農学部（長野県南箕輪村）
  • 年月日: 2014-12-17
• [学会発表] 高度好熱菌由来メナキノン生合成酵素MqnD-基質・生成物複合体のX線結晶構造解析および酵素反応機構 (2014)
  • 著者名/発表者名: 新井 亮一、池田 早希、小松 美沙紀、松尾 京子、大利 徹
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] パターンデザインペプチドライブラリーを利用した天然変性領域ターゲット分子高親和性ペプチドのデザインと相互作用解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 半田 雅憲、寺西 弘志、高野 光則、西村 善文、新井亮一
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] デノボタンパク質WA20を利用したナノブロックによる自己組織化ナノ構造の創製 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小林 直也、柳瀬慶一、佐藤高彰、Michael H. Hecht、新井亮一
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] ヒゲナガカワトビケラ由来新規シルク蛋白質及び関連蛋白質の同定・解析および発現系構築 (2014)
  • 著者名/発表者名: 坂口真代、白雪、山口裕子、志水誠、石原詩織、野村隆臣、大川浩作、石川えり、阿部康次、塚田益裕、平林公男、新井亮一
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] グリシンオキシダーゼの基質阻害様式に関する研究 (2014)
  • 著者名/発表者名: 塩野 貴子、鈴村 菖、西矢 芳昭、新井 亮一、野村 隆臣
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] 小角X線散乱法による溶液中におけるユビキチンの静的構造解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 稲野 紘一、柳瀬 慶一、小林 直也、新井 亮一、佐藤高彰
  • 学会等名: 第37回日本分子生物学会年会
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜市）
  • 年月日: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [学会発表] ドメインスワップ二量体人工蛋白質WA20を利用したタンパク質ナノブロックによる自己組織化ナノ構造の創製 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小林 直也、柳瀬慶一、佐藤高彰、Michael H. Hecht、新井亮一
  • 学会等名: 「細胞を創る」研究会7.0
  • 発表場所: 東京大学（東京都）
  • 年月日: 2014-11-13 – 2014-11-14
• [学会発表] パターンデザインペプチドライブラリーを利用した、ターゲットタンパク質結合ペプチドの探索・獲得及び変異体デザイン (2014)
  • 著者名/発表者名: 半田 雅憲、寺西 弘志、西村 善文、新井亮一
  • 学会等名: 日本生物高分子学会2014年度大会
  • 発表場所: 信州大学繊維学部（長野県上田市）
  • 年月日: 2014-09-12 – 2014-09-13
• [学会発表] Glycine oxidaseの基質阻害に関する構造基盤 (2014)
  • 著者名/発表者名: 塩野 貴子、西矢 芳昭、新井 亮一、野村 隆臣
  • 学会等名: 日本生物高分子学会2014年度大会
  • 発表場所: 信州大学繊維学部（長野県上田市）
  • 年月日: 2014-09-12 – 2014-09-13
• [学会発表] 高度好熱菌由来メナキノン生合成酵素MqnD-基質(cDHFL)複合体のX線結晶構造解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 新井 亮一、池田 早希、小松 美沙紀、松尾 京子、大利 徹
  • 学会等名: 第8回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 岡山大学（岡山市）
  • 年月日: 2014-09-11 – 2014-09-13
• [学会発表] デノボタンパク質WA20を利用したナノブロックによる自己組織化ナノ構造の創製 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小林 直也、柳瀬慶一、佐藤高彰、Michael H. Hecht、新井亮一
  • 学会等名: 第8回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 岡山大学（岡山市）
  • 年月日: 2014-09-11 – 2014-09-13
• [学会発表] 配列パターンデザインライブラリーとファージディスプレイを用いたmSin3 PAH1ドメイン結合ペプチド配列の探索, 変異体デザイン, 及びBiacoreによる相互作用解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 半田 雅憲、寺西 弘志、西村 善文、新井亮一
  • 学会等名: GE Life Sciences Day 2014
  • 発表場所: パシフィコ横浜（横浜市）
  • 年月日: 2014-08-01
• [学会発表] 配列パターンデザインによるデノボ蛋白質の半合理的創製とその応用 (2014)
  • 著者名/発表者名: 新井亮一
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: ワークピア横浜（横浜市）
  • 年月日: 2014-06-25 – 2014-06-27
  • 招待講演
