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新規なL-アミノ酸脱水素酵素の機能と立体構造解析に基づく抗トリパノソーマ薬の開発

研究課題

研究課題/領域番号 24780105
研究種目

若手研究(B)

配分区分基金
研究分野 応用生物化学
研究機関東海大学

研究代表者

米田 一成  東海大学, 農学部, 講師 (00469397)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2014-03-31
研究課題ステータス 完了 (2013年度)
配分額 *注記
4,160千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 960千円)
2013年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2012年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワード酵素化学 / L-スレオニン酸脱水素酵素 / NAD / トリパノソーマ / クローニング / 結晶化 / 脱水素酵素 / L-スレオニン
研究概要

病原性寄生原虫であるトリパノソーマのゲノム情報からL-スレオニン脱水素酵素(ThrDH)遺伝子を見出し、オーバーラップオリゴヌクレオチド用いて遺伝子合成を行った。合成したThrDH遺伝子をpCold TFベクターに挿入し、大腸菌を用いてIPTGによる遺伝子の発現を行い、発現産物の精製、及び機能解析を行った。その結果、SDS-PAGEで予測される分子量である81 KDaにバンドの検出に成功した。さらに、酵素活性の確認を行った結果、わずかではあるが、NAD依存性ThrDH活性の検出に成功した。

報告書

(3件)
  • 2013 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2012 実施状況報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて 2013 2012 その他

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 10件) 学会発表 (12件) (うち招待講演 2件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of L-serine 3-dehydrogenase complexed with NADP^+ from the hyperthermophilic archaeon Pyrobaculum calidifontis2013

    • 著者名/発表者名
      Yoneda K, Sakuraba H, Araki T, Shibata T, Nikki T, Ohshima T
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section F

      巻: Vol. 69 ページ: 134-136

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray analysis of L-serine 3-dehydrogenase complexed with NADP+ from the hyperthermophilic archaeon Pyrobaculum calidifontis,2013

    • 著者名/発表者名
      Yoneda, K., Sakuraba, H., Araki, T., Shibata, T., Nikki, T. & Ohshima, T.
    • 雑誌名

      Acta Cryst.

      巻: F69 号: 2 ページ: 134-136

    • DOI

      10.1107/s1744309112051391

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal Structure of the binary and ternary complexes of an archaeal UDP-galactose 4-epimerase-like L-threonine dehydrogenase from Thermoplasma volcanium2012

    • 著者名/発表者名
      Yoneda K, Sakuraba H, Araki T, Ohshima T
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: Vol. 287 ページ: 12966-12974

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Expression, purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of NAD(P)H-dependent carbonyl reductase specifically expressed in the thyroidectomized chicken fatty liver2012

    • 著者名/発表者名
      Yoneda K, Fukuda Y, Shibata T, Araki T, Nikki T, Sakuraba H, Ohshima T
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section F

      巻: Vol. 68 ページ: 1568-1570

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal Structure of Novel Dye-linked L-Proline Dehydrogenase from Hyperthermophilic Archaeon Aeropyrum pernix2012

    • 著者名/発表者名
      Sakuraba H, Satomura T, Kawakami R, Kim K, Hara Y, Yoneda K, Ohshima T
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: Vol. 287 ページ: 20070-20080

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of a UDP-glucose dehydrogenase from the hyperthermophilic archaeon Pyrobaculum islandicum2012

    • 著者名/発表者名
      Sakuraba H, Kawai T, Yoneda K, Ohshima T
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section

      巻: Vol. 68 ページ: 1003-1007

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal Structure of Binary and Ternary Complexes of Archaeal UDP-galactose 4-Epimerase-like L-Threonine Dehydrogenase from Thermoplasma volcanium.2012

    • 著者名/発表者名
      K.Yoneda
    • 雑誌名

      The Journal of Biological Chemistry

      巻: VOL. 287 号: 16 ページ: 12966-12974

    • DOI

      10.1074/jbc.m111.336958

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Expression, purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of NAD(P)H-dependent carbonyl reductase specifically expressed in thyroidectomized chicken fatty liver2012

    • 著者名/発表者名
      Kazunari Yoneda, Yudai Fukuda, Takeshi Shibata, Tomohiro Araki, Takahiro Nikki, Haruhiko Sakurba, Toshihisa Ohshima
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica

      巻: F68 号: 12 ページ: 1568-1570

    • DOI

      10.1107/s1744309112046453

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal Structure of Novel Dye-linked L-Proline Dehydrogenase from Hyperthermophilic Archaeon Aeropyrum pernix2012

    • 著者名/発表者名
      Haruhiko Sakuraba, Takenori Satomura, Ryushi Kawakami, Kwang Kim, Yusuke Hara, Kazunari Yoneda, Toshihisa Ohshima
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: 287 号: 24 ページ: 20070-20080