• [学会発表] Geobacillus kaustophilus由来Glycine oxidaseのＸ線結晶構造解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 塩野 貴子、新井 亮一、西矢 芳昭、野村 隆臣
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 横浜産貿ホール（横浜市）
  • 年月日: 2014-06-25 – 2014-06-27
• [学会発表] デノボタンパク質WA20を利用したナノブロックによる自己組織化ナノ構造の創製 (2014)
  • 著者名/発表者名: 小林 直也、柳瀬慶一、佐藤高彰、Michael H. Hecht、新井亮一
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 横浜産貿ホール（横浜市）
  • 年月日: 2014-06-25 – 2014-06-27
• [学会発表] 配列パターンデザインとファージディスプレイを用いたPAH1結合天然変性領域配列の探索・変異体デザインおよびSPRセンサーによる相互作用解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 半田 雅憲、寺西 弘志、高野 光則、西村 善文、新井亮一
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 横浜産貿ホール（横浜市）
  • 年月日: 2014-06-25 – 2014-06-27
• [学会発表] ヒゲナガカワトビケラ由来新規シルク蛋白質及び関連蛋白質の網羅的同定と解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 白雪、山口裕子、野村隆臣、大川浩作、石川えり、塚田益裕、阿部康次、平林公男、新井亮一
  • 学会等名: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 横浜産貿ホール（横浜市）
  • 年月日: 2014-06-25 – 2014-06-27
• [学会発表] Solution structure of IseA, an inhibitor protein of DL-endopeptidases from Bacillus subtilis, reveals a novel fold with a characteristic inhibitory loop (2013)
  • 著者名/発表者名: Arai, R., Fukui, S., Kobayashi, N. and Sekiguchi, J.
  • 学会等名: International Conference on Structural Genomics 2013 (ICSG2013-SLS)
  • 発表場所: 京王プラザホテル札幌（札幌）
• [学会発表] Structural and functional analyses of binary pattern designed de novo proteins (2013)
  • 著者名/発表者名: Arai, R. Kobayashi, N., Fukuda, S., Kurasawa, S. and Hecht, M. H.
  • 学会等名: Enzyme Engineering XXII
  • 発表場所: 富山国際会議場（富山）
• [学会発表] 小林直也、福井貞晴、新井亮一、関口順一 (2013)
  • 著者名/発表者名: 枯草菌細胞壁溶解酵素阻害タンパク質IseAの立体構造解析：特徴的な阻害ループを持つ“弓鋸型”新奇構造の解明
  • 学会等名: 第13回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: とりぎん文化会館（鳥取）
• [学会発表] 新規人工設計タンパク質WA20のドメインスワップ二量体構造及びそのタンデム化応用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 小林直也, Michael H. Hecht, 新井亮一
  • 学会等名: 「細胞を創る」研究会 5.0
  • 発表場所: 東京工業大学（横浜）
• [学会発表] Crystal structures of MqnD, a menaquinone biosynthetic enzyme from Thermus thermophilus, complexed with the product, 1,4-dihydroxy-6-naphthoate, and its analogs
  • 著者名/発表者名: 新井 亮一, 松尾 京子, 大利 徹
  • 学会等名: 第3回モデル生物丸ごと一匹学会
  • 発表場所: 大阪大学（大阪）
• [学会発表] dUエンドヌクレアーゼ活性を併せ持つ好熱メタン古細菌AP エンドヌクレアーゼの基質認識メカニズムに関する研究
  • 著者名/発表者名: 志田 敏夫、田畑 直希、三浦 圭織、新井 亮一
  • 学会等名: 第13回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: とりぎん文化会館（鳥取）
• [学会発表] A De Novo Heme Protein, Dnhps1, Created from a 5-Amino Acid Alphabet
  • 著者名/発表者名: Fukuda, S., Kurasawa, S., and Arai, R.
  • 学会等名: 27th Annual Symposium of The Protein Society
  • 発表場所: Boston Marriott Copley Place, Boston, MA, USA
• [学会発表] Construction and characterization of tandem WA20 domain-swapped de novo proteins with various linkers
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, N., Hecht, M.H., and Arai, R.