    • DOI

      10.1074/jbc.m111.319038

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of a UDP-glucose dehydrogenase from the hyperthermophilic archaeon Pyrobaculum islandicum2012

    • 著者名/発表者名
      Sakuraba H., Kawai T., Yoneda K., Ohshima T.
    • 雑誌名

      Acta Cryst

      巻: F68 号: 9 ページ: 1003-1007

    • DOI

      10.1107/s1744309112030667

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] トリパノソーマ由来NAD依存性L-スレオニン脱水素酵素の性質と構造2013

    • 著者名/発表者名
      米田一成、櫻庭春彦、荒木朊洋、大島敏久
    • 学会等名
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      とりぎん文化会館
    • 年月日
      2013-06-12
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] トリパノソーマ由来NAD依存性L-スレオニン脱水素酵素の機能解析2013

    • 著者名/発表者名
      米田一成、櫻庭春彦、荒木朊洋、大島敏久
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年度大会
    • 発表場所
      東北大学
    • 年月日
      2013-03-25
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [学会発表] 新規な補酵素NAD(P)依存性L-スレオニン脱水素酵素の機能と構造解析2013

    • 著者名/発表者名
      米田一成
    • 学会等名
      第1回佐賀大学総合分析実験センターシンポジウム
    • 発表場所
      佐賀大学
    • 年月日
      2013-03-18
    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] トリパノソーマ由来NAD依存性L-スレオニン脱水素酵素の性質と構造

    • 著者名/発表者名
      米田一成、櫻庭 春彦、荒木 朋洋、大島 敏久
    • 学会等名
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      とりぎん文化会館(鳥取県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ニワトリ脂肪肝で特異的に発現するNAD(P)H依存性carbonyl redactaseの性質と構造

    • 著者名/発表者名
      曽根孟起、福田雄大, 荒木朋洋, 櫻庭春彦, 大島敏久, 米田 一成
    • 学会等名
      日本農芸化学会関西・中四国・西日本支部および日本ビタミン学会近畿・中国四国・九州沖縄地区合同大会
    • 発表場所
      県立広島大学(広島県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] ニワトリ脂肪肝で特異的に発現するNAD(P)H依存性carbonyl reductaseの分子特性

    • 著者名/発表者名
      福田雄大、荒木朋洋,仁木隆博,櫻庭春彦,大島敏久,芝田猛,米田一成
    • 学会等名
      日本農芸化学会関西・中四国・西日本支部および日本ビタミン学会近畿・中国四国・九州沖縄地区合同大会
    • 発表場所
      県立広島大学(広島県)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] 超好熱ア-キアPyrobaculum calidifontis由来NAD(P)依存性L-セリン 3-脱水素酵素の機能・構造解析

    • 著者名/発表者名
      米田一成、櫻庭 春彦、荒木 朋洋、大島 敏久
    • 学会等名
      日本農芸化学会2014年度大会
    • 発表場所
      明治大学(東京都)
    • 関連する報告書
      2013 実績報告書
  • [学会発表] トリパノソーマ由来NAD依存性L-スレオニン脱水素酵素の機能解析

    • 著者名/発表者名
      米田一成
    • 学会等名
      日本農芸化学会2013年度大会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] ニワトリ脂肪肝で特異的に発現する機能未知タンパク質の機能解析

    • 著者名/発表者名
      米田一成
    • 学会等名
      日本ビタミン学会第64回大会
    • 発表場所
      長良川国際会議場(岐阜県)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] ニワトリ脂肪肝で特異的に発現するNAD(P)H依存性carbonyl reductaseの機能解析

    • 著者名/発表者名
      福田雄大
    • 学会等名
      平成24年度日本農芸化学会西日本支部および日本栄養・食糧学会九州・沖縄支部合同大会
    • 発表場所
      鹿児島大学(鹿児島県)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] Crystal structure and application of hyperthermophilic lysine 6-dehydrogenase as an NAD-dependent amine dehydrogenase

    • 著者名/発表者名
      T. Ohshima
    • 学会等名
      12th Japan-China-Korea Joint Symposium on Enzyme Engineering
    • 発表場所
      金沢エクセルホテル東急(石川県)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
  • [学会発表] 新規な補酵素NAD(P)依存性L-スレオニン脱水素酵素の機能と構造解析

    • 著者名/発表者名
      米田一成
    • 学会等名
      第1回佐賀大学総合分析実験センターシンポジウム
    • 発表場所
      佐賀大学(佐賀県)
    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [備考]

    • URL

      http://www2.ktokai-u.ac.jp/~nougaku/Bio/yoneda/yoneda.htm

    • 関連する報告書
      2013 研究成果報告書
  • [備考] 生物化学研究室HP

    • URL

      http://www2.ktokai-u.ac.jp/~nougaku/Bio/yoneda/yoneda.htm

    • 関連する報告書
      2012 実施状況報告書

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公開日: 2013-05-31   更新日: 2019-07-29  

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