  • 学会等名: 27th Annual Symposium of The Protein Society
  • 発表場所: Boston Marriott Copley Place, Boston, MA, USA
• [学会発表] Molecular cloning of novel silk proteins from larvae of caddisfly, Stenopsyche marmorata.
  • 著者名/発表者名: X. Bai, K. Ohkawa, T.Nomura, S. Ishihara, Y. Yamaguchi, M. Tsukada, K. Abe, K. Hirabayashi, R. Arai
  • 学会等名: The 8th China International Silk Conference
  • 発表場所: 蘇州大学 (Suzhou, China)
• [学会発表] ヒゲナガカワトビケラ由来新規シルク関連タンパク質の同定及び解析
  • 著者名/発表者名: 白雪、山口裕子、志水誠、石原詩織、野村隆臣、大川浩作、石川えり、塚田益裕、阿部康次、平林公男、新井亮一
  • 学会等名: 2013年度日本生物工学会大会
  • 発表場所: 広島国際会議場（広島）
• [学会発表] 配列パターンデザインによるデノボ蛋白質の半合理的創製とその応用
  • 著者名/発表者名: 新井 亮一
  • 学会等名: 大阪大学蛋白質研究所セミナー「蛋白質の機能デザインに向けた実験と理論のインタープレー」
  • 発表場所: 大阪大学（大阪）
  • 招待講演
• [学会発表] ドメインスワップ新規人工タンパク質WA20 のタンデム化とその特性
  • 著者名/発表者名: 小林直也, Michael H. Hecht, 新井亮一
  • 学会等名: 第12回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場（名古屋）
• [学会発表] 枯草菌細胞壁溶解酵素阻害タンパク質IseAの立体構造解析：特徴的な阻害ループを持つ弓鋸型新奇 構造の解明
  • 著者名/発表者名: 福井貞晴、新井亮一、小林直也、関口順一
  • 学会等名: 第50回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 名古屋大学（名古屋）
• [学会発表] 枯草菌細胞壁溶解酵素阻害タンパク質IseAの立体構造解析：特徴的な阻害ループを持つ弓鋸型新奇 構造の解明
  • 著者名/発表者名: 新井亮一、福井貞晴、小林直也、関口順一
  • 学会等名: 第64回日本生物工会大会
  • 発表場所: 神戸国際会議場（神戸）
• [学会発表] Domain-Swapped Dimeric Structure of a Stable and Functional De Novo Four-Helix Bundle Protein WA20, and its Potential Application
  • 著者名/発表者名: Arai, R., Kobayashi, N., Kimura, A., Sato, T. and Hecht, M. H.
  • 学会等名: The 18th Symposium of Young Asian Biochemical Engineers' Community (YABEC2012)
  • 発表場所: 徳島大学（徳島）
• [学会発表] 新規メナキノン生合成経路酵素MqnDの生成物・類似体複合体のX線結晶構造解析
  • 著者名/発表者名: 松尾 京子, 石北 央, 大利 徹, 新井 亮一
  • 学会等名: 日本農芸化学会2013年度大会
  • 発表場所: 東北大学（仙台）
• [学会発表] Arai, R., Matsuo, K. and Dairi, T.
  • 著者名/発表者名: Crystal structures of MqnD, a menaquinone biosynthetic enzyme, complexed with the product, 1,4-dihydroxy-6-naphthoate, and its analogs
  • 学会等名: 4th International Symposium on Diffraction Structural Biology (ISDSB 2013)
  • 発表場所: 名古屋市中小企業振興会館（名古屋）
• [備考] 新井亮一研究室ホームページ
  • URL: http://fiber.shinshu-u.ac.jp/arai/index.html
• [備考] 生物資源・環境科学課程 新井亮一 助教が酵素工学奨励賞を受賞
  • URL: http://www.shinshu-u.ac.jp/faculty/textiles/news/2015/04/62170.html
• [備考] 信州大学繊維学部 研究成果プレスリリース
  • URL: http://www.shinshu-u.ac.jp/faculty/textiles/news/2012/12/50284.html
• [産業財産権] ドメインスワップ二量体人工タンパク質 (2015)
  • 発明者名: 新井亮一、木村尚弥、小林直也
  • 権利者名: 信州大学
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2015-103357
  • 出願年月日: 2015-05-